More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0672 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  60.78 
 
 		 532 aa  635    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 533 aa  1084    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  60 
 
 		 541 aa  625  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  59.15 
 
 		 541 aa  617  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  57.79 
 
 		 525 aa  612  9.999999999999999e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  56.02 
 
 		 553 aa  599  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  58.1 
 
 		 540 aa  586  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  58.08 
 
 		 528 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  58.03 
 
 		 540 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  59.92 
 
 		 524 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  57.56 
 
 		 539 aa  567  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  61.02 
 
 		 535 aa  567  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  55.76 
 
 		 538 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  55.22 
 
 		 536 aa  562  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  54.66 
 
 		 538 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  58.19 
 
 		 546 aa  558  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  53.61 
 
 		 529 aa  555  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  55.85 
 
 		 535 aa  556  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  62.61 
 
 		 448 aa  548  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  55.2 
 
 		 540 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  54.58 
 
 		 545 aa  548  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  54.88 
 
 		 530 aa  542  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  51.25 
 
 		 543 aa  534  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  54.87 
 
 		 542 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  52.65 
 
 		 537 aa  528  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  54.76 
 
 		 542 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  48.3 
 
 		 547 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  49.11 
 
 		 549 aa  451  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  45.76 
 
 		 518 aa  430  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3483  alpha amylase catalytic region  48.04 
 
 		 542 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906486  normal  0.657022 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4341  alpha amylase catalytic region  44.4 
 
 		 539 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  42.1 
 
 		 541 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  45.08 
 
 		 537 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2299  alpha amylase catalytic region  42.51 
 
 		 540 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.823743 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4573  hypothetical protein  42.71 
 
 		 540 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2287  alpha amylase catalytic region  42.71 
 
 		 540 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  42.51 
 
 		 540 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2086  alpha amylase catalytic region  42.32 
 
 		 540 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  43.38 
 
 		 553 aa  404  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1788  alpha amylase, catalytic region  40.22 
 
 		 544 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  44.65 
 
 		 536 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  41.25 
 
 		 540 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  44.57 
 
 		 547 aa  401  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  43.75 
 
 		 550 aa  402  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  42 
 
 		 540 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  42.74 
 
 		 555 aa  401  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2311  alpha amylase, catalytic region  41.73 
 
 		 540 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.679266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  44.85 
 
 		 536 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  43.46 
 
 		 550 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  44.42 
 
 		 537 aa  398  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  42.55 
 
 		 550 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2133  alpha amylase, catalytic region  41.6 
 
 		 540 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  41.17 
 
 		 556 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.44 
 
 		 515 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  40.04 
 
 		 540 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  41.6 
 
 		 568 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  38.48 
 
 		 563 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.84 
 
 		 560 aa  394  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  42.2 
 
 		 544 aa  395  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  42.55 
 
 		 550 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0295  alpha amylase catalytic region  42.53 
 
 		 551 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  40.78 
 
 		 541 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  38.19 
 
 		 557 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  37.46 
 
 		 563 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  43.7 
 
 		 536 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  42.45 
 
 		 552 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  40.59 
 
 		 548 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  40.83 
 
 		 564 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3326  alpha amylase catalytic region  40.77 
 
 		 547 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  41.8 
 
 		 575 aa  385  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  40.16 
 
 		 548 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  40.79 
 
 		 538 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  40.92 
 
 		 555 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  40.43 
 
 		 586 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  37.24 
 
 		 561 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  43.36 
 
 		 574 aa  381  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  39.06 
 
 		 570 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  38.86 
 
 		 530 aa  379  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  38.45 
 
 		 562 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2028  alpha amylase, catalytic region  39.53 
 
 		 557 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.06 
 
 		 561 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  37.19 
 
 		 562 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  37.19 
 
 		 582 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  41.58 
 
 		 543 aa  373  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.66 
 
 		 562 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1251  Alpha amylase, catalytic region  37.77 
 
 		 561 aa  371  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0184  alpha amylase, catalytic region  42.57 
 
 		 547 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.12 
 
 		 556 aa  369  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  37.21 
 
 		 563 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.18 
 
 		 550 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4800  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.18 
 
 		 550 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.235757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.18 
 
 		 550 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  43.98 
 
 		 534 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.62 
 
 		 560 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4834  trehalose-6-phosphate hydrolase  40 
 
 		 550 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  39.45 
 
 		 606 aa  365  1e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  41.32 
 
 		 572 aa  364  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4705  trehalose-6-phosphate hydrolase  39.82 
 
 		 550 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0221451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1328  alpha amylase catalytic region  45.1 
 
 		 546 aa  363  4e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0303  alpha amylase catalytic region  41.44 
 
 		 557 aa  362  8e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>