More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4341 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4341  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 539 aa  1117    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  66.17 
 
 		 537 aa  755    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3326  alpha amylase catalytic region  56.17 
 
 		 547 aa  635    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  54.43 
 
 		 540 aa  634  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  53.47 
 
 		 586 aa  630  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  53.7 
 
 		 541 aa  626  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  54.24 
 
 		 550 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  54.8 
 
 		 550 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  52.87 
 
 		 540 aa  616  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2028  alpha amylase, catalytic region  51.44 
 
 		 557 aa  616  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  54.07 
 
 		 550 aa  615  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1788  alpha amylase, catalytic region  52.31 
 
 		 544 aa  617  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2311  alpha amylase, catalytic region  52.04 
 
 		 540 aa  617  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.679266  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  54.55 
 
 		 538 aa  612  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  54.17 
 
 		 555 aa  612  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  52.59 
 
 		 540 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  54.46 
 
 		 556 aa  613  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2133  alpha amylase, catalytic region  52.04 
 
 		 540 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2299  alpha amylase catalytic region  51.11 
 
 		 540 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.823743 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  52.69 
 
 		 541 aa  610  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  50.74 
 
 		 540 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  54 
 
 		 550 aa  608  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4573  hypothetical protein  51.11 
 
 		 540 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  54.83 
 
 		 547 aa  607  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2287  alpha amylase catalytic region  51.11 
 
 		 540 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2086  alpha amylase catalytic region  50.56 
 
 		 540 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  53.88 
 
 		 544 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0295  alpha amylase catalytic region  54.38 
 
 		 551 aa  598  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  53 
 
 		 537 aa  596  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  55.29 
 
 		 552 aa  592  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2620  alpha amylase catalytic region  53.24 
 
 		 560 aa  593  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  52.77 
 
 		 548 aa  589  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  52.78 
 
 		 548 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  55.98 
 
 		 553 aa  586  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3128  alpha amylase, catalytic region  54.38 
 
 		 542 aa  585  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209805  normal  0.0115348 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  52.27 
 
 		 530 aa  568  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  53.99 
 
 		 536 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  53.8 
 
 		 536 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  52.46 
 
 		 557 aa  559  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  52.66 
 
 		 536 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  50.49 
 
 		 540 aa  528  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  50.4 
 
 		 543 aa  517  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1891  alpha amylase, catalytic region  50.8 
 
 		 544 aa  512  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687574  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3112  alpha amylase protein  47.06 
 
 		 535 aa  481  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.364914  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0184  alpha amylase, catalytic region  46.95 
 
 		 547 aa  475  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2954  alpha amylase catalytic region  45.91 
 
 		 549 aa  469  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067439 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  44.88 
 
 		 541 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  43.4 
 
 		 541 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  44.21 
 
 		 533 aa  427  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  44.95 
 
 		 549 aa  427  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  43.32 
 
 		 538 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  42.91 
 
 		 529 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  42.97 
 
 		 553 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  44.76 
 
 		 538 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  42.96 
 
 		 528 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  42.31 
 
 		 535 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  41.99 
 
 		 543 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  43.49 
 
 		 542 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  44.19 
 
 		 530 aa  402  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  42.75 
 
 		 525 aa  398  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  43.54 
 
 		 540 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  42.94 
 
 		 540 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  40.52 
 
 		 532 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  39.06 
 
 		 564 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  39.96 
 
 		 540 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  45.35 
 
 		 535 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  39.33 
 
 		 575 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  39.92 
 
 		 536 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  38.42 
 
 		 568 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  42.2 
 
 		 524 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  40.59 
 
 		 545 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  39.28 
 
 		 539 aa  376  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  43.17 
 
 		 537 aa  375  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  38.25 
 
 		 574 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  43.88 
 
 		 448 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  41.63 
 
 		 542 aa  371  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  41.9 
 
 		 546 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  39.08 
 
 		 547 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3898  alpha amylase catalytic region  38.98 
 
 		 526 aa  347  4e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.237178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  40.04 
 
 		 518 aa  345  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  34.38 
 
 		 563 aa  342  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.41 
 
 		 515 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  35.45 
 
 		 560 aa  337  2.9999999999999997e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3483  alpha amylase catalytic region  37.86 
 
 		 542 aa  335  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906486  normal  0.657022 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  36.79 
 
 		 556 aa  334  3e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  35.7 
 
 		 562 aa  333  4e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  37.65 
 
 		 600 aa  332  8e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  36.86 
 
 		 622 aa  332  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  35.69 
 
 		 562 aa  330  4e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  38.41 
 
 		 555 aa  330  5.0000000000000004e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  35.98 
 
 		 549 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  35.98 
 
 		 549 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  39.67 
 
 		 550 aa  327  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  35.08 
 
 		 563 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1251  Alpha amylase, catalytic region  36.28 
 
 		 561 aa  325  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  34.27 
 
 		 556 aa  325  2e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  33.79 
 
 		 570 aa  323  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42120  alpha-glucosidase maltase  35.1 
 
 		 572 aa  323  7e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.217758  normal  0.25099 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  36.35 
 
 		 557 aa  323  7e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  35.78 
 
 		 558 aa  322  8e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>