More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0261 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  100 
 
 		 537 aa  1106    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4341  alpha amylase catalytic region  66.17 
 
 		 539 aa  741    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  55.95 
 
 		 538 aa  634  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  56.6 
 
 		 540 aa  633  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3326  alpha amylase catalytic region  60.52 
 
 		 547 aa  634  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  56.26 
 
 		 550 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2028  alpha amylase, catalytic region  57.54 
 
 		 557 aa  630  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  58.48 
 
 		 537 aa  629  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  56.9 
 
 		 550 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2299  alpha amylase catalytic region  55.7 
 
 		 540 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.823743 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  58.76 
 
 		 541 aa  627  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  55.7 
 
 		 540 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4573  hypothetical protein  55.51 
 
 		 540 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2287  alpha amylase catalytic region  55.51 
 
 		 540 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  56.32 
 
 		 555 aa  619  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3128  alpha amylase, catalytic region  59.96 
 
 		 542 aa  619  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209805  normal  0.0115348 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2086  alpha amylase catalytic region  55.33 
 
 		 540 aa  621  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  54.66 
 
 		 586 aa  619  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  55.2 
 
 		 540 aa  615  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0295  alpha amylase catalytic region  57.36 
 
 		 551 aa  617  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  54.26 
 
 		 541 aa  615  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  57.46 
 
 		 547 aa  613  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2311  alpha amylase, catalytic region  54.95 
 
 		 540 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.679266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  54.11 
 
 		 556 aa  612  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  56.4 
 
 		 544 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  55.14 
 
 		 540 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1788  alpha amylase, catalytic region  53.35 
 
 		 544 aa  609  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  55.53 
 
 		 550 aa  607  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2133  alpha amylase, catalytic region  54.77 
 
 		 540 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  55.45 
 
 		 548 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  55.2 
 
 		 548 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  54.95 
 
 		 550 aa  601  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  57.59 
 
 		 552 aa  597  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  58.48 
 
 		 553 aa  590  1e-167  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  55.66 
 
 		 536 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2620  alpha amylase catalytic region  57.6 
 
 		 560 aa  582  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  55.66 
 
 		 536 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  54.53 
 
 		 536 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  55.86 
 
 		 557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  56.07 
 
 		 530 aa  575  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  53.6 
 
 		 540 aa  539  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  51.14 
 
 		 543 aa  533  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3112  alpha amylase protein  50.75 
 
 		 535 aa  513  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.364914  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1891  alpha amylase, catalytic region  51.2 
 
 		 544 aa  502  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687574  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2954  alpha amylase catalytic region  49.5 
 
 		 549 aa  492  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067439 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0184  alpha amylase, catalytic region  47.58 
 
 		 547 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  45.28 
 
 		 549 aa  449  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  44.44 
 
 		 553 aa  438  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  46.4 
 
 		 538 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  43.87 
 
 		 529 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  47.35 
 
 		 538 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  45.31 
 
 		 525 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  41.51 
 
 		 535 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  47.35 
 
 		 540 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  44.53 
 
 		 541 aa  411  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  45.53 
 
 		 541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  44.15 
 
 		 532 aa  406  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  45.08 
 
 		 533 aa  408  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  43.44 
 
 		 540 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  41.26 
 
 		 543 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  44.89 
 
 		 530 aa  401  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  43.82 
 
 		 536 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  44.84 
 
 		 540 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  43.69 
 
 		 539 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  45.66 
 
 		 542 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  45.13 
 
 		 535 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  44.36 
 
 		 528 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  45.11 
 
 		 542 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  46.26 
 
 		 537 aa  393  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  42.37 
 
 		 545 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  40.67 
 
 		 575 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  44.27 
 
 		 524 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  46.33 
 
 		 448 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  40.7 
 
 		 564 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  41.59 
 
 		 574 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  39.81 
 
 		 568 aa  379  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  43.19 
 
 		 546 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  44.4 
 
 		 550 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  42.97 
 
 		 518 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  40.56 
 
 		 547 aa  351  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  36.96 
 
 		 563 aa  351  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3898  alpha amylase catalytic region  43.58 
 
 		 526 aa  350  3e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.237178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.29 
 
 		 515 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  36.4 
 
 		 551 aa  340  4e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  40.3 
 
 		 735 aa  339  7e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  35.7 
 
 		 549 aa  339  9e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  35.7 
 
 		 549 aa  339  9e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  44.15 
 
 		 545 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  40.98 
 
 		 533 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  41.6 
 
 		 522 aa  337  2.9999999999999997e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  35.9 
 
 		 562 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  36.01 
 
 		 562 aa  331  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  40.8 
 
 		 587 aa  331  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  42.58 
 
 		 538 aa  330  6e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3483  alpha amylase catalytic region  40.61 
 
 		 542 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906486  normal  0.657022 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  37.7 
 
 		 572 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  37.01 
 
 		 570 aa  328  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  43.37 
 
 		 538 aa  327  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  35.9 
 
 		 557 aa  327  3e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0303  alpha amylase catalytic region  38.72 
 
 		 557 aa  327  4.0000000000000003e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>