More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0921 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  100 
 
 		 568 aa  1177    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  48.35 
 
 		 564 aa  551  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  45.74 
 
 		 540 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  43.91 
 
 		 529 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  43.01 
 
 		 575 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  44.51 
 
 		 538 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  41.7 
 
 		 574 aa  433  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  42.73 
 
 		 553 aa  427  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  42.8 
 
 		 543 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  44.27 
 
 		 535 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  43.71 
 
 		 530 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  45.22 
 
 		 549 aa  425  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  45.47 
 
 		 541 aa  421  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  42.17 
 
 		 545 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  45.91 
 
 		 525 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  45.6 
 
 		 538 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  41.86 
 
 		 536 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  45.54 
 
 		 541 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2086  alpha amylase catalytic region  39.63 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  39.63 
 
 		 540 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  41.12 
 
 		 550 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2299  alpha amylase catalytic region  39.63 
 
 		 540 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.823743 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  38.33 
 
 		 586 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  44.86 
 
 		 532 aa  406  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  41.65 
 
 		 553 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4573  hypothetical protein  39.07 
 
 		 540 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2287  alpha amylase catalytic region  39.07 
 
 		 540 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  41.58 
 
 		 544 aa  405  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  45.62 
 
 		 540 aa  405  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  40.59 
 
 		 540 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  40.31 
 
 		 550 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  44.69 
 
 		 540 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  44.31 
 
 		 542 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  40.5 
 
 		 550 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  40.81 
 
 		 552 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1788  alpha amylase, catalytic region  41.43 
 
 		 544 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2311  alpha amylase, catalytic region  39.85 
 
 		 540 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.679266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  41.62 
 
 		 537 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  46.25 
 
 		 528 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  40.27 
 
 		 550 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  39.04 
 
 		 541 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  44.8 
 
 		 535 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  39.41 
 
 		 540 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2133  alpha amylase, catalytic region  39.85 
 
 		 540 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  39.85 
 
 		 540 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  41.37 
 
 		 555 aa  398  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  41.6 
 
 		 533 aa  392  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  37.68 
 
 		 556 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  46.26 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  41.79 
 
 		 537 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  39.04 
 
 		 541 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  39.52 
 
 		 538 aa  386  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  41.27 
 
 		 542 aa  386  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  37.84 
 
 		 554 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0295  alpha amylase catalytic region  38.2 
 
 		 551 aa  385  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  38.67 
 
 		 555 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2028  alpha amylase, catalytic region  40.32 
 
 		 557 aa  385  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  37.48 
 
 		 554 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2954  alpha amylase catalytic region  41.67 
 
 		 549 aa  385  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067439 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  43.79 
 
 		 524 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3326  alpha amylase catalytic region  38.03 
 
 		 547 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  38.05 
 
 		 563 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  38.98 
 
 		 557 aa  379  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  41.48 
 
 		 539 aa  378  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  39.81 
 
 		 537 aa  378  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  41.41 
 
 		 530 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  37.46 
 
 		 563 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  37.57 
 
 		 554 aa  378  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  36.96 
 
 		 568 aa  375  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  37.75 
 
 		 554 aa  378  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  44.29 
 
 		 546 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  38.34 
 
 		 562 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  38.97 
 
 		 578 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  40.35 
 
 		 547 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  38.25 
 
 		 559 aa  372  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4341  alpha amylase catalytic region  38.79 
 
 		 539 aa  372  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.41 
 
 		 538 aa  370  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  38.2 
 
 		 562 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  39.92 
 
 		 547 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  38.68 
 
 		 554 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  36.9 
 
 		 554 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  38.12 
 
 		 558 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  38.51 
 
 		 548 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  35.74 
 
 		 554 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  38.8 
 
 		 557 aa  369  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  36.43 
 
 		 554 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  37.93 
 
 		 558 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  38.98 
 
 		 556 aa  369  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  39.68 
 
 		 536 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  38.11 
 
 		 548 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  39.28 
 
 		 536 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  35.79 
 
 		 558 aa  364  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0184  alpha amylase, catalytic region  40.78 
 
 		 547 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  36.12 
 
 		 554 aa  363  6e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  36.48 
 
 		 554 aa  363  6e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  39.81 
 
 		 560 aa  363  6e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  38.88 
 
 		 536 aa  362  8e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  37.36 
 
 		 558 aa  362  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  36.54 
 
 		 554 aa  362  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  37.81 
 
 		 558 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>