More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0770 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 455 aa  938    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  67.11 
 
 		 454 aa  653    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  43.33 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  42.23 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  40.35 
 
 		 515 aa  305  8.000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  35.91 
 
 		 499 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  35.82 
 
 		 654 aa  269  8e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  34.18 
 
 		 509 aa  262  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  36.44 
 
 		 493 aa  262  1e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  37.78 
 
 		 815 aa  260  3e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  34.75 
 
 		 522 aa  246  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  35.71 
 
 		 593 aa  247  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  32.27 
 
 		 588 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  35.76 
 
 		 595 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  35.45 
 
 		 555 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  33.19 
 
 		 541 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  33.19 
 
 		 541 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  35.45 
 
 		 555 aa  243  6e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  32.1 
 
 		 545 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  36.14 
 
 		 647 aa  229  8e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  34.14 
 
 		 583 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  34.26 
 
 		 575 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  30.2 
 
 		 556 aa  206  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  30.68 
 
 		 601 aa  203  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  30.62 
 
 		 548 aa  203  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  30.22 
 
 		 591 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  28.43 
 
 		 1088 aa  199  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  29.96 
 
 		 544 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  29.24 
 
 		 1092 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  29.61 
 
 		 682 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  29.28 
 
 		 1088 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  29.34 
 
 		 1088 aa  196  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  29.34 
 
 		 1088 aa  196  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  27.08 
 
 		 1088 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  31.08 
 
 		 577 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  30.16 
 
 		 567 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  31.47 
 
 		 1109 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  30.44 
 
 		 551 aa  194  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  44.83 
 
 		 258 aa  193  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  29.08 
 
 		 1102 aa  193  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  31.61 
 
 		 604 aa  192  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  28.14 
 
 		 606 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  27.61 
 
 		 1104 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  30.57 
 
 		 1102 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  29.42 
 
 		 556 aa  191  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  30.57 
 
 		 1102 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  27.6 
 
 		 1115 aa  190  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  28.08 
 
 		 1098 aa  189  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  27.96 
 
 		 1137 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  28.54 
 
 		 1137 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  27.96 
 
 		 1137 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  27.96 
 
 		 1137 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  31.29 
 
 		 558 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  29.91 
 
 		 1100 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  28.69 
 
 		 1139 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  29.7 
 
 		 574 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  28.71 
 
 		 562 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  27.88 
 
 		 1121 aa  189  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  29.79 
 
 		 554 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  28.16 
 
 		 1138 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  29.54 
 
 		 554 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  29.48 
 
 		 554 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  30.47 
 
 		 551 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  27.99 
 
 		 1101 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  29.76 
 
 		 1061 aa  187  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  28.48 
 
 		 1154 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  29.31 
 
 		 572 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  28.96 
 
 		 1136 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  28.34 
 
 		 1137 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  30.13 
 
 		 1085 aa  186  8e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  29.65 
 
 		 1112 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  29.52 
 
 		 524 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  30.8 
 
 		 1142 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  28.24 
 
 		 1101 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  30.15 
 
 		 549 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  27.94 
 
 		 1152 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0107  alpha-amylase family protein  28.73 
 
 		 541 aa  183  5.0000000000000004e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0384017  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  28.27 
 
 		 1154 aa  183  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  27.86 
 
 		 1108 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  27.53 
 
 		 1131 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  28.06 
 
 		 1108 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  30.12 
 
 		 544 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  28.46 
 
 		 571 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  27.14 
 
 		 1121 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  27.99 
 
 		 1112 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  27.49 
 
 		 1093 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  28.88 
 
 		 1093 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  27.53 
 
 		 1131 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  27.53 
 
 		 1131 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  27.53 
 
 		 1131 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  27.53 
 
 		 1131 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  27.53 
 
 		 1131 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  29.07 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  30.11 
 
 		 601 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  29.5 
 
 		 553 aa  180  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  29.79 
 
 		 532 aa  180  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  29.53 
 
 		 596 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  26.81 
 
 		 1106 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  29.53 
 
 		 596 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  29.53 
 
 		 596 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>