More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1532 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  60.89 
 
 		 533 aa  652    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 532 aa  1054    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  66.6 
 
 		 531 aa  693    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  60.8 
 
 		 587 aa  636    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  60.71 
 
 		 546 aa  593  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  58.9 
 
 		 539 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  58.9 
 
 		 539 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  59.27 
 
 		 539 aa  585  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  58.06 
 
 		 533 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  57.31 
 
 		 538 aa  571  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  59.89 
 
 		 544 aa  569  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  60.27 
 
 		 550 aa  560  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  58.24 
 
 		 522 aa  555  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  55.34 
 
 		 540 aa  545  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  57.84 
 
 		 538 aa  548  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  53.49 
 
 		 560 aa  544  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  56.55 
 
 		 543 aa  541  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  56.01 
 
 		 507 aa  538  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  54.53 
 
 		 567 aa  536  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  56.24 
 
 		 545 aa  537  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  54.72 
 
 		 571 aa  532  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  55.06 
 
 		 543 aa  529  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  52.18 
 
 		 524 aa  520  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  56.9 
 
 		 555 aa  519  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  53.21 
 
 		 534 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  49.65 
 
 		 593 aa  510  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  51.66 
 
 		 566 aa  506  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  52.62 
 
 		 512 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  51.01 
 
 		 544 aa  502  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  53.41 
 
 		 549 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  50.44 
 
 		 605 aa  501  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  53.76 
 
 		 561 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  51.19 
 
 		 553 aa  498  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  52.92 
 
 		 634 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  52.6 
 
 		 539 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  49.27 
 
 		 570 aa  493  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  55.36 
 
 		 511 aa  490  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  51.08 
 
 		 558 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  52.99 
 
 		 594 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  53.32 
 
 		 546 aa  490  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  51.94 
 
 		 560 aa  488  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  54.2 
 
 		 554 aa  484  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  51.84 
 
 		 554 aa  484  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  49.47 
 
 		 563 aa  481  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  51.67 
 
 		 548 aa  472  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  46.83 
 
 		 609 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  45.71 
 
 		 563 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  49.72 
 
 		 576 aa  465  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  53.42 
 
 		 543 aa  467  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  51.57 
 
 		 560 aa  465  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  46.52 
 
 		 572 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  50.19 
 
 		 565 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  48.74 
 
 		 567 aa  457  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  46.88 
 
 		 570 aa  455  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  48.1 
 
 		 640 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  46.58 
 
 		 568 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  49.36 
 
 		 542 aa  450  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  49.82 
 
 		 599 aa  444  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  45.24 
 
 		 607 aa  439  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  47.55 
 
 		 556 aa  434  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  50.09 
 
 		 555 aa  430  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  46.07 
 
 		 580 aa  423  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  46.55 
 
 		 544 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  47.17 
 
 		 573 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  42.14 
 
 		 604 aa  412  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  45.52 
 
 		 561 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  50.55 
 
 		 548 aa  399  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  43.05 
 
 		 532 aa  362  9e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  42.11 
 
 		 525 aa  360  3e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  41.73 
 
 		 548 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  40.47 
 
 		 553 aa  350  4e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  44.18 
 
 		 735 aa  347  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  43.33 
 
 		 557 aa  346  8e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  41.51 
 
 		 548 aa  346  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  41.67 
 
 		 540 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  42.32 
 
 		 537 aa  343  5.999999999999999e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  41 
 
 		 549 aa  342  7e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  42.66 
 
 		 529 aa  341  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  41.28 
 
 		 536 aa  340  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  40.35 
 
 		 550 aa  340  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  40.15 
 
 		 550 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  42.03 
 
 		 533 aa  335  7.999999999999999e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  41.56 
 
 		 543 aa  335  1e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  39.88 
 
 		 550 aa  335  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  40.77 
 
 		 547 aa  335  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  38.23 
 
 		 544 aa  333  3e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  40.08 
 
 		 555 aa  333  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.99 
 
 		 515 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  42.35 
 
 		 536 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  41.07 
 
 		 545 aa  331  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  38.62 
 
 		 564 aa  329  7e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  43.79 
 
 		 518 aa  329  8e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  41.27 
 
 		 539 aa  329  9e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  40.47 
 
 		 550 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  37.6 
 
 		 541 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  45.16 
 
 		 535 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  39.73 
 
 		 538 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0184  alpha amylase, catalytic region  41.2 
 
 		 547 aa  326  7e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  37.47 
 
 		 530 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  41.1 
 
 		 541 aa  325  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>