More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4280 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 541 aa  1076    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  96.67 
 
 		 541 aa  984    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  92.79 
 
 		 545 aa  939    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  56.18 
 
 		 588 aa  509  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  48.21 
 
 		 593 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  48.43 
 
 		 595 aa  418  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  47.44 
 
 		 583 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  42.01 
 
 		 499 aa  360  3e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  43.2 
 
 		 515 aa  356  5e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  41.42 
 
 		 558 aa  327  4.0000000000000003e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  38.45 
 
 		 654 aa  326  7e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  36.81 
 
 		 540 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  36.56 
 
 		 575 aa  320  6e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  39.03 
 
 		 522 aa  319  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  39 
 
 		 538 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  37.93 
 
 		 529 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  37.64 
 
 		 568 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  36.62 
 
 		 682 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  35.92 
 
 		 553 aa  300  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  39.76 
 
 		 540 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  37.52 
 
 		 540 aa  299  7e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  36.54 
 
 		 1115 aa  299  7e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  37.75 
 
 		 509 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  36.63 
 
 		 1131 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  36.63 
 
 		 1131 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  36.63 
 
 		 1131 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  33.16 
 
 		 557 aa  298  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  35.39 
 
 		 1137 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  39.24 
 
 		 535 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  36.63 
 
 		 1131 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  36.63 
 
 		 1131 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  36.63 
 
 		 1131 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  36.13 
 
 		 548 aa  297  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  35.16 
 
 		 532 aa  297  4e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  35.21 
 
 		 1137 aa  297  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  35.58 
 
 		 1137 aa  297  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  39.36 
 
 		 530 aa  297  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  35.58 
 
 		 1137 aa  297  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  35.58 
 
 		 1137 aa  297  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  34.6 
 
 		 543 aa  296  9e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  36.49 
 
 		 536 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  36.13 
 
 		 541 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  35.21 
 
 		 1136 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  34.53 
 
 		 1154 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  35.28 
 
 		 1101 aa  294  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  35.91 
 
 		 1138 aa  294  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  39.5 
 
 		 542 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  38.28 
 
 		 539 aa  293  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  35.95 
 
 		 606 aa  293  4e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  37.04 
 
 		 525 aa  293  4e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  36.47 
 
 		 549 aa  293  8e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  36.48 
 
 		 572 aa  291  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  38.09 
 
 		 564 aa  292  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  33.9 
 
 		 535 aa  292  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  35.86 
 
 		 1088 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  35.86 
 
 		 1088 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  36.26 
 
 		 541 aa  291  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  36.02 
 
 		 551 aa  290  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  35.74 
 
 		 1100 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  33.94 
 
 		 562 aa  290  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  38.35 
 
 		 538 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  34.1 
 
 		 1154 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  36.71 
 
 		 601 aa  289  7e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  36.35 
 
 		 1088 aa  289  8e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  35.26 
 
 		 1088 aa  289  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  35.74 
 
 		 1100 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  35.66 
 
 		 545 aa  289  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  35.21 
 
 		 1111 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  36.27 
 
 		 1102 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  36.27 
 
 		 1102 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  36.27 
 
 		 1102 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  35.93 
 
 		 1093 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  34.94 
 
 		 1100 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  36.02 
 
 		 574 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  35.98 
 
 		 577 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  35.09 
 
 		 577 aa  287  4e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  34.49 
 
 		 554 aa  287  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  39.4 
 
 		 528 aa  286  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  35.95 
 
 		 1093 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  36.27 
 
 		 1088 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  36.65 
 
 		 1160 aa  286  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  35.77 
 
 		 1113 aa  286  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  35.67 
 
 		 1101 aa  286  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  35.95 
 
 		 1085 aa  286  8e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  34.1 
 
 		 535 aa  286  9e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  33.27 
 
 		 1152 aa  286  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  36.4 
 
 		 1088 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  35.56 
 
 		 1104 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  35.12 
 
 		 591 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  35.55 
 
 		 562 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  35.69 
 
 		 1142 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  35.13 
 
 		 1100 aa  285  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  38.02 
 
 		 567 aa  284  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  34.86 
 
 		 1092 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  35.47 
 
 		 1100 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  36.74 
 
 		 575 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  31.02 
 
 		 559 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  36.47 
 
 		 556 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  36.25 
 
 		 1164 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  36.25 
 
 		 1164 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>