More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2620 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  55.8 
 
 		 540 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  56.88 
 
 		 540 aa  642    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2133  alpha amylase, catalytic region  55.07 
 
 		 540 aa  636    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  55.07 
 
 		 540 aa  638    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  54.53 
 
 		 540 aa  636    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2620  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 560 aa  1144    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2299  alpha amylase catalytic region  54.35 
 
 		 540 aa  635    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.823743 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2311  alpha amylase, catalytic region  54.89 
 
 		 540 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.679266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  57.17 
 
 		 544 aa  637    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4573  hypothetical protein  54.53 
 
 		 540 aa  635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2287  alpha amylase catalytic region  54.53 
 
 		 540 aa  635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  55.98 
 
 		 541 aa  646    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2086  alpha amylase catalytic region  54.35 
 
 		 540 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1788  alpha amylase, catalytic region  54.89 
 
 		 544 aa  630  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  52.47 
 
 		 586 aa  628  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  53.78 
 
 		 538 aa  621  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2028  alpha amylase, catalytic region  53.09 
 
 		 557 aa  616  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  56.08 
 
 		 537 aa  606  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3128  alpha amylase, catalytic region  59.25 
 
 		 542 aa  598  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209805  normal  0.0115348 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  53.69 
 
 		 550 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  57.6 
 
 		 537 aa  595  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  60 
 
 		 541 aa  593  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4341  alpha amylase catalytic region  53.24 
 
 		 539 aa  594  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  53.15 
 
 		 550 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  53.13 
 
 		 550 aa  580  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  52.78 
 
 		 548 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  52.51 
 
 		 556 aa  570  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  55.39 
 
 		 547 aa  568  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  53.49 
 
 		 555 aa  568  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0295  alpha amylase catalytic region  53.87 
 
 		 551 aa  561  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  52.24 
 
 		 548 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  52.42 
 
 		 557 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  53.2 
 
 		 550 aa  550  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  53.77 
 
 		 552 aa  549  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3326  alpha amylase catalytic region  51.17 
 
 		 547 aa  548  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  53.83 
 
 		 553 aa  541  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  53.25 
 
 		 530 aa  533  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  52.85 
 
 		 543 aa  519  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  52.8 
 
 		 540 aa  521  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  50.36 
 
 		 536 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  52.12 
 
 		 536 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  51.74 
 
 		 536 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3112  alpha amylase protein  48.26 
 
 		 535 aa  503  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.364914  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2954  alpha amylase catalytic region  48.29 
 
 		 549 aa  497  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067439 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0184  alpha amylase, catalytic region  50.68 
 
 		 547 aa  483  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1891  alpha amylase, catalytic region  47.46 
 
 		 544 aa  470  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687574  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  38.63 
 
 		 543 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  41.67 
 
 		 540 aa  395  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  42.67 
 
 		 549 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  43.06 
 
 		 541 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  38.04 
 
 		 535 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  41.3 
 
 		 538 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  38.61 
 
 		 545 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  40.34 
 
 		 553 aa  385  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  41.21 
 
 		 538 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  41.21 
 
 		 532 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  42.16 
 
 		 541 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  42.52 
 
 		 529 aa  382  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  41.01 
 
 		 525 aa  379  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  40.76 
 
 		 540 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  43.48 
 
 		 540 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  39.17 
 
 		 536 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  41.35 
 
 		 542 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  37.94 
 
 		 568 aa  365  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  43.69 
 
 		 530 aa  365  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  44.54 
 
 		 448 aa  365  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  45.27 
 
 		 535 aa  363  6e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  40.3 
 
 		 533 aa  355  1e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  40.44 
 
 		 575 aa  353  5e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  42.89 
 
 		 524 aa  353  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  39.56 
 
 		 539 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  36.48 
 
 		 564 aa  351  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  37.5 
 
 		 574 aa  348  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  44.06 
 
 		 537 aa  347  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  41.86 
 
 		 518 aa  345  8.999999999999999e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  44.47 
 
 		 546 aa  342  8e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  41.55 
 
 		 542 aa  340  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  43.69 
 
 		 528 aa  340  4e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1251  Alpha amylase, catalytic region  37.32 
 
 		 561 aa  332  1e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  38.68 
 
 		 547 aa  325  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.28 
 
 		 515 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3898  alpha amylase catalytic region  42.53 
 
 		 526 aa  319  9e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.237178 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  36.47 
 
 		 606 aa  317  5e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  41.25 
 
 		 522 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  39.61 
 
 		 543 aa  311  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1332  alpha amylase, catalytic domain protein  37.13 
 
 		 639 aa  311  2.9999999999999997e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.86601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  42.86 
 
 		 507 aa  310  5.9999999999999995e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  35.69 
 
 		 562 aa  309  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  41.6 
 
 		 550 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  39.04 
 
 		 587 aa  309  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  41.7 
 
 		 511 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  37.55 
 
 		 572 aa  306  6e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  38.86 
 
 		 533 aa  305  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  40.04 
 
 		 531 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  41.35 
 
 		 544 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  36.55 
 
 		 554 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  36.51 
 
 		 570 aa  303  6.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  35.19 
 
 		 563 aa  300  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  40.23 
 
 		 543 aa  300  6e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  35.47 
 
 		 554 aa  299  8e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>