More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1949 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  62.71 
 
 		 550 aa  695    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  71.27 
 
 		 552 aa  839    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  100 
 
 		 553 aa  1148    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  72.05 
 
 		 550 aa  835    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0295  alpha amylase catalytic region  65.5 
 
 		 551 aa  696    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  64.55 
 
 		 550 aa  705    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  64.55 
 
 		 550 aa  707    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  58.35 
 
 		 548 aa  631  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  58.5 
 
 		 555 aa  626  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  57.74 
 
 		 548 aa  624  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  58.29 
 
 		 547 aa  619  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  58.82 
 
 		 537 aa  617  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  55.49 
 
 		 556 aa  606  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3326  alpha amylase catalytic region  56.18 
 
 		 547 aa  599  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  55.24 
 
 		 544 aa  596  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  58.48 
 
 		 537 aa  590  1e-167  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2028  alpha amylase, catalytic region  55.38 
 
 		 557 aa  586  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  56.71 
 
 		 586 aa  586  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  55.12 
 
 		 540 aa  580  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  55.29 
 
 		 541 aa  578  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4341  alpha amylase catalytic region  55.98 
 
 		 539 aa  580  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  56.22 
 
 		 530 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1788  alpha amylase, catalytic region  53.91 
 
 		 544 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  54.82 
 
 		 541 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  55.16 
 
 		 536 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  55.16 
 
 		 536 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  54.58 
 
 		 540 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2311  alpha amylase, catalytic region  52.52 
 
 		 540 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.679266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  53.31 
 
 		 540 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2299  alpha amylase catalytic region  53.31 
 
 		 540 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.823743 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2086  alpha amylase catalytic region  53.31 
 
 		 540 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4573  hypothetical protein  53.31 
 
 		 540 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  54.96 
 
 		 536 aa  561  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2287  alpha amylase catalytic region  53.31 
 
 		 540 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  53.92 
 
 		 538 aa  556  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  52.52 
 
 		 540 aa  556  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2133  alpha amylase, catalytic region  53.97 
 
 		 540 aa  557  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  55.73 
 
 		 557 aa  542  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2620  alpha amylase catalytic region  53.83 
 
 		 560 aa  534  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3128  alpha amylase, catalytic region  54.96 
 
 		 542 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209805  normal  0.0115348 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1891  alpha amylase, catalytic region  50.83 
 
 		 544 aa  519  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687574  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3112  alpha amylase protein  52.47 
 
 		 535 aa  518  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.364914  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0184  alpha amylase, catalytic region  50 
 
 		 547 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  50.74 
 
 		 540 aa  507  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2954  alpha amylase catalytic region  46.8 
 
 		 549 aa  487  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067439 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  50.1 
 
 		 543 aa  484  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  44.87 
 
 		 538 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  44.78 
 
 		 529 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  41.85 
 
 		 540 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  43.08 
 
 		 549 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  44.29 
 
 		 525 aa  412  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  42.09 
 
 		 553 aa  411  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  44.97 
 
 		 541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  43.76 
 
 		 542 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  41.65 
 
 		 568 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  44.49 
 
 		 524 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  43.51 
 
 		 538 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  44.44 
 
 		 540 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  43.38 
 
 		 533 aa  404  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  41.33 
 
 		 535 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  44.33 
 
 		 541 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  39.96 
 
 		 543 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  42.36 
 
 		 532 aa  396  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  44.53 
 
 		 540 aa  398  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  44.6 
 
 		 535 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  42.38 
 
 		 536 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  42.15 
 
 		 530 aa  392  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  40.83 
 
 		 545 aa  388  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  42.47 
 
 		 528 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  40.91 
 
 		 539 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  43.7 
 
 		 537 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  42.43 
 
 		 542 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  38.15 
 
 		 564 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  44.25 
 
 		 448 aa  365  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  43.46 
 
 		 546 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  39.58 
 
 		 575 aa  353  5e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  37.81 
 
 		 574 aa  351  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3898  alpha amylase catalytic region  40.69 
 
 		 526 aa  349  6e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.237178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  38.62 
 
 		 518 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  37.85 
 
 		 600 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  38.14 
 
 		 547 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  37.01 
 
 		 562 aa  340  4e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  37.41 
 
 		 570 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  37.1 
 
 		 554 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.7 
 
 		 515 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  40.95 
 
 		 534 aa  334  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  36.38 
 
 		 568 aa  333  4e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  41.23 
 
 		 533 aa  332  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  34.49 
 
 		 563 aa  331  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  38 
 
 		 555 aa  331  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  36.74 
 
 		 555 aa  329  9e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  34.91 
 
 		 582 aa  327  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  35.39 
 
 		 577 aa  325  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1251  Alpha amylase, catalytic region  35.01 
 
 		 561 aa  325  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  35.67 
 
 		 554 aa  323  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  35.03 
 
 		 560 aa  324  3e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  35.93 
 
 		 562 aa  322  9.999999999999999e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  35.33 
 
 		 557 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  37.55 
 
 		 572 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  38.94 
 
 		 735 aa  318  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>