More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0777 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 532 aa  1091    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  60.78 
 
 		 533 aa  635    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  61.3 
 
 		 541 aa  636    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  78.79 
 
 		 525 aa  878    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  61.48 
 
 		 541 aa  640    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  58.27 
 
 		 540 aa  605  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  56.56 
 
 		 536 aa  602  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  55.6 
 
 		 553 aa  599  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  57.49 
 
 		 538 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  55.45 
 
 		 545 aa  586  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  53.63 
 
 		 535 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  57.14 
 
 		 539 aa  580  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  55.53 
 
 		 538 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  56.61 
 
 		 542 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  55.99 
 
 		 540 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  57.01 
 
 		 528 aa  568  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  55.72 
 
 		 537 aa  556  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  52.79 
 
 		 543 aa  558  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  55.43 
 
 		 530 aa  555  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  54.15 
 
 		 529 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  54.41 
 
 		 540 aa  551  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  54.22 
 
 		 524 aa  548  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  54.6 
 
 		 535 aa  545  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  55.97 
 
 		 546 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  59.73 
 
 		 448 aa  541  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  54.73 
 
 		 542 aa  524  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  50.94 
 
 		 547 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  49.26 
 
 		 549 aa  473  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3483  alpha amylase catalytic region  50.57 
 
 		 542 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906486  normal  0.657022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  46.35 
 
 		 518 aa  431  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  46.55 
 
 		 574 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  45.88 
 
 		 575 aa  413  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  44.15 
 
 		 537 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  44.86 
 
 		 568 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  42.55 
 
 		 550 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  42.99 
 
 		 564 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  42.36 
 
 		 553 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  43.47 
 
 		 540 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  42.44 
 
 		 555 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  42.07 
 
 		 540 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  43.86 
 
 		 536 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  40.67 
 
 		 563 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  39.65 
 
 		 563 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  42.36 
 
 		 547 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  41.02 
 
 		 530 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2133  alpha amylase, catalytic region  42.86 
 
 		 540 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1788  alpha amylase, catalytic region  39.41 
 
 		 544 aa  391  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  39.05 
 
 		 557 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2311  alpha amylase, catalytic region  41.21 
 
 		 540 aa  391  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.679266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0303  alpha amylase catalytic region  44.67 
 
 		 557 aa  392  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  41.92 
 
 		 550 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2299  alpha amylase catalytic region  42.04 
 
 		 540 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.823743 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  39.79 
 
 		 562 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4573  hypothetical protein  42.24 
 
 		 540 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2287  alpha amylase catalytic region  42.24 
 
 		 540 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  42.24 
 
 		 540 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  41.33 
 
 		 541 aa  388  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  42.75 
 
 		 540 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  42.53 
 
 		 550 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  44.61 
 
 		 538 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2086  alpha amylase catalytic region  41.84 
 
 		 540 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  41.43 
 
 		 550 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  43.22 
 
 		 536 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  41.7 
 
 		 552 aa  385  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  43.17 
 
 		 534 aa  383  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  39.78 
 
 		 544 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1328  alpha amylase catalytic region  43.93 
 
 		 546 aa  382  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  43.05 
 
 		 536 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  41.96 
 
 		 586 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  39.65 
 
 		 562 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3112  alpha amylase protein  42.52 
 
 		 535 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.364914  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  40.62 
 
 		 541 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  43.11 
 
 		 543 aa  379  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  44.22 
 
 		 540 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  41.59 
 
 		 600 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  41.57 
 
 		 548 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2620  alpha amylase catalytic region  41.03 
 
 		 560 aa  375  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  44.17 
 
 		 538 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  39.96 
 
 		 540 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2028  alpha amylase, catalytic region  39.12 
 
 		 557 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  42.34 
 
 		 557 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4341  alpha amylase catalytic region  40.52 
 
 		 539 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  42.05 
 
 		 537 aa  378  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.39 
 
 		 560 aa  378  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  41.15 
 
 		 548 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  40.07 
 
 		 563 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  38.11 
 
 		 558 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  37.46 
 
 		 558 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  40.62 
 
 		 538 aa  375  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  37.94 
 
 		 558 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  37.94 
 
 		 558 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1891  alpha amylase, catalytic region  42.83 
 
 		 544 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687574  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  39.4 
 
 		 582 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  37.8 
 
 		 558 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  42.22 
 
 		 522 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  38.64 
 
 		 559 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  38.11 
 
 		 558 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  38.34 
 
 		 554 aa  375  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0295  alpha amylase catalytic region  41.05 
 
 		 551 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  38.52 
 
 		 554 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>