More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1497 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1332  alpha amylase, catalytic domain protein  67.24 
 
 
639 aa  907    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.86601 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  100 
 
 
606 aa  1254    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  54.34 
 
 
577 aa  622  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  53.68 
 
 
578 aa  587  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  55.99 
 
 
555 aa  578  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  51.01 
 
 
562 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  51.72 
 
 
622 aa  568  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  49.49 
 
 
557 aa  556  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4886  alpha amylase catalytic region  51.88 
 
 
571 aa  558  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  47.96 
 
 
558 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  47.96 
 
 
558 aa  554  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  47.96 
 
 
558 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  47.96 
 
 
558 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  47.96 
 
 
558 aa  555  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  47.96 
 
 
558 aa  550  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  47.96 
 
 
558 aa  551  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  47.79 
 
 
558 aa  551  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  47.62 
 
 
558 aa  550  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  47.79 
 
 
558 aa  551  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  49.66 
 
 
570 aa  548  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  51.97 
 
 
557 aa  545  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31510  glycosidase  52.41 
 
 
596 aa  539  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.382371  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  46.96 
 
 
560 aa  541  9.999999999999999e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  47.11 
 
 
559 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  47.56 
 
 
562 aa  538  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  48.8 
 
 
566 aa  523  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  46.4 
 
 
563 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  46.35 
 
 
538 aa  511  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  47.42 
 
 
556 aa  508  9.999999999999999e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  49.07 
 
 
556 aa  505  9.999999999999999e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  45.14 
 
 
563 aa  502  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  46.71 
 
 
563 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  48.06 
 
 
556 aa  500  1e-140  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.21 
 
 
560 aa  493  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  45.61 
 
 
600 aa  495  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  48.79 
 
 
531 aa  489  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  44.22 
 
 
554 aa  485  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0509  alpha,alpha-phosphotrehalase  44.33 
 
 
546 aa  486  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.41 
 
 
538 aa  486  1e-136  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0496  alpha,alpha-phosphotrehalase  44.33 
 
 
546 aa  486  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  45.35 
 
 
535 aa  484  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  42.59 
 
 
554 aa  484  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  44.76 
 
 
582 aa  482  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  43.52 
 
 
554 aa  481  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  44.97 
 
 
555 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.1 
 
 
562 aa  480  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.77 
 
 
554 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  43.17 
 
 
554 aa  479  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0243  alpha amylase catalytic region  45.16 
 
 
536 aa  481  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  45.35 
 
 
590 aa  481  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  43.98 
 
 
554 aa  476  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  43.17 
 
 
554 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  43.17 
 
 
554 aa  476  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  43.17 
 
 
554 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.2 
 
 
561 aa  478  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  44.15 
 
 
554 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  43.17 
 
 
554 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  42.83 
 
 
554 aa  472  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  42.69 
 
 
561 aa  473  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  41.36 
 
 
554 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.84 
 
 
560 aa  475  1e-132  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  44.2 
 
 
553 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  41.36 
 
 
554 aa  472  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  42.83 
 
 
554 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0438  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.59 
 
 
551 aa  471  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.683069  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0700  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.59 
 
 
553 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0599  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.03 
 
 
553 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0632  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.03 
 
 
553 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.52 
 
 
550 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  43.08 
 
 
553 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0052  alpha amylase catalytic region  44.03 
 
 
577 aa  468  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  44.16 
 
 
556 aa  468  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4800  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.71 
 
 
550 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.235757  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0687  alpha,alpha-phosphotrehalase  44.2 
 
 
553 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  45.03 
 
 
551 aa  463  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.52 
 
 
550 aa  465  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4844  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.42 
 
 
551 aa  462  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  44.03 
 
 
553 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4705  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.15 
 
 
550 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0221451  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4720  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.15 
 
 
551 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0761  alpha,alpha-phosphotrehalase  43.42 
 
 
553 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  42 
 
 
568 aa  462  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04071  hypothetical protein  45.03 
 
 
551 aa  463  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4493  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.03 
 
 
551 aa  464  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  44.52 
 
 
552 aa  459  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3755  alpha,alpha-phosphotrehalase  44.84 
 
 
551 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4834  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.15 
 
 
550 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4811  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.84 
 
 
551 aa  462  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4669  alpha,alpha-phosphotrehalase  44.03 
 
 
553 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2503e-20 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3772  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.28 
 
 
551 aa  458  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  42.59 
 
 
549 aa  458  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5761  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.47 
 
 
551 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.748972  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.5 
 
 
556 aa  458  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  42.59 
 
 
549 aa  458  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.75 
 
 
562 aa  456  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2758  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.36 
 
 
563 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  40.55 
 
 
551 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0430  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.13 
 
 
555 aa  455  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0668  alpha,alpha-phosphotrehalase  43.32 
 
 
553 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0494  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.13 
 
 
553 aa  455  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>