More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7974 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3483  alpha amylase catalytic region  68.12 
 
 		 542 aa  655    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906486  normal  0.657022 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 547 aa  1093    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  52.38 
 
 		 529 aa  554  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  51.63 
 
 		 538 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  50.47 
 
 		 538 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  48.99 
 
 		 553 aa  530  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  52.34 
 
 		 541 aa  525  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  52.01 
 
 		 540 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  50 
 
 		 540 aa  525  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  50.84 
 
 		 545 aa  527  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  51.77 
 
 		 541 aa  523  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  52.28 
 
 		 542 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  49.05 
 
 		 535 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  48.11 
 
 		 543 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  49.43 
 
 		 536 aa  508  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  50.95 
 
 		 528 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  50.94 
 
 		 532 aa  496  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  48.87 
 
 		 525 aa  483  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  49.62 
 
 		 539 aa  473  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  49.81 
 
 		 546 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  46.95 
 
 		 537 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  47.62 
 
 		 540 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  49.33 
 
 		 530 aa  463  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  48.19 
 
 		 535 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  53.33 
 
 		 448 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  48.61 
 
 		 524 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  48.3 
 
 		 533 aa  453  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  48.11 
 
 		 542 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  44.76 
 
 		 549 aa  430  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  43.95 
 
 		 518 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  43.93 
 
 		 575 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  43.03 
 
 		 574 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  40.35 
 
 		 568 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  38.46 
 
 		 586 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  39.6 
 
 		 541 aa  368  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  41.68 
 
 		 537 aa  365  1e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  40.12 
 
 		 555 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  38.45 
 
 		 540 aa  362  7.0000000000000005e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1788  alpha amylase, catalytic region  38.3 
 
 		 544 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  40.86 
 
 		 536 aa  362  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4573  hypothetical protein  37.4 
 
 		 540 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  40.66 
 
 		 536 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2287  alpha amylase catalytic region  37.4 
 
 		 540 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  38.14 
 
 		 540 aa  360  5e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  37.62 
 
 		 540 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2299  alpha amylase catalytic region  37.43 
 
 		 540 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.823743 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1251  Alpha amylase, catalytic region  38.62 
 
 		 561 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  37.62 
 
 		 540 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2086  alpha amylase catalytic region  37.24 
 
 		 540 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  37.91 
 
 		 564 aa  355  8.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2311  alpha amylase, catalytic region  37.55 
 
 		 540 aa  355  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.679266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2133  alpha amylase, catalytic region  37.75 
 
 		 540 aa  354  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.71 
 
 		 515 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  36.88 
 
 		 544 aa  352  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  40.56 
 
 		 537 aa  351  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  37.31 
 
 		 550 aa  350  4e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  36.12 
 
 		 554 aa  350  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  37.5 
 
 		 562 aa  349  6e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  36.1 
 
 		 554 aa  349  7e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  37.4 
 
 		 538 aa  348  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  36.49 
 
 		 551 aa  347  3e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  35.74 
 
 		 554 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  39.66 
 
 		 552 aa  347  4e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  35.92 
 
 		 554 aa  346  5e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  35.92 
 
 		 554 aa  346  5e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  35.92 
 
 		 554 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  35.92 
 
 		 554 aa  346  5e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  39.66 
 
 		 556 aa  346  7e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4341  alpha amylase catalytic region  39.08 
 
 		 539 aa  346  8e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  38.72 
 
 		 536 aa  345  8e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  35.21 
 
 		 562 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  35.38 
 
 		 554 aa  343  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1891  alpha amylase, catalytic region  41.45 
 
 		 544 aa  343  4e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  35.2 
 
 		 554 aa  343  5e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  37.48 
 
 		 550 aa  343  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  34.33 
 
 		 563 aa  343  5e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  35.02 
 
 		 554 aa  342  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0184  alpha amylase, catalytic region  40.15 
 
 		 547 aa  342  1e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  37.23 
 
 		 541 aa  341  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  36.5 
 
 		 563 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  38.14 
 
 		 553 aa  340  2.9999999999999998e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  37.48 
 
 		 550 aa  340  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  34.9 
 
 		 560 aa  339  5.9999999999999996e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  35.43 
 
 		 557 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  36.13 
 
 		 530 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  39.92 
 
 		 550 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  35.52 
 
 		 554 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1328  alpha amylase catalytic region  41.27 
 
 		 546 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  38.6 
 
 		 600 aa  337  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  41.57 
 
 		 557 aa  337  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  34.04 
 
 		 559 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  37.98 
 
 		 568 aa  336  5.999999999999999e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  41.47 
 
 		 572 aa  336  7e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  35.33 
 
 		 554 aa  336  7e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  34.41 
 
 		 554 aa  336  7e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  35.74 
 
 		 549 aa  334  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  35.74 
 
 		 549 aa  334  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  38.68 
 
 		 540 aa  333  5e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  34.74 
 
 		 558 aa  333  6e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  36.5 
 
 		 582 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>