More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4246 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  60.2 
 
 		 583 aa  709    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 593 aa  1200    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  89.21 
 
 		 595 aa  1055    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  50.98 
 
 		 545 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  50.33 
 
 		 541 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  49.89 
 
 		 541 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  47.28 
 
 		 588 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  43.94 
 
 		 558 aa  408  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  43.12 
 
 		 515 aa  360  5e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  41.33 
 
 		 499 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  40.9 
 
 		 654 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  39.77 
 
 		 509 aa  323  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  42.02 
 
 		 522 aa  318  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  37.16 
 
 		 549 aa  317  4e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  35 
 
 		 535 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  35.09 
 
 		 575 aa  288  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  34.25 
 
 		 606 aa  287  5e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4138  alpha amylase catalytic region  40.85 
 
 		 541 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  34.09 
 
 		 577 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0589  glycosidases-like  37.07 
 
 		 705 aa  281  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.361866  normal  0.0110561 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  36.29 
 
 		 493 aa  278  3e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  33.03 
 
 		 682 aa  278  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  33.27 
 
 		 562 aa  276  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  34.59 
 
 		 585 aa  274  4.0000000000000004e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0549  alpha amylase catalytic region  39.4 
 
 		 537 aa  273  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  37.82 
 
 		 555 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  38 
 
 		 555 aa  271  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  36.28 
 
 		 572 aa  271  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  33.91 
 
 		 540 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  34.31 
 
 		 601 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  32.77 
 
 		 554 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  33.53 
 
 		 591 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0553  alpha amylase catalytic region  38.97 
 
 		 537 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  33.07 
 
 		 543 aa  268  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  35.18 
 
 		 564 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  32.75 
 
 		 567 aa  267  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  33.08 
 
 		 554 aa  266  7e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  33.73 
 
 		 556 aa  266  8.999999999999999e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  34.93 
 
 		 545 aa  265  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  34.86 
 
 		 536 aa  264  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  32.56 
 
 		 554 aa  264  4e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  34.19 
 
 		 588 aa  263  6.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  35.11 
 
 		 532 aa  263  8.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  35.38 
 
 		 525 aa  261  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  31.78 
 
 		 554 aa  261  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  34.73 
 
 		 553 aa  260  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  33.53 
 
 		 1138 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  32.25 
 
 		 600 aa  259  9e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  34.81 
 
 		 572 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  33.6 
 
 		 551 aa  259  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  34.59 
 
 		 529 aa  259  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2621  alpha amylase catalytic region  34.73 
 
 		 554 aa  258  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  34.81 
 
 		 572 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  32.93 
 
 		 591 aa  258  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  34.83 
 
 		 567 aa  258  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  31.61 
 
 		 554 aa  258  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  35.01 
 
 		 553 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  33.79 
 
 		 553 aa  258  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  34.35 
 
 		 553 aa  257  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  33.33 
 
 		 1137 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  33.33 
 
 		 1137 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  33.33 
 
 		 1137 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  32.05 
 
 		 1115 aa  256  7e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  32.82 
 
 		 562 aa  256  8e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  32.13 
 
 		 1154 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  33.13 
 
 		 1136 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  33.84 
 
 		 587 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  34.33 
 
 		 554 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  32.25 
 
 		 557 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1251  Alpha amylase, catalytic region  31.85 
 
 		 561 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  34.21 
 
 		 538 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  32.76 
 
 		 582 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  35.45 
 
 		 575 aa  254  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  32.8 
 
 		 574 aa  254  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  32.73 
 
 		 1137 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  32.08 
 
 		 562 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  31.97 
 
 		 1152 aa  253  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  32.72 
 
 		 1101 aa  252  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  32.73 
 
 		 1137 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  34.51 
 
 		 524 aa  252  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  33.08 
 
 		 1113 aa  252  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0520  Alpha amylase  36.92 
 
 		 537 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  33.52 
 
 		 551 aa  251  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  33.21 
 
 		 1093 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  32.6 
 
 		 572 aa  251  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  34.94 
 
 		 574 aa  251  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  31.42 
 
 		 554 aa  251  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  31.45 
 
 		 598 aa  251  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  32.48 
 
 		 1154 aa  250  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  33.52 
 
 		 578 aa  250  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  31.6 
 
 		 555 aa  250  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  36.36 
 
 		 530 aa  250  6e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  32.49 
 
 		 1100 aa  250  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  32.69 
 
 		 561 aa  249  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  33.66 
 
 		 553 aa  249  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  33.4 
 
 		 1119 aa  249  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  33.79 
 
 		 1109 aa  249  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  32.49 
 
 		 1100 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  33.2 
 
 		 1100 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  33.07 
 
 		 556 aa  249  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>