More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0542 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  54.53 
 
 		 551 aa  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3755  alpha,alpha-phosphotrehalase  54.91 
 
 		 551 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1336  alpha amylase catalytic region  55.94 
 
 		 565 aa  650    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360472 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0700  trehalose-6-phosphate hydrolase  63.99 
 
 		 553 aa  720    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0668  alpha,alpha-phosphotrehalase  63.28 
 
 		 553 aa  711    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0599  trehalose-6-phosphate hydrolase  63.1 
 
 		 553 aa  709    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  63.28 
 
 		 553 aa  712    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  63.46 
 
 		 553 aa  714    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  59.5 
 
 		 563 aa  717    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  55.1 
 
 		 562 aa  640    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4811  trehalose-6-phosphate hydrolase  54.53 
 
 		 551 aa  642    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4844  trehalose-6-phosphate hydrolase  54.53 
 
 		 551 aa  641    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0632  trehalose-6-phosphate hydrolase  63.1 
 
 		 553 aa  709    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4800  trehalose-6-phosphate hydrolase  54.95 
 
 		 550 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.235757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4669  alpha,alpha-phosphotrehalase  63.46 
 
 		 553 aa  714    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.2503e-20 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04071  hypothetical protein  54.53 
 
 		 551 aa  642    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4834  trehalose-6-phosphate hydrolase  54.4 
 
 		 550 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3772  trehalose-6-phosphate hydrolase  54.53 
 
 		 551 aa  642    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  54.35 
 
 		 554 aa  649    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  57.73 
 
 		 561 aa  656    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  63.46 
 
 		 553 aa  731    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0542  alpha,alpha-phosphotrehalase  100 
 
 		 555 aa  1130    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.764323  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0078  alpha,alpha-phosphotrehalase  66.13 
 
 		 556 aa  755    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.220549  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4720  trehalose-6-phosphate hydrolase  54.95 
 
 		 551 aa  641    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  54.58 
 
 		 550 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  57.01 
 
 		 561 aa  648    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0687  alpha,alpha-phosphotrehalase  63.1 
 
 		 553 aa  710    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5761  trehalose-6-phosphate hydrolase  54.73 
 
 		 551 aa  640    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.748972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0474  alpha,alpha-phosphotrehalase  58.73 
 
 		 553 aa  676    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0201427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0761  alpha,alpha-phosphotrehalase  63.28 
 
 		 553 aa  713    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4705  trehalose-6-phosphate hydrolase  54.76 
 
 		 550 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0221451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  54.76 
 
 		 550 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  55.54 
 
 		 560 aa  657    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0496  alpha,alpha-phosphotrehalase  59.42 
 
 		 546 aa  644    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  61.65 
 
 		 563 aa  734    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1506  trehalose-6-phosphate hydrolase  52.53 
 
 		 561 aa  634    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0509  alpha,alpha-phosphotrehalase  59.42 
 
 		 546 aa  644    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4493  trehalose-6-phosphate hydrolase  54.53 
 
 		 551 aa  642    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0193  alpha amylase family protein  54.48 
 
 		 541 aa  628  1e-178  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0438  trehalose-6-phosphate hydrolase  53.66 
 
 		 551 aa  627  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.683069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  53.86 
 
 		 556 aa  628  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2758  trehalose-6-phosphate hydrolase  51.82 
 
 		 563 aa  622  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0494  trehalose-6-phosphate hydrolase  53.99 
 
 		 553 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1164  trehalose-6-phosphate hydrolase  53.79 
 
 		 555 aa  615  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.679252 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0430  trehalose-6-phosphate hydrolase  53.79 
 
 		 555 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0533  alpha, alpha-phosphotrehalase  53.32 
 
 		 552 aa  597  1e-169  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000584391 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  51.61 
 
 		 558 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  51.35 
 
 		 558 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  51.35 
 
 		 558 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  51.53 
 
 		 558 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  51.07 
 
 		 553 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  51.34 
 
 		 558 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  51.08 
 
 		 559 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  50.36 
 
 		 558 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  51.35 
 
 		 558 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  51.17 
 
 		 558 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1340  alpha, alpha-phosphotrehalase  50.45 
 
 		 553 aa  569  1e-161  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  50.18 
 
 		 558 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  50.09 
 
 		 558 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0509  alpha, alpha-phosphotrehalase  48.73 
 
 		 549 aa  556  1e-157  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.170608  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  50.63 
 
 		 562 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  50.9 
 
 		 557 aa  551  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  48.4 
 
 		 556 aa  541  9.999999999999999e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  49.29 
 
 		 562 aa  537  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  46.79 
 
 		 556 aa  527  1e-148  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  43.31 
 
 		 578 aa  525  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  47.56 
 
 		 538 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  45.49 
 
 		 557 aa  514  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  45.7 
 
 		 566 aa  514  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  43.68 
 
 		 552 aa  510  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.22 
 
 		 560 aa  509  1e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  42.18 
 
 		 577 aa  506  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.28 
 
 		 556 aa  503  1e-141  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  43.53 
 
 		 570 aa  500  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  46.8 
 
 		 563 aa  499  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  46.02 
 
 		 560 aa  496  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.82 
 
 		 560 aa  488  1e-137  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  42.54 
 
 		 622 aa  491  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  43.92 
 
 		 590 aa  488  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  45.8 
 
 		 554 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.47 
 
 		 531 aa  486  1e-136  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  45.8 
 
 		 554 aa  485  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  45.8 
 
 		 554 aa  485  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  45.62 
 
 		 554 aa  483  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  45.8 
 
 		 554 aa  485  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0243  alpha amylase catalytic region  48.68 
 
 		 536 aa  482  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.65 
 
 		 538 aa  483  1e-135  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  45.8 
 
 		 554 aa  485  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  45.29 
 
 		 554 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  45.71 
 
 		 554 aa  480  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  45.44 
 
 		 554 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  45.16 
 
 		 554 aa  477  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  42.63 
 
 		 555 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  45.44 
 
 		 554 aa  474  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl499  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.81 
 
 		 539 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  44.72 
 
 		 554 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.68 
 
 		 562 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  42.81 
 
 		 555 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  44.04 
 
 		 535 aa  462  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0052  alpha amylase catalytic region  40.73 
 
 		 577 aa  464  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.316768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>