More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2758 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  70.05 
 
 
551 aa  823    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3755  alpha,alpha-phosphotrehalase  69.87 
 
 
551 aa  818    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1164  trehalose-6-phosphate hydrolase  71.97 
 
 
555 aa  843    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.679252 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0430  trehalose-6-phosphate hydrolase  71.97 
 
 
555 aa  843    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  70.11 
 
 
550 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4493  trehalose-6-phosphate hydrolase  70.05 
 
 
551 aa  825    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4844  trehalose-6-phosphate hydrolase  69.75 
 
 
551 aa  822    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257097  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4811  trehalose-6-phosphate hydrolase  70.05 
 
 
551 aa  826    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4834  trehalose-6-phosphate hydrolase  69.75 
 
 
550 aa  821    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  69.93 
 
 
550 aa  822    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4720  trehalose-6-phosphate hydrolase  69.69 
 
 
551 aa  822    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5761  trehalose-6-phosphate hydrolase  69.69 
 
 
551 aa  819    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.748972  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4705  trehalose-6-phosphate hydrolase  69.57 
 
 
550 aa  819    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0221451  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  74.77 
 
 
554 aa  888    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1506  trehalose-6-phosphate hydrolase  91.8 
 
 
561 aa  1090    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  55.02 
 
 
563 aa  640    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4800  trehalose-6-phosphate hydrolase  70.29 
 
 
550 aa  825    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.235757  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  60.55 
 
 
561 aa  701    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  60.18 
 
 
561 aa  696    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  64.03 
 
 
562 aa  694    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  56.08 
 
 
556 aa  657    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0438  trehalose-6-phosphate hydrolase  70.83 
 
 
551 aa  842    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.683069  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3772  trehalose-6-phosphate hydrolase  69.87 
 
 
551 aa  823    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  57.51 
 
 
560 aa  678    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  55.83 
 
 
563 aa  657    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04071  hypothetical protein  70.05 
 
 
551 aa  823    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2758  trehalose-6-phosphate hydrolase  100 
 
 
563 aa  1181    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0494  trehalose-6-phosphate hydrolase  72.23 
 
 
553 aa  848    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  53.36 
 
 
553 aa  633  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0687  alpha,alpha-phosphotrehalase  53.72 
 
 
553 aa  632  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0700  trehalose-6-phosphate hydrolase  53.36 
 
 
553 aa  629  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  53.54 
 
 
553 aa  630  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0761  alpha,alpha-phosphotrehalase  53.72 
 
 
553 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0668  alpha,alpha-phosphotrehalase  54.45 
 
 
553 aa  630  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4669  alpha,alpha-phosphotrehalase  54.26 
 
 
553 aa  629  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2503e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0599  trehalose-6-phosphate hydrolase  53.36 
 
 
553 aa  628  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0632  trehalose-6-phosphate hydrolase  53.36 
 
 
553 aa  628  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  52.99 
 
 
553 aa  624  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0542  alpha,alpha-phosphotrehalase  51.82 
 
 
555 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.764323  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0496  alpha,alpha-phosphotrehalase  53.65 
 
 
546 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0509  alpha,alpha-phosphotrehalase  53.65 
 
 
546 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1336  alpha amylase catalytic region  52.51 
 
 
565 aa  568  1e-161  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360472 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  49.82 
 
 
553 aa  565  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  48.19 
 
 
557 aa  565  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0078  alpha,alpha-phosphotrehalase  48.36 
 
 
556 aa  560  1e-158  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.220549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  46.35 
 
 
559 aa  560  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  46.08 
 
 
558 aa  561  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  45.9 
 
 
558 aa  555  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  45.9 
 
 
558 aa  555  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  45.9 
 
 
558 aa  555  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  45.9 
 
 
558 aa  555  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  45.54 
 
 
558 aa  555  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  45.72 
 
 
558 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  46.45 
 
 
558 aa  555  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  45.36 
 
 
558 aa  554  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0474  alpha,alpha-phosphotrehalase  46.98 
 
 
553 aa  551  1e-155  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0201427  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  45.36 
 
 
558 aa  549  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  47.45 
 
 
562 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  46.58 
 
 
562 aa  546  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  47.29 
 
 
557 aa  518  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.85 
 
 
556 aa  515  1.0000000000000001e-145  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  44.51 
 
 
538 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  48.85 
 
 
577 aa  509  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  45.57 
 
 
556 aa  508  1e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1340  alpha, alpha-phosphotrehalase  45.5 
 
 
553 aa  509  1e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.87 
 
 
538 aa  508  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.46 
 
 
560 aa  510  1e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  46.07 
 
 
560 aa  507  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  46.25 
 
 
570 aa  505  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.75 
 
 
556 aa  500  1e-140  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0193  alpha amylase family protein  44.81 
 
 
541 aa  495  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  47.59 
 
 
578 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  42.75 
 
 
566 aa  496  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  43.52 
 
 
590 aa  488  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  43 
 
 
622 aa  486  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0533  alpha, alpha-phosphotrehalase  44.04 
 
 
552 aa  482  1e-135  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000584391 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.3 
 
 
531 aa  481  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  43.84 
 
 
568 aa  479  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  43.01 
 
 
552 aa  477  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  41.94 
 
 
563 aa  477  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  43.24 
 
 
582 aa  474  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  44.54 
 
 
555 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.94 
 
 
562 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  41.27 
 
 
554 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  41.55 
 
 
555 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  39.56 
 
 
560 aa  462  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0509  alpha, alpha-phosphotrehalase  43.81 
 
 
549 aa  462  1e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.170608  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  45.42 
 
 
535 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  42.68 
 
 
572 aa  456  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  43.36 
 
 
606 aa  456  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  43.76 
 
 
556 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  39.75 
 
 
554 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  40.11 
 
 
554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  40.11 
 
 
554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  40.11 
 
 
554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  39.71 
 
 
554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  39.71 
 
 
554 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  40.11 
 
 
554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  39.34 
 
 
554 aa  450  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  41.73 
 
 
600 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>