More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1070 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  100 
 
 
551 aa  1134    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  59.28 
 
 
554 aa  679    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  59.1 
 
 
554 aa  677    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  59.1 
 
 
554 aa  677    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  59.28 
 
 
554 aa  683    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  59.28 
 
 
554 aa  681    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  53.71 
 
 
556 aa  647    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  59.86 
 
 
554 aa  684    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  59.1 
 
 
554 aa  677    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  78.04 
 
 
549 aa  905    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  57.32 
 
 
555 aa  665    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  58.2 
 
 
554 aa  674    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  58.92 
 
 
554 aa  677    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  78.04 
 
 
549 aa  905    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  59.1 
 
 
554 aa  679    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  59.1 
 
 
554 aa  677    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  56.76 
 
 
554 aa  643    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  56.58 
 
 
554 aa  639    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  59.28 
 
 
554 aa  682    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  60 
 
 
568 aa  657    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  51 
 
 
572 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  51.79 
 
 
562 aa  597  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  52.76 
 
 
558 aa  589  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  52.76 
 
 
558 aa  588  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  52.94 
 
 
558 aa  590  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  52.76 
 
 
558 aa  588  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  52.76 
 
 
558 aa  588  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  52.58 
 
 
558 aa  589  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  52.94 
 
 
558 aa  591  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  52.41 
 
 
558 aa  585  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  52.23 
 
 
558 aa  585  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  52.58 
 
 
558 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  52.41 
 
 
559 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  51.51 
 
 
562 aa  578  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  51.84 
 
 
554 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  51.43 
 
 
557 aa  568  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  47.54 
 
 
570 aa  564  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  49.2 
 
 
563 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  47.87 
 
 
578 aa  545  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  50.09 
 
 
560 aa  541  9.999999999999999e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  49.91 
 
 
563 aa  537  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  48.21 
 
 
563 aa  536  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  48.29 
 
 
538 aa  528  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.87 
 
 
556 aa  523  1e-147  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.49 
 
 
531 aa  515  1.0000000000000001e-145  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  46.15 
 
 
566 aa  514  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  49.24 
 
 
600 aa  514  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.81 
 
 
562 aa  508  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  49.61 
 
 
582 aa  511  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  46.67 
 
 
555 aa  505  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  46.58 
 
 
556 aa  498  1e-140  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  46.71 
 
 
560 aa  501  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  47.73 
 
 
622 aa  495  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  45.36 
 
 
535 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  44.91 
 
 
577 aa  494  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.67 
 
 
560 aa  491  9.999999999999999e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  44.32 
 
 
557 aa  490  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3625  alpha amylase catalytic region  45.33 
 
 
571 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31510  glycosidase  46.77 
 
 
596 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.382371  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0303  alpha amylase catalytic region  45.82 
 
 
557 aa  484  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.95 
 
 
538 aa  484  1e-135  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.91 
 
 
561 aa  479  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2575  alpha amylase catalytic region  44.49 
 
 
604 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.260702  normal  0.580332 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0243  alpha amylase catalytic region  44.74 
 
 
536 aa  480  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  44.01 
 
 
561 aa  478  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.87 
 
 
556 aa  475  1e-133  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4886  alpha amylase catalytic region  44.08 
 
 
571 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  43.68 
 
 
590 aa  474  1e-132  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.81 
 
 
562 aa  473  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  43.42 
 
 
552 aa  468  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29292  alpha-D-glucosidase (maltase) ( alpha-amylase) (MALT) (MAZS)  46.02 
 
 
573 aa  465  9.999999999999999e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.370606  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.96 
 
 
560 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0052  alpha amylase catalytic region  42.8 
 
 
577 aa  460  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.75 
 
 
553 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4669  alpha,alpha-phosphotrehalase  43.09 
 
 
553 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2503e-20 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  40.55 
 
 
606 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.83 
 
 
556 aa  449  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0761  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.91 
 
 
553 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0700  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.39 
 
 
553 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0668  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.73 
 
 
553 aa  445  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0687  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.4 
 
 
553 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0599  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.4 
 
 
553 aa  445  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  42.4 
 
 
553 aa  444  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  42.4 
 
 
553 aa  444  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1332  alpha amylase, catalytic domain protein  42.08 
 
 
639 aa  442  1e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.86601 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0632  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.4 
 
 
553 aa  445  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1848  alpha-glucosidase  45.54 
 
 
541 aa  444  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60352  alpha-glucosidase maltase  43.26 
 
 
572 aa  441  9.999999999999999e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0509  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.8 
 
 
546 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42120  alpha-glucosidase maltase  42.51 
 
 
572 aa  431  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.217758  normal  0.25099 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62666  alpha-glucosidase maltase  42.73 
 
 
572 aa  429  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.97685  normal  0.170022 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0496  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.8 
 
 
546 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4800  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.62 
 
 
550 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.235757  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4705  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.81 
 
 
550 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0221451  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.62 
 
 
550 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78743  alpha-glucosidase maltase  41.71 
 
 
572 aa  426  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04843  Putative alpha-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B3N7]  43.2 
 
 
591 aa  425  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145231  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00140  hydrolase, putative  40.57 
 
 
602 aa  424  1e-117  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.207981  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4834  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.62 
 
 
550 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.55 
 
 
550 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>