More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1378 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  56.19 
 
 
563 aa  647    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  55.12 
 
 
563 aa  643    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
553 aa  1146    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0761  alpha,alpha-phosphotrehalase  55.73 
 
 
553 aa  616  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0599  trehalose-6-phosphate hydrolase  55.02 
 
 
553 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  55.2 
 
 
553 aa  616  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0632  trehalose-6-phosphate hydrolase  55.02 
 
 
553 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0687  alpha,alpha-phosphotrehalase  55.02 
 
 
553 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4669  alpha,alpha-phosphotrehalase  55.2 
 
 
553 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2503e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0700  trehalose-6-phosphate hydrolase  55.02 
 
 
553 aa  611  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  54.66 
 
 
553 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  53.97 
 
 
553 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0668  alpha,alpha-phosphotrehalase  54.3 
 
 
553 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  52.25 
 
 
560 aa  595  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0496  alpha,alpha-phosphotrehalase  50.75 
 
 
546 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  53.15 
 
 
562 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0509  alpha,alpha-phosphotrehalase  50.75 
 
 
546 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  49.73 
 
 
561 aa  581  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  50.18 
 
 
554 aa  581  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  49.55 
 
 
561 aa  579  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4493  trehalose-6-phosphate hydrolase  51.82 
 
 
551 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  51.64 
 
 
551 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0078  alpha,alpha-phosphotrehalase  51.43 
 
 
556 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.220549  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4800  trehalose-6-phosphate hydrolase  50.64 
 
 
550 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.235757  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3772  trehalose-6-phosphate hydrolase  51.45 
 
 
551 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4834  trehalose-6-phosphate hydrolase  53.56 
 
 
550 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4811  trehalose-6-phosphate hydrolase  51.64 
 
 
551 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04071  hypothetical protein  51.64 
 
 
551 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3755  alpha,alpha-phosphotrehalase  51.27 
 
 
551 aa  571  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  53.16 
 
 
550 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5761  trehalose-6-phosphate hydrolase  51.45 
 
 
551 aa  569  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.748972  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  50.72 
 
 
556 aa  571  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  50.36 
 
 
550 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0542  alpha,alpha-phosphotrehalase  51.07 
 
 
555 aa  568  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.764323  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4844  trehalose-6-phosphate hydrolase  51.27 
 
 
551 aa  570  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0430  trehalose-6-phosphate hydrolase  53.66 
 
 
555 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1164  trehalose-6-phosphate hydrolase  53.66 
 
 
555 aa  569  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.679252 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0494  trehalose-6-phosphate hydrolase  53.88 
 
 
553 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4720  trehalose-6-phosphate hydrolase  50.82 
 
 
551 aa  567  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2758  trehalose-6-phosphate hydrolase  49.82 
 
 
563 aa  565  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1506  trehalose-6-phosphate hydrolase  49.27 
 
 
561 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4705  trehalose-6-phosphate hydrolase  52.57 
 
 
550 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0221451  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  49.19 
 
 
559 aa  558  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  52.09 
 
 
557 aa  555  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  49.73 
 
 
558 aa  549  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0438  trehalose-6-phosphate hydrolase  49.18 
 
 
551 aa  551  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.683069  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  49.55 
 
 
558 aa  546  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  49.37 
 
 
558 aa  545  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  49.55 
 
 
558 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  49.37 
 
 
558 aa  548  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  49.02 
 
 
558 aa  542  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  49.37 
 
 
558 aa  544  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  49.37 
 
 
558 aa  544  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0474  alpha,alpha-phosphotrehalase  48.54 
 
 
553 aa  542  1e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0201427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  48.65 
 
 
558 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  48.65 
 
 
558 aa  537  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  47.58 
 
 
562 aa  528  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  48.39 
 
 
562 aa  528  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.94 
 
 
556 aa  528  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1336  alpha amylase catalytic region  46.34 
 
 
565 aa  515  1.0000000000000001e-145  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360472 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0193  alpha amylase family protein  45.75 
 
 
541 aa  514  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.59 
 
 
556 aa  514  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  44.05 
 
 
578 aa  510  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  44.5 
 
 
557 aa  505  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  46.5 
 
 
556 aa  506  9.999999999999999e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1340  alpha, alpha-phosphotrehalase  44.83 
 
 
553 aa  505  9.999999999999999e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.25 
 
 
560 aa  499  1e-140  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  43.68 
 
 
577 aa  496  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0509  alpha, alpha-phosphotrehalase  44.38 
 
 
549 aa  493  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.170608  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  45.49 
 
 
560 aa  489  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  43.09 
 
 
622 aa  491  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31510  glycosidase  43.76 
 
 
596 aa  485  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.382371  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0533  alpha, alpha-phosphotrehalase  45.7 
 
 
552 aa  488  1e-136  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000584391 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4886  alpha amylase catalytic region  43.06 
 
 
571 aa  484  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3625  alpha amylase catalytic region  42.48 
 
 
571 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  43.82 
 
 
566 aa  483  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  44.13 
 
 
563 aa  480  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  42.43 
 
 
570 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  43.24 
 
 
555 aa  481  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  45.02 
 
 
538 aa  478  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.35 
 
 
538 aa  478  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.37 
 
 
560 aa  476  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  44.74 
 
 
554 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  42.96 
 
 
535 aa  472  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0243  alpha amylase catalytic region  44.73 
 
 
536 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  43.34 
 
 
555 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.08 
 
 
531 aa  464  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  42.21 
 
 
552 aa  464  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.6 
 
 
562 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  42.6 
 
 
582 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  41.45 
 
 
590 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  43.85 
 
 
554 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  40.77 
 
 
606 aa  449  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  42.17 
 
 
554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  43.52 
 
 
554 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  45.21 
 
 
568 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  41.64 
 
 
554 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  43.27 
 
 
554 aa  443  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  41.61 
 
 
554 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  41.46 
 
 
554 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>