More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11590 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  63.91 
 
 		 507 aa  643    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  68.06 
 
 		 544 aa  665    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  62.97 
 
 		 533 aa  637    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  68.19 
 
 		 538 aa  672    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  66.86 
 
 		 538 aa  691    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  67.99 
 
 		 550 aa  669    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  100 
 
 		 522 aa  1055    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  63.36 
 
 		 545 aa  650    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  63.09 
 
 		 555 aa  620  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  62.55 
 
 		 543 aa  616  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  61.42 
 
 		 543 aa  606  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  59.85 
 
 		 531 aa  591  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  58.88 
 
 		 567 aa  587  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  59.81 
 
 		 511 aa  580  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  57.19 
 
 		 571 aa  580  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  57.17 
 
 		 524 aa  576  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  57.28 
 
 		 534 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  54.17 
 
 		 605 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  55.84 
 
 		 560 aa  568  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  56.55 
 
 		 587 aa  566  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  55.01 
 
 		 566 aa  565  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  56.71 
 
 		 540 aa  567  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  55.68 
 
 		 544 aa  557  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  54.36 
 
 		 570 aa  555  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  56.9 
 
 		 512 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  52.18 
 
 		 593 aa  554  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  56.39 
 
 		 549 aa  551  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  56.98 
 
 		 546 aa  542  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  56.57 
 
 		 554 aa  543  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  58.24 
 
 		 532 aa  542  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  54.17 
 
 		 558 aa  535  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  53.73 
 
 		 563 aa  534  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  54.06 
 
 		 576 aa  533  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  56.28 
 
 		 561 aa  533  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  54.33 
 
 		 539 aa  528  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  58.32 
 
 		 546 aa  526  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  53.01 
 
 		 533 aa  526  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  53.6 
 
 		 565 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  56.55 
 
 		 539 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  53.55 
 
 		 553 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  56.55 
 
 		 539 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  56.55 
 
 		 539 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  53.26 
 
 		 609 aa  518  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  58.9 
 
 		 555 aa  509  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  52.58 
 
 		 599 aa  509  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  50.34 
 
 		 640 aa  505  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  52.21 
 
 		 560 aa  508  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  50.63 
 
 		 568 aa  501  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  52.12 
 
 		 548 aa  498  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  52.84 
 
 		 634 aa  498  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  53.08 
 
 		 607 aa  496  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  53.68 
 
 		 594 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  54.4 
 
 		 554 aa  489  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  52.09 
 
 		 567 aa  484  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  50.55 
 
 		 542 aa  474  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  49.2 
 
 		 572 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  49.11 
 
 		 570 aa  468  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  49.82 
 
 		 580 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  45.75 
 
 		 604 aa  457  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  50.96 
 
 		 573 aa  458  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  51.16 
 
 		 543 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  47.64 
 
 		 556 aa  451  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  45.88 
 
 		 563 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  46.88 
 
 		 544 aa  448  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  49.63 
 
 		 560 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  46.11 
 
 		 561 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  53.28 
 
 		 548 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  42.78 
 
 		 525 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  42.22 
 
 		 532 aa  383  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.74 
 
 		 515 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  42.97 
 
 		 540 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  41.26 
 
 		 553 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  42.31 
 
 		 529 aa  368  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  42.16 
 
 		 536 aa  359  7e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  45.31 
 
 		 735 aa  359  8e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  39.32 
 
 		 535 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  42.11 
 
 		 549 aa  350  4e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  41.76 
 
 		 555 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  40.04 
 
 		 545 aa  348  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  42.83 
 
 		 541 aa  347  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  39.47 
 
 		 530 aa  345  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  40.55 
 
 		 544 aa  345  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  42.59 
 
 		 541 aa  343  4e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  42.16 
 
 		 533 aa  339  9e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  41.6 
 
 		 537 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  41.9 
 
 		 539 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  40.71 
 
 		 537 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  41.29 
 
 		 536 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  41.78 
 
 		 540 aa  336  7e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  41.26 
 
 		 543 aa  335  9e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  43.94 
 
 		 535 aa  335  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  39.72 
 
 		 586 aa  334  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  40.86 
 
 		 547 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  40.32 
 
 		 556 aa  334  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  41.95 
 
 		 518 aa  332  7.000000000000001e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  41.1 
 
 		 542 aa  332  9e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  40.52 
 
 		 538 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  42.41 
 
 		 557 aa  332  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  41.53 
 
 		 528 aa  332  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  41.25 
 
 		 540 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>