More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2383 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  54.3 
 
 
559 aa  635    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  60.04 
 
 
538 aa  682    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  56.91 
 
 
531 aa  649    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  54.72 
 
 
562 aa  638    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  100 
 
 
566 aa  1183    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  54.92 
 
 
538 aa  630  1e-179  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  53.31 
 
 
558 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  53.49 
 
 
558 aa  623  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  53.67 
 
 
558 aa  622  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  53.67 
 
 
558 aa  623  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  53.58 
 
 
558 aa  622  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  53.67 
 
 
558 aa  622  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  54.08 
 
 
557 aa  624  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  53.85 
 
 
558 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  53.49 
 
 
558 aa  621  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  53.31 
 
 
558 aa  618  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  52.77 
 
 
558 aa  615  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  54.72 
 
 
562 aa  612  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0243  alpha amylase catalytic region  55.49 
 
 
536 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  53.69 
 
 
535 aa  600  1e-170  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  48.74 
 
 
563 aa  585  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  48.32 
 
 
578 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  48.77 
 
 
570 aa  565  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  49.1 
 
 
561 aa  567  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  49.47 
 
 
563 aa  565  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  46.88 
 
 
563 aa  561  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  47.95 
 
 
561 aa  556  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  48.75 
 
 
556 aa  556  1e-157  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  50.45 
 
 
560 aa  558  1e-157  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  47.28 
 
 
553 aa  556  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  49.56 
 
 
554 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  49.29 
 
 
554 aa  552  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  49.82 
 
 
554 aa  553  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  48.83 
 
 
562 aa  552  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0700  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.83 
 
 
553 aa  549  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  49.82 
 
 
554 aa  551  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  49.82 
 
 
554 aa  551  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  47.83 
 
 
553 aa  548  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  47.86 
 
 
577 aa  551  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  49.82 
 
 
554 aa  551  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0668  alpha,alpha-phosphotrehalase  47.83 
 
 
553 aa  549  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  50 
 
 
554 aa  551  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  49.82 
 
 
554 aa  551  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  48.38 
 
 
557 aa  549  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4669  alpha,alpha-phosphotrehalase  47.83 
 
 
553 aa  545  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2503e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0761  alpha,alpha-phosphotrehalase  47.64 
 
 
553 aa  548  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  48.12 
 
 
562 aa  545  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0599  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.28 
 
 
553 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  47.12 
 
 
553 aa  543  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  49.37 
 
 
554 aa  543  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0632  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.28 
 
 
553 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0687  alpha,alpha-phosphotrehalase  47.28 
 
 
553 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.75 
 
 
560 aa  541  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  49.02 
 
 
554 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  49.02 
 
 
554 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  47.79 
 
 
555 aa  538  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  48.21 
 
 
560 aa  537  1e-151  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  48.53 
 
 
622 aa  536  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.24 
 
 
556 aa  533  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  45.71 
 
 
600 aa  524  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  48.8 
 
 
606 aa  523  1e-147  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0509  alpha,alpha-phosphotrehalase  47.54 
 
 
546 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0496  alpha,alpha-phosphotrehalase  47.54 
 
 
546 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  45.91 
 
 
555 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  44.73 
 
 
590 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  46.59 
 
 
549 aa  518  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  46.59 
 
 
549 aa  518  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  46.79 
 
 
554 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.43 
 
 
556 aa  518  1.0000000000000001e-145  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.36 
 
 
554 aa  515  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  46.15 
 
 
551 aa  514  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0191  glycosy hydrolase family protein  47.83 
 
 
534 aa  513  1e-144  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  46.65 
 
 
582 aa  512  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31510  glycosidase  45.94 
 
 
596 aa  510  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.382371  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4800  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.75 
 
 
550 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.235757  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.75 
 
 
550 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.73 
 
 
550 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4886  alpha amylase catalytic region  46.47 
 
 
571 aa  511  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  46.13 
 
 
554 aa  508  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  45.94 
 
 
556 aa  511  1e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.58 
 
 
560 aa  511  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4705  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.75 
 
 
550 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0221451  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0542  alpha,alpha-phosphotrehalase  45.7 
 
 
555 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.764323  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4834  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.75 
 
 
550 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  45.77 
 
 
568 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0438  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.07 
 
 
551 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.683069  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  45.59 
 
 
554 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2758  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.75 
 
 
563 aa  496  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1332  alpha amylase, catalytic domain protein  42.79 
 
 
639 aa  497  1e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.86601 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  44.28 
 
 
572 aa  494  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1506  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.94 
 
 
561 aa  495  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0474  alpha,alpha-phosphotrehalase  44.89 
 
 
553 aa  495  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0201427  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0494  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.06 
 
 
553 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1164  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.98 
 
 
555 aa  487  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.679252 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  43.84 
 
 
552 aa  487  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0430  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.98 
 
 
555 aa  487  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  43.09 
 
 
551 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04071  hypothetical protein  43.09 
 
 
551 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4493  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.09 
 
 
551 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4811  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.91 
 
 
551 aa  483  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>