More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0913 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  61.3 
 
 
577 aa  708    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  52.97 
 
 
562 aa  635    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  53.9 
 
 
562 aa  659    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4886  alpha amylase catalytic region  61.77 
 
 
571 aa  667    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 
622 aa  1274    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31510  glycosidase  57.99 
 
 
596 aa  642    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.382371  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  63.19 
 
 
555 aa  646    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  58.35 
 
 
557 aa  640    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  64.67 
 
 
578 aa  754    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  51.61 
 
 
559 aa  629  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  52.2 
 
 
558 aa  627  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  52.54 
 
 
558 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  52.54 
 
 
558 aa  627  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  52.37 
 
 
558 aa  625  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  52.54 
 
 
558 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  52.2 
 
 
558 aa  628  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  52.54 
 
 
558 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  51.86 
 
 
558 aa  622  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  51.53 
 
 
558 aa  621  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  50.93 
 
 
558 aa  617  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  51.86 
 
 
557 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  51.34 
 
 
570 aa  590  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  48.82 
 
 
556 aa  573  1.0000000000000001e-162  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  49 
 
 
560 aa  572  1.0000000000000001e-162  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  51.72 
 
 
606 aa  569  1e-161  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  47.89 
 
 
563 aa  568  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1332  alpha amylase, catalytic domain protein  55.41 
 
 
639 aa  567  1e-160  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.86601 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  48.49 
 
 
560 aa  563  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  47.41 
 
 
563 aa  556  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  48.73 
 
 
563 aa  551  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  48.99 
 
 
556 aa  550  1e-155  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  47.8 
 
 
538 aa  548  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  45.59 
 
 
554 aa  543  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  45.76 
 
 
554 aa  538  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  45.76 
 
 
554 aa  536  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  45.76 
 
 
554 aa  536  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  45.87 
 
 
554 aa  536  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  45.76 
 
 
554 aa  536  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  45.76 
 
 
554 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  48.53 
 
 
566 aa  538  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  45.42 
 
 
554 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  45.25 
 
 
554 aa  533  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  45.53 
 
 
554 aa  533  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.04 
 
 
562 aa  530  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  45.19 
 
 
554 aa  529  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  44.46 
 
 
568 aa  529  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3625  alpha amylase catalytic region  46.35 
 
 
571 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  47.85 
 
 
590 aa  519  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  50.1 
 
 
531 aa  513  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.73 
 
 
538 aa  515  1e-144  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  47.57 
 
 
600 aa  511  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4669  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.18 
 
 
553 aa  511  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2503e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0700  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.55 
 
 
553 aa  511  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0599  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.38 
 
 
553 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  42.38 
 
 
553 aa  508  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  44.9 
 
 
555 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0632  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.38 
 
 
553 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0761  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.38 
 
 
553 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0687  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.38 
 
 
553 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0668  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.11 
 
 
553 aa  509  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.7 
 
 
562 aa  511  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.12 
 
 
561 aa  509  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  44.65 
 
 
556 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  41.82 
 
 
554 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  46.48 
 
 
554 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  42.21 
 
 
553 aa  504  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  42.98 
 
 
561 aa  502  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  41.65 
 
 
554 aa  504  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.8 
 
 
556 aa  504  1e-141  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0496  alpha,alpha-phosphotrehalase  45.76 
 
 
546 aa  500  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  41.71 
 
 
553 aa  501  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  46 
 
 
582 aa  499  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0243  alpha amylase catalytic region  46.96 
 
 
536 aa  501  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.13 
 
 
560 aa  501  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0509  alpha,alpha-phosphotrehalase  45.76 
 
 
546 aa  500  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  46.82 
 
 
551 aa  498  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  47.09 
 
 
549 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  47.5 
 
 
572 aa  497  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  47.09 
 
 
549 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  46.54 
 
 
552 aa  497  1e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  43.6 
 
 
553 aa  493  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0542  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.54 
 
 
555 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.764323  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2758  trehalose-6-phosphate hydrolase  43 
 
 
563 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  46.4 
 
 
535 aa  488  1e-136  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.57 
 
 
560 aa  487  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.63 
 
 
556 aa  484  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.49 
 
 
554 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04843  Putative alpha-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B3N7]  44.72 
 
 
591 aa  481  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145231  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0438  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.39 
 
 
551 aa  481  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.683069  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4800  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.96 
 
 
550 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.235757  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.05 
 
 
550 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1336  alpha amylase catalytic region  43.2 
 
 
565 aa  479  1e-134  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360472 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.96 
 
 
550 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4705  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.77 
 
 
550 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0221451  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1506  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.28 
 
 
561 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4834  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.58 
 
 
550 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0303  alpha amylase catalytic region  48.41 
 
 
557 aa  475  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  45.25 
 
 
551 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0474  alpha,alpha-phosphotrehalase  40.47 
 
 
553 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0201427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4493  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.25 
 
 
551 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>