More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4834 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  84.49 
 
 		 551 aa  988    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3755  alpha,alpha-phosphotrehalase  84.12 
 
 		 551 aa  984    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4834  trehalose-6-phosphate hydrolase  100 
 
 		 550 aa  1153    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0438  trehalose-6-phosphate hydrolase  83.21 
 
 		 551 aa  974    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.683069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3772  trehalose-6-phosphate hydrolase  84.49 
 
 		 551 aa  989    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2758  trehalose-6-phosphate hydrolase  69.75 
 
 		 563 aa  821    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4800  trehalose-6-phosphate hydrolase  98.36 
 
 		 550 aa  1137    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.235757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0430  trehalose-6-phosphate hydrolase  72.33 
 
 		 555 aa  832    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  71.14 
 
 		 554 aa  835    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  55.97 
 
 		 563 aa  645    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  98.73 
 
 		 550 aa  1139    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4811  trehalose-6-phosphate hydrolase  84.67 
 
 		 551 aa  991    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5761  trehalose-6-phosphate hydrolase  84.67 
 
 		 551 aa  986    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.748972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04071  hypothetical protein  84.49 
 
 		 551 aa  988    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0494  trehalose-6-phosphate hydrolase  72.6 
 
 		 553 aa  837    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4705  trehalose-6-phosphate hydrolase  98.55 
 
 		 550 aa  1137    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0221451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  58.82 
 
 		 562 aa  664    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  98.36 
 
 		 550 aa  1135    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  57.56 
 
 		 556 aa  670    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  58.65 
 
 		 561 aa  677    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1506  trehalose-6-phosphate hydrolase  69.05 
 
 		 561 aa  818    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4844  trehalose-6-phosphate hydrolase  84.64 
 
 		 551 aa  986    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257097  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4493  trehalose-6-phosphate hydrolase  84.67 
 
 		 551 aa  989    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4720  trehalose-6-phosphate hydrolase  84.85 
 
 		 551 aa  988    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  58.9 
 
 		 561 aa  676    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  57.61 
 
 		 560 aa  670    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  56.12 
 
 		 563 aa  650    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1164  trehalose-6-phosphate hydrolase  72.33 
 
 		 555 aa  832    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.679252 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0700  trehalose-6-phosphate hydrolase  55.37 
 
 		 553 aa  630  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  54.83 
 
 		 553 aa  628  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0761  alpha,alpha-phosphotrehalase  55.19 
 
 		 553 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4669  alpha,alpha-phosphotrehalase  55.56 
 
 		 553 aa  630  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.2503e-20 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0542  alpha,alpha-phosphotrehalase  54.4 
 
 		 555 aa  628  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.764323  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0599  trehalose-6-phosphate hydrolase  54.64 
 
 		 553 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0632  trehalose-6-phosphate hydrolase  54.64 
 
 		 553 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0687  alpha,alpha-phosphotrehalase  54.83 
 
 		 553 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  54.28 
 
 		 553 aa  623  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  54.1 
 
 		 553 aa  623  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0668  alpha,alpha-phosphotrehalase  55.19 
 
 		 553 aa  623  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0509  alpha,alpha-phosphotrehalase  54.03 
 
 		 546 aa  586  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0496  alpha,alpha-phosphotrehalase  54.03 
 
 		 546 aa  586  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1336  alpha amylase catalytic region  53.27 
 
 		 565 aa  580  1e-164  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360472 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  53.56 
 
 		 553 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0078  alpha,alpha-phosphotrehalase  49.18 
 
 		 556 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.220549  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0474  alpha,alpha-phosphotrehalase  49.09 
 
 		 553 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0201427  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  47.53 
 
 		 557 aa  551  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  45.62 
 
 		 559 aa  548  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  45.17 
 
 		 558 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  44.99 
 
 		 558 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  44.63 
 
 		 558 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  44.44 
 
 		 558 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  44.08 
 
 		 558 aa  532  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  44.26 
 
 		 558 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  44.44 
 
 		 558 aa  535  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  44.44 
 
 		 558 aa  535  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  44.26 
 
 		 558 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  44.44 
 
 		 558 aa  532  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  45.64 
 
 		 562 aa  528  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  47.48 
 
 		 560 aa  526  1e-148  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  46.71 
 
 		 556 aa  525  1e-148  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1340  alpha, alpha-phosphotrehalase  47.71 
 
 		 553 aa  524  1e-147  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.95 
 
 		 556 aa  521  1e-146  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  44.95 
 
 		 562 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0193  alpha amylase family protein  46.85 
 
 		 541 aa  514  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  47.71 
 
 		 557 aa  513  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  47.97 
 
 		 578 aa  514  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  47.22 
 
 		 577 aa  508  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  44.75 
 
 		 566 aa  508  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0533  alpha, alpha-phosphotrehalase  46.62 
 
 		 552 aa  503  1e-141  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000584391 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  43.77 
 
 		 538 aa  504  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.03 
 
 		 560 aa  501  1e-140  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  44.46 
 
 		 570 aa  495  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.39 
 
 		 538 aa  495  1e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.23 
 
 		 556 aa  496  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  43.76 
 
 		 563 aa  491  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  48.02 
 
 		 531 aa  489  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  43.14 
 
 		 554 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  44.16 
 
 		 555 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  45.59 
 
 		 535 aa  473  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  42.62 
 
 		 582 aa  472  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.84 
 
 		 562 aa  475  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.18 
 
 		 560 aa  468  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0509  alpha, alpha-phosphotrehalase  46.13 
 
 		 549 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.170608  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  46.35 
 
 		 622 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  44.86 
 
 		 555 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  43.57 
 
 		 552 aa  467  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  43.56 
 
 		 568 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  41.74 
 
 		 590 aa  464  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0243  alpha amylase catalytic region  45.01 
 
 		 536 aa  462  1e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  45.15 
 
 		 606 aa  459  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4886  alpha amylase catalytic region  44.66 
 
 		 571 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  41.02 
 
 		 554 aa  455  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  40.65 
 
 		 554 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  40.65 
 
 		 554 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  40.47 
 
 		 554 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  40.04 
 
 		 554 aa  449  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  40.65 
 
 		 554 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31510  glycosidase  44.7 
 
 		 596 aa  451  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.382371  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  40.47 
 
 		 554 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  42.05 
 
 		 556 aa  448  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>