More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0533 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0533  alpha, alpha-phosphotrehalase  100 
 
 
552 aa  1141    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000584391 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0193  alpha amylase family protein  56.59 
 
 
541 aa  627  1e-178  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1340  alpha, alpha-phosphotrehalase  53.89 
 
 
553 aa  624  1e-177  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0474  alpha,alpha-phosphotrehalase  54.12 
 
 
553 aa  621  1e-176  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0201427  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0509  alpha, alpha-phosphotrehalase  53.99 
 
 
549 aa  619  1e-176  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.170608  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0542  alpha,alpha-phosphotrehalase  53.32 
 
 
555 aa  580  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.764323  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0078  alpha,alpha-phosphotrehalase  50.99 
 
 
556 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.220549  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  50.18 
 
 
563 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  49.82 
 
 
563 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1336  alpha amylase catalytic region  49.73 
 
 
565 aa  534  1e-150  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360472 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0668  alpha,alpha-phosphotrehalase  48.57 
 
 
553 aa  524  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0496  alpha,alpha-phosphotrehalase  51.24 
 
 
546 aa  525  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0509  alpha,alpha-phosphotrehalase  51.24 
 
 
546 aa  525  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  47.41 
 
 
553 aa  522  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4669  alpha,alpha-phosphotrehalase  48.39 
 
 
553 aa  519  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2503e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0700  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.76 
 
 
553 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0761  alpha,alpha-phosphotrehalase  47.94 
 
 
553 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  47.58 
 
 
553 aa  514  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0687  alpha,alpha-phosphotrehalase  47.41 
 
 
553 aa  512  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0599  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.41 
 
 
553 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0632  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.41 
 
 
553 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  47.23 
 
 
553 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.52 
 
 
561 aa  502  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4834  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.62 
 
 
550 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4800  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.62 
 
 
550 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.235757  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.8 
 
 
550 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.44 
 
 
550 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4844  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.52 
 
 
551 aa  499  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257097  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4705  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.44 
 
 
550 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0221451  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4720  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.07 
 
 
551 aa  500  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.53 
 
 
560 aa  499  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  46.34 
 
 
551 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4493  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.34 
 
 
551 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.18 
 
 
562 aa  498  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4811  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.34 
 
 
551 aa  498  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3772  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.34 
 
 
551 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04071  hypothetical protein  46.34 
 
 
551 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  45.97 
 
 
561 aa  496  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.54 
 
 
556 aa  497  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3755  alpha,alpha-phosphotrehalase  46.52 
 
 
551 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0438  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.6 
 
 
551 aa  493  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.683069  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5761  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.35 
 
 
551 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.748972  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  45.7 
 
 
553 aa  488  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2758  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.04 
 
 
563 aa  482  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1506  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.77 
 
 
561 aa  476  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0494  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.75 
 
 
553 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.94 
 
 
554 aa  460  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1164  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.59 
 
 
555 aa  456  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.679252 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0430  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.59 
 
 
555 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  43.06 
 
 
559 aa  458  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  42.78 
 
 
562 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  42.86 
 
 
558 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  42.86 
 
 
558 aa  450  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  42.13 
 
 
558 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  42.06 
 
 
558 aa  443  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  42.06 
 
 
558 aa  442  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  41.45 
 
 
566 aa  442  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  42.06 
 
 
558 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  41.7 
 
 
558 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  41.88 
 
 
558 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  41.88 
 
 
558 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  41.88 
 
 
558 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  39.82 
 
 
557 aa  435  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  39.5 
 
 
578 aa  430  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  41.55 
 
 
556 aa  430  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  42.14 
 
 
560 aa  425  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.83 
 
 
556 aa  422  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  41.67 
 
 
557 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  38.2 
 
 
577 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  39.38 
 
 
552 aa  420  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  40.65 
 
 
538 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.29 
 
 
556 aa  418  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  38.14 
 
 
622 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  38.87 
 
 
570 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  38.01 
 
 
555 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.88 
 
 
538 aa  414  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.26 
 
 
560 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  41.55 
 
 
562 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0243  alpha amylase catalytic region  40.65 
 
 
536 aa  404  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.66 
 
 
560 aa  397  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  37.09 
 
 
606 aa  392  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  38.71 
 
 
562 aa  395  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  39.46 
 
 
563 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0052  alpha amylase catalytic region  38.05 
 
 
577 aa  382  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  38.27 
 
 
554 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  38.5 
 
 
554 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  39.05 
 
 
531 aa  384  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  38.85 
 
 
568 aa  385  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  37.41 
 
 
555 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  37.91 
 
 
554 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1332  alpha amylase, catalytic domain protein  35.28 
 
 
639 aa  378  1e-103  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.86601 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl499  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.07 
 
 
539 aa  376  1e-103  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  37.74 
 
 
590 aa  378  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  37.79 
 
 
554 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  37.79 
 
 
554 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  38.18 
 
 
535 aa  373  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  37.61 
 
 
554 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  37.97 
 
 
554 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  37.1 
 
 
572 aa  372  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  37.79 
 
 
554 aa  372  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>