More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0356 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 564 aa  1173    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  49.63 
 
 		 568 aa  544  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  45.58 
 
 		 549 aa  444  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  42.83 
 
 		 543 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  42.06 
 
 		 575 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  43.93 
 
 		 553 aa  430  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  40.87 
 
 		 574 aa  429  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  43.63 
 
 		 529 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  43.58 
 
 		 540 aa  413  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  42.51 
 
 		 535 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2287  alpha amylase catalytic region  40.11 
 
 		 540 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2299  alpha amylase catalytic region  40.11 
 
 		 540 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.823743 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  40.29 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4573  hypothetical protein  40.11 
 
 		 540 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2086  alpha amylase catalytic region  39.93 
 
 		 540 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  43.71 
 
 		 525 aa  402  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  42.2 
 
 		 555 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  40.98 
 
 		 536 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  42.99 
 
 		 532 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  40.72 
 
 		 547 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  41.25 
 
 		 541 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  39.38 
 
 		 540 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  43.64 
 
 		 541 aa  398  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  41.19 
 
 		 538 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  40.99 
 
 		 540 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1788  alpha amylase, catalytic region  39.89 
 
 		 544 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  43.28 
 
 		 541 aa  397  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  41 
 
 		 530 aa  395  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2133  alpha amylase, catalytic region  40.4 
 
 		 540 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  39.93 
 
 		 550 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2311  alpha amylase, catalytic region  40.59 
 
 		 540 aa  395  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.679266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  39.64 
 
 		 545 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0295  alpha amylase catalytic region  41.45 
 
 		 551 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  42.96 
 
 		 538 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  39.56 
 
 		 550 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  38.29 
 
 		 586 aa  389  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  41.02 
 
 		 550 aa  388  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  40.79 
 
 		 544 aa  386  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  39.96 
 
 		 539 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  42.49 
 
 		 542 aa  383  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  40.7 
 
 		 537 aa  385  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  40.83 
 
 		 533 aa  383  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  37.97 
 
 		 541 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  40.16 
 
 		 537 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  40.73 
 
 		 554 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4341  alpha amylase catalytic region  39.06 
 
 		 539 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  39.49 
 
 		 550 aa  382  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  41.79 
 
 		 530 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  40.8 
 
 		 552 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  42.3 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  41.75 
 
 		 536 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  41.35 
 
 		 540 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  41.34 
 
 		 548 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  40.61 
 
 		 555 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  41.94 
 
 		 536 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  38.62 
 
 		 538 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  38.15 
 
 		 553 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  39.23 
 
 		 540 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  37.19 
 
 		 556 aa  375  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  40.55 
 
 		 548 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  41.83 
 
 		 528 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  36.9 
 
 		 563 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  41.44 
 
 		 546 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  42.12 
 
 		 536 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.36 
 
 		 538 aa  369  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  42.07 
 
 		 540 aa  369  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  42.83 
 
 		 542 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  37.37 
 
 		 562 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  38.49 
 
 		 556 aa  364  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  44.62 
 
 		 448 aa  364  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  38.45 
 
 		 543 aa  363  4e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  38.53 
 
 		 600 aa  362  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2954  alpha amylase catalytic region  37.68 
 
 		 549 aa  361  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067439 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  37.79 
 
 		 557 aa  360  4e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0184  alpha amylase, catalytic region  38.39 
 
 		 547 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  38.86 
 
 		 562 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  36.96 
 
 		 578 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2028  alpha amylase, catalytic region  36.65 
 
 		 557 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  37.91 
 
 		 547 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3326  alpha amylase catalytic region  38.51 
 
 		 547 aa  355  8.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  42.14 
 
 		 535 aa  355  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  37.32 
 
 		 568 aa  355  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  36.62 
 
 		 582 aa  354  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  38.87 
 
 		 537 aa  354  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  39 
 
 		 540 aa  353  7e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  38.02 
 
 		 557 aa  352  8e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  36.74 
 
 		 554 aa  351  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1251  Alpha amylase, catalytic region  38.18 
 
 		 561 aa  350  4e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3625  alpha amylase catalytic region  38.55 
 
 		 571 aa  347  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  38.63 
 
 		 515 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  35.01 
 
 		 558 aa  346  5e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  35.01 
 
 		 558 aa  346  5e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  35.59 
 
 		 560 aa  345  1e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  37.26 
 
 		 551 aa  344  2e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  34.83 
 
 		 558 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  34.83 
 
 		 558 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  34.83 
 
 		 558 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  34.83 
 
 		 558 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  36.17 
 
 		 558 aa  343  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  35.21 
 
 		 556 aa  343  5.999999999999999e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>