More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2088 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  56.09 
 
 		 538 aa  645    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 541 aa  1131    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  58.46 
 
 		 540 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  58.43 
 
 		 586 aa  640    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  58.35 
 
 		 541 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3128  alpha amylase, catalytic region  64.19 
 
 		 542 aa  643    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209805  normal  0.0115348 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1788  alpha amylase, catalytic region  55.89 
 
 		 544 aa  632  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2299  alpha amylase catalytic region  54.95 
 
 		 540 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.823743 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2311  alpha amylase, catalytic region  57.03 
 
 		 540 aa  630  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.679266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4573  hypothetical protein  58.55 
 
 		 540 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2287  alpha amylase catalytic region  58.55 
 
 		 540 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2086  alpha amylase catalytic region  54.95 
 
 		 540 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  57.34 
 
 		 555 aa  627  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  54.77 
 
 		 540 aa  628  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  54.07 
 
 		 540 aa  623  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2028  alpha amylase, catalytic region  57.23 
 
 		 557 aa  622  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  58.28 
 
 		 540 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  55.41 
 
 		 544 aa  619  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  54.26 
 
 		 537 aa  615  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2133  alpha amylase, catalytic region  58.28 
 
 		 540 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  57.59 
 
 		 547 aa  612  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4341  alpha amylase catalytic region  53.7 
 
 		 539 aa  614  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  54.87 
 
 		 537 aa  612  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  55.97 
 
 		 548 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  55.22 
 
 		 548 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  55.99 
 
 		 550 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  53.48 
 
 		 550 aa  601  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  55.49 
 
 		 550 aa  601  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3326  alpha amylase catalytic region  52.39 
 
 		 547 aa  595  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  52.36 
 
 		 556 aa  593  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  56.07 
 
 		 552 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  57.17 
 
 		 557 aa  582  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  53.86 
 
 		 530 aa  583  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  56.18 
 
 		 550 aa  582  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  55.29 
 
 		 553 aa  578  1e-164  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2620  alpha amylase catalytic region  59.79 
 
 		 560 aa  580  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0295  alpha amylase catalytic region  57.26 
 
 		 551 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  53.19 
 
 		 536 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  53.47 
 
 		 536 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  53.27 
 
 		 536 aa  535  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  50.56 
 
 		 540 aa  523  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3112  alpha amylase protein  48.58 
 
 		 535 aa  510  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.364914  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1891  alpha amylase, catalytic region  49.45 
 
 		 544 aa  504  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687574  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  47.49 
 
 		 543 aa  501  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0184  alpha amylase, catalytic region  47.47 
 
 		 547 aa  488  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2954  alpha amylase catalytic region  45.82 
 
 		 549 aa  465  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  42.37 
 
 		 538 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  40.59 
 
 		 549 aa  411  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  42.94 
 
 		 529 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  41.9 
 
 		 553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  40.77 
 
 		 543 aa  402  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  43.95 
 
 		 525 aa  402  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  41.04 
 
 		 535 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  42.69 
 
 		 538 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  42.64 
 
 		 541 aa  398  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  43.29 
 
 		 540 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  42.58 
 
 		 541 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  39.04 
 
 		 568 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  40.78 
 
 		 533 aa  390  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  40.16 
 
 		 540 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  43.03 
 
 		 542 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  42 
 
 		 530 aa  385  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  37.97 
 
 		 564 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  37.73 
 
 		 536 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  40.62 
 
 		 532 aa  381  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  41.83 
 
 		 540 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  38.87 
 
 		 539 aa  372  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  36.61 
 
 		 545 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  40.68 
 
 		 535 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  38.39 
 
 		 524 aa  372  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  40.73 
 
 		 528 aa  363  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  42.7 
 
 		 448 aa  360  5e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  40.24 
 
 		 537 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  38.89 
 
 		 518 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.69 
 
 		 515 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  37.19 
 
 		 574 aa  356  5e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  37.32 
 
 		 575 aa  355  8.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  39.76 
 
 		 542 aa  351  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  40.43 
 
 		 546 aa  348  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3898  alpha amylase catalytic region  43.26 
 
 		 526 aa  348  1e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.237178 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  37.23 
 
 		 547 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1251  Alpha amylase, catalytic region  35.03 
 
 		 561 aa  340  5.9999999999999996e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  38.09 
 
 		 587 aa  333  7.000000000000001e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  35.02 
 
 		 560 aa  332  9e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  34.15 
 
 		 557 aa  330  6e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  40.48 
 
 		 550 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  38.85 
 
 		 522 aa  323  7e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  37.21 
 
 		 533 aa  322  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  38.54 
 
 		 735 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  37.36 
 
 		 534 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  38.55 
 
 		 507 aa  319  7.999999999999999e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  35.28 
 
 		 549 aa  319  7.999999999999999e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  35.28 
 
 		 549 aa  319  7.999999999999999e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  36.6 
 
 		 531 aa  318  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  34.76 
 
 		 562 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  37.6 
 
 		 532 aa  316  8e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  36.86 
 
 		 566 aa  315  9e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  33.04 
 
 		 554 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  35.9 
 
 		 577 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 563 aa  312  9e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>