More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2746 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  73.65 
 
 		 572 aa  846    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 570 aa  1159    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  57.98 
 
 		 563 aa  675    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  66.78 
 
 		 567 aa  728    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  61.78 
 
 		 560 aa  674    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  84.91 
 
 		 568 aa  999    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  58.74 
 
 		 560 aa  593  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  51.23 
 
 		 604 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  52.36 
 
 		 539 aa  559  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  52.6 
 
 		 566 aa  553  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  51.87 
 
 		 533 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  52.9 
 
 		 507 aa  536  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  51.29 
 
 		 567 aa  536  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  51.83 
 
 		 571 aa  531  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  47.33 
 
 		 609 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  52.16 
 
 		 544 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  49.14 
 
 		 563 aa  514  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  46.74 
 
 		 593 aa  505  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  51.79 
 
 		 565 aa  498  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  47.02 
 
 		 605 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  48.13 
 
 		 570 aa  496  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  49.38 
 
 		 576 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  49.2 
 
 		 540 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  46.95 
 
 		 553 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  46.91 
 
 		 556 aa  488  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  46.05 
 
 		 607 aa  484  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  47.68 
 
 		 640 aa  483  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  45.91 
 
 		 560 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  48.16 
 
 		 558 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  50.18 
 
 		 573 aa  479  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  49.11 
 
 		 522 aa  473  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  47.7 
 
 		 555 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  49.73 
 
 		 542 aa  473  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  49.48 
 
 		 599 aa  474  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  48.06 
 
 		 546 aa  473  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  48.44 
 
 		 534 aa  475  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  50.36 
 
 		 550 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  48.83 
 
 		 512 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  47.11 
 
 		 531 aa  467  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  46.11 
 
 		 543 aa  464  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  45.39 
 
 		 524 aa  464  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  46.03 
 
 		 533 aa  462  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  48.57 
 
 		 554 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  46.67 
 
 		 587 aa  461  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  46.67 
 
 		 554 aa  459  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  47.96 
 
 		 538 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  46.4 
 
 		 543 aa  458  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  44.64 
 
 		 544 aa  455  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  47.79 
 
 		 561 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  46.88 
 
 		 545 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  48.38 
 
 		 511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  46.18 
 
 		 538 aa  442  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  46.32 
 
 		 549 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  46.88 
 
 		 532 aa  442  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  44.07 
 
 		 546 aa  436  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  47.25 
 
 		 555 aa  436  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  44.52 
 
 		 548 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  44.7 
 
 		 539 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  44.7 
 
 		 539 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  44.7 
 
 		 539 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  43.84 
 
 		 561 aa  409  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  48.5 
 
 		 548 aa  401  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  42.81 
 
 		 580 aa  396  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  43.74 
 
 		 634 aa  395  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  40.21 
 
 		 544 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  41.39 
 
 		 594 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  41.07 
 
 		 543 aa  350  4e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  37.94 
 
 		 536 aa  322  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  39.88 
 
 		 540 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  38.5 
 
 		 553 aa  319  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  38.92 
 
 		 529 aa  316  9e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  37.86 
 
 		 532 aa  315  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  37.08 
 
 		 538 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  38.68 
 
 		 547 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  38.89 
 
 		 555 aa  307  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  36.33 
 
 		 525 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  38.46 
 
 		 545 aa  304  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  37.26 
 
 		 568 aa  296  8e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  36.4 
 
 		 543 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  36.33 
 
 		 550 aa  295  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  37.5 
 
 		 548 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  36.71 
 
 		 548 aa  293  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  38.52 
 
 		 550 aa  290  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  36.71 
 
 		 535 aa  290  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  36.91 
 
 		 553 aa  290  5.0000000000000004e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  36.54 
 
 		 550 aa  290  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  36.54 
 
 		 550 aa  289  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  38.41 
 
 		 540 aa  287  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0184  alpha amylase, catalytic region  35.36 
 
 		 547 aa  286  5e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  39.52 
 
 		 538 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  39.47 
 
 		 542 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  37.1 
 
 		 537 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  39.92 
 
 		 448 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  34.87 
 
 		 552 aa  283  5.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  38.48 
 
 		 542 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  39.51 
 
 		 536 aa  282  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  35.12 
 
 		 530 aa  282  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  37.36 
 
 		 533 aa  282  1e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2954  alpha amylase catalytic region  36.85 
 
 		 549 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067439 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  36.82 
 
 		 540 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>