More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0494 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_04071  hypothetical protein  73.68 
 
 		 551 aa  842    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  73.68 
 
 		 551 aa  842    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3755  alpha,alpha-phosphotrehalase  74.13 
 
 		 551 aa  837    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0430  trehalose-6-phosphate hydrolase  99.64 
 
 		 555 aa  1152    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  57.94 
 
 		 563 aa  650    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4800  trehalose-6-phosphate hydrolase  72.41 
 
 		 550 aa  834    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.235757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0438  trehalose-6-phosphate hydrolase  73.32 
 
 		 551 aa  844    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.683069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  63.94 
 
 		 562 aa  672    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  60.18 
 
 		 561 aa  679    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2758  trehalose-6-phosphate hydrolase  72.23 
 
 		 563 aa  848    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5761  trehalose-6-phosphate hydrolase  73.68 
 
 		 551 aa  838    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.748972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4834  trehalose-6-phosphate hydrolase  72.6 
 
 		 550 aa  837    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  56.96 
 
 		 556 aa  642    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1164  trehalose-6-phosphate hydrolase  99.64 
 
 		 555 aa  1152    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.679252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  77.76 
 
 		 554 aa  909    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  56.83 
 
 		 563 aa  634    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1506  trehalose-6-phosphate hydrolase  72.05 
 
 		 561 aa  849    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4720  trehalose-6-phosphate hydrolase  74.13 
 
 		 551 aa  842    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3772  trehalose-6-phosphate hydrolase  73.68 
 
 		 551 aa  840    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4705  trehalose-6-phosphate hydrolase  72.41 
 
 		 550 aa  835    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0221451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0494  trehalose-6-phosphate hydrolase  100 
 
 		 553 aa  1157    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4844  trehalose-6-phosphate hydrolase  74.05 
 
 		 551 aa  844    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257097  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  58.88 
 
 		 561 aa  670    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  72.41 
 
 		 550 aa  838    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  58.06 
 
 		 560 aa  665    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4493  trehalose-6-phosphate hydrolase  73.87 
 
 		 551 aa  843    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  72.78 
 
 		 550 aa  839    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4811  trehalose-6-phosphate hydrolase  73.68 
 
 		 551 aa  842    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0542  alpha,alpha-phosphotrehalase  53.99 
 
 		 555 aa  610  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.764323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0700  trehalose-6-phosphate hydrolase  54.17 
 
 		 553 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  53.36 
 
 		 553 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  53.8 
 
 		 553 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0599  trehalose-6-phosphate hydrolase  53.62 
 
 		 553 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  53.62 
 
 		 553 aa  598  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0632  trehalose-6-phosphate hydrolase  53.62 
 
 		 553 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0687  alpha,alpha-phosphotrehalase  53.62 
 
 		 553 aa  599  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0668  alpha,alpha-phosphotrehalase  53.72 
 
 		 553 aa  596  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0761  alpha,alpha-phosphotrehalase  53.62 
 
 		 553 aa  596  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4669  alpha,alpha-phosphotrehalase  53.54 
 
 		 553 aa  592  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.2503e-20 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0496  alpha,alpha-phosphotrehalase  53.47 
 
 		 546 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0509  alpha,alpha-phosphotrehalase  53.47 
 
 		 546 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  53.88 
 
 		 553 aa  570  1e-161  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  47.9 
 
 		 557 aa  556  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0078  alpha,alpha-phosphotrehalase  48.54 
 
 		 556 aa  549  1e-155  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.220549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  45.17 
 
 		 559 aa  542  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1336  alpha amylase catalytic region  50.46 
 
 		 565 aa  540  9.999999999999999e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360472 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  44.55 
 
 		 558 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0474  alpha,alpha-phosphotrehalase  47.62 
 
 		 553 aa  533  1e-150  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0201427  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  47 
 
 		 562 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  44.44 
 
 		 558 aa  532  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  44.36 
 
 		 558 aa  531  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  44.18 
 
 		 558 aa  531  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  44.18 
 
 		 558 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  44.18 
 
 		 558 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  44.18 
 
 		 558 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  44.18 
 
 		 558 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  44 
 
 		 558 aa  525  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  43.45 
 
 		 558 aa  523  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  47.04 
 
 		 562 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  49.44 
 
 		 557 aa  512  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.91 
 
 		 556 aa  506  9.999999999999999e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  45.88 
 
 		 560 aa  504  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  43.96 
 
 		 538 aa  503  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  49.61 
 
 		 578 aa  504  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  47.47 
 
 		 556 aa  498  1e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1340  alpha, alpha-phosphotrehalase  46.95 
 
 		 553 aa  493  9.999999999999999e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.47 
 
 		 556 aa  491  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  47.43 
 
 		 577 aa  488  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.15 
 
 		 531 aa  486  1e-136  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.32 
 
 		 538 aa  487  1e-136  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  44.06 
 
 		 566 aa  488  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.7 
 
 		 560 aa  484  1e-135  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  44.32 
 
 		 570 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  45.52 
 
 		 590 aa  472  1e-132  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0193  alpha amylase family protein  46.56 
 
 		 541 aa  474  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  42.75 
 
 		 563 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  43.45 
 
 		 555 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  43.43 
 
 		 622 aa  462  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0533  alpha, alpha-phosphotrehalase  44.75 
 
 		 552 aa  461  9.999999999999999e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000584391 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  41.92 
 
 		 554 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  45.35 
 
 		 535 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31510  glycosidase  47.18 
 
 		 596 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.382371  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4886  alpha amylase catalytic region  45.73 
 
 		 571 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.58 
 
 		 560 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  44.13 
 
 		 606 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  41.19 
 
 		 582 aa  449  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  40.8 
 
 		 554 aa  450  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0509  alpha, alpha-phosphotrehalase  44.55 
 
 		 549 aa  451  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.170608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  44.22 
 
 		 555 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1332  alpha amylase, catalytic domain protein  44.02 
 
 		 639 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.86601 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  41.89 
 
 		 552 aa  445  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  39.78 
 
 		 554 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  39.78 
 
 		 554 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  39.78 
 
 		 554 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  39.78 
 
 		 554 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0243  alpha amylase catalytic region  44.16 
 
 		 536 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  39.78 
 
 		 554 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  39.6 
 
 		 554 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.77 
 
 		 562 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  42.18 
 
 		 556 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>