More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3307 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 735 aa  1463    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  45.13 
 
 		 540 aa  371  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  40.18 
 
 		 545 aa  360  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  42.03 
 
 		 534 aa  359  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  41.59 
 
 		 532 aa  358  1.9999999999999998e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  40.58 
 
 		 525 aa  357  3.9999999999999996e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  38.69 
 
 		 553 aa  353  8.999999999999999e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  45.31 
 
 		 522 aa  350  5e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  42.79 
 
 		 535 aa  349  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  43.32 
 
 		 536 aa  347  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  44.32 
 
 		 529 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  42.79 
 
 		 543 aa  345  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  43.01 
 
 		 539 aa  343  5e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  44.52 
 
 		 448 aa  343  5e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  42.56 
 
 		 538 aa  343  5.999999999999999e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  42 
 
 		 537 aa  342  1e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  40.3 
 
 		 537 aa  339  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  45.28 
 
 		 550 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  43.25 
 
 		 533 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  43.97 
 
 		 538 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  38.95 
 
 		 535 aa  337  5.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  42.26 
 
 		 538 aa  336  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  44.09 
 
 		 541 aa  335  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  44.32 
 
 		 533 aa  334  4e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  37.02 
 
 		 562 aa  333  6e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  43.61 
 
 		 541 aa  333  8e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  36.4 
 
 		 540 aa  331  4e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  38.97 
 
 		 540 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  44.18 
 
 		 532 aa  330  6e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  44.29 
 
 		 540 aa  330  6e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  39.13 
 
 		 562 aa  330  7e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  43.47 
 
 		 539 aa  330  8e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  45.04 
 
 		 539 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  45.04 
 
 		 539 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  35.71 
 
 		 549 aa  328  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  35.71 
 
 		 549 aa  328  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  41.67 
 
 		 507 aa  327  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  40.31 
 
 		 543 aa  328  3e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  44.87 
 
 		 528 aa  327  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  42.57 
 
 		 587 aa  327  4.0000000000000003e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  39.88 
 
 		 549 aa  327  6e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  42.66 
 
 		 540 aa  326  9e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  41.76 
 
 		 533 aa  326  9e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  44.35 
 
 		 546 aa  325  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  37.8 
 
 		 544 aa  326  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0295  alpha amylase catalytic region  39.92 
 
 		 551 aa  325  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  41.88 
 
 		 557 aa  325  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  34.69 
 
 		 557 aa  324  3e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  42.27 
 
 		 547 aa  324  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  33.27 
 
 		 559 aa  324  5e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  43.67 
 
 		 542 aa  323  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  41.28 
 
 		 567 aa  323  8e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  41.73 
 
 		 545 aa  323  9.000000000000001e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  44.27 
 
 		 546 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  38.54 
 
 		 541 aa  322  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  34.09 
 
 		 558 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  41.81 
 
 		 531 aa  321  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  40.56 
 
 		 536 aa  320  5e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  38.54 
 
 		 550 aa  320  5e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  40.56 
 
 		 536 aa  320  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  38.16 
 
 		 530 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  38.94 
 
 		 553 aa  318  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  33.52 
 
 		 558 aa  318  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  39.16 
 
 		 540 aa  318  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  39.3 
 
 		 550 aa  317  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  34.89 
 
 		 560 aa  317  4e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2133  alpha amylase, catalytic region  39.16 
 
 		 540 aa  317  5e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  40.75 
 
 		 570 aa  317  7e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  33.64 
 
 		 558 aa  316  8e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  37.55 
 
 		 555 aa  316  8e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  40.31 
 
 		 538 aa  316  9e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  44.42 
 
 		 537 aa  316  9e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  33.71 
 
 		 558 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  37.15 
 
 		 550 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  39.65 
 
 		 547 aa  316  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  34.41 
 
 		 551 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  33.71 
 
 		 558 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  33.71 
 
 		 558 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  39.15 
 
 		 530 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  38.3 
 
 		 563 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  42.32 
 
 		 511 aa  315  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  33.71 
 
 		 558 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  41.86 
 
 		 524 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  33.52 
 
 		 558 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  37.73 
 
 		 541 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2299  alpha amylase catalytic region  36.87 
 
 		 540 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.823743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  32.84 
 
 		 558 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  43.83 
 
 		 543 aa  312  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  35.4 
 
 		 560 aa  312  1e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  38.07 
 
 		 552 aa  312  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4573  hypothetical protein  36.87 
 
 		 540 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2287  alpha amylase catalytic region  36.87 
 
 		 540 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2028  alpha amylase, catalytic region  35.91 
 
 		 557 aa  311  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  44.71 
 
 		 594 aa  312  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  37.77 
 
 		 572 aa  311  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2086  alpha amylase catalytic region  36.67 
 
 		 540 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  39.06 
 
 		 557 aa  311  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  38.63 
 
 		 540 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  36.98 
 
 		 540 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2311  alpha amylase, catalytic region  37.3 
 
 		 540 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.679266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>