More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2119 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  58.63 
 
 		 568 aa  636    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 560 aa  1118    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  61.12 
 
 		 567 aa  630  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  60.61 
 
 		 572 aa  626  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  56.17 
 
 		 563 aa  622  1e-177  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  60.32 
 
 		 560 aa  619  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  58.74 
 
 		 570 aa  615  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  50.33 
 
 		 604 aa  532  1e-150  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  53.83 
 
 		 566 aa  528  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  52.68 
 
 		 539 aa  525  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  55.42 
 
 		 571 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  53.19 
 
 		 540 aa  509  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  54.23 
 
 		 567 aa  508  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  51.16 
 
 		 563 aa  502  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  51.14 
 
 		 570 aa  496  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  49.21 
 
 		 593 aa  495  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  51.12 
 
 		 507 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  48.17 
 
 		 605 aa  491  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  51.83 
 
 		 576 aa  491  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  50.18 
 
 		 538 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  52.91 
 
 		 546 aa  476  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  50.18 
 
 		 556 aa  474  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  50.81 
 
 		 554 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  52.83 
 
 		 544 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  50.55 
 
 		 531 aa  470  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  51.93 
 
 		 565 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  50.37 
 
 		 522 aa  463  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  48.91 
 
 		 534 aa  462  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  51.76 
 
 		 532 aa  460  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  47.81 
 
 		 607 aa  462  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  50 
 
 		 545 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  50.09 
 
 		 561 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  51.24 
 
 		 599 aa  457  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  48.4 
 
 		 553 aa  458  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  48.17 
 
 		 609 aa  455  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  50.74 
 
 		 538 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  49.28 
 
 		 533 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  51.27 
 
 		 543 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  49.1 
 
 		 543 aa  451  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  45.85 
 
 		 560 aa  448  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  48.53 
 
 		 544 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  48.6 
 
 		 512 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  51.57 
 
 		 511 aa  442  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  48.72 
 
 		 549 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  48.39 
 
 		 555 aa  433  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  46.35 
 
 		 524 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  49.03 
 
 		 550 aa  433  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  48.56 
 
 		 573 aa  433  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  48.28 
 
 		 555 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  47.21 
 
 		 640 aa  428  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  48.4 
 
 		 558 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  45.8 
 
 		 587 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  49.46 
 
 		 554 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  48.46 
 
 		 542 aa  418  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  49.26 
 
 		 548 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  44.07 
 
 		 544 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  47.95 
 
 		 561 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  47.09 
 
 		 539 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  45.66 
 
 		 546 aa  402  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  47.09 
 
 		 539 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  45.2 
 
 		 533 aa  403  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  47.09 
 
 		 539 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  50.63 
 
 		 594 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  46.37 
 
 		 634 aa  398  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  46.09 
 
 		 580 aa  398  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  48.29 
 
 		 548 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  43.25 
 
 		 543 aa  342  9e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  39.67 
 
 		 536 aa  320  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  38.82 
 
 		 545 aa  310  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  40.59 
 
 		 540 aa  303  6.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  38.65 
 
 		 532 aa  301  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  36.88 
 
 		 538 aa  300  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  38.72 
 
 		 529 aa  299  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  41.49 
 
 		 518 aa  295  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  36.75 
 
 		 553 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  37.4 
 
 		 540 aa  288  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2620  alpha amylase catalytic region  39 
 
 		 560 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  37.99 
 
 		 547 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  36.44 
 
 		 543 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  34.98 
 
 		 530 aa  283  8.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.13 
 
 		 515 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  39.44 
 
 		 550 aa  282  1e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  37.34 
 
 		 548 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  36.33 
 
 		 525 aa  280  3e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2954  alpha amylase catalytic region  38.26 
 
 		 549 aa  279  9e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  38.65 
 
 		 540 aa  279  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  39.57 
 
 		 541 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  39.75 
 
 		 448 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  35.1 
 
 		 535 aa  278  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  36.49 
 
 		 552 aa  278  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  37.26 
 
 		 536 aa  278  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  37.26 
 
 		 536 aa  277  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0184  alpha amylase, catalytic region  37.32 
 
 		 547 aa  277  4e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  36.4 
 
 		 548 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  37.91 
 
 		 541 aa  276  7e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  37.94 
 
 		 535 aa  276  8e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  38.73 
 
 		 735 aa  276  8e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  37.74 
 
 		 537 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  38.07 
 
 		 555 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  35.51 
 
 		 549 aa  275  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>