More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51470 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  61.76 
 
 
566 aa  651    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  100 
 
 
565 aa  1148    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  62.66 
 
 
567 aa  664    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  60.18 
 
 
571 aa  645    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  72.24 
 
 
576 aa  818    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  55.81 
 
 
605 aa  634  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  56.1 
 
 
593 aa  629  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  57.65 
 
 
609 aa  624  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  58.35 
 
 
640 aa  618  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  61.55 
 
 
599 aa  596  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  61.11 
 
 
546 aa  596  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  55.37 
 
 
607 aa  590  1e-167  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  56.47 
 
 
570 aa  590  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  56.29 
 
 
507 aa  577  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  55.68 
 
 
533 aa  570  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  56.76 
 
 
550 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  54.61 
 
 
540 aa  557  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  55.68 
 
 
545 aa  547  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  52.94 
 
 
563 aa  547  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  55.48 
 
 
544 aa  543  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  52.86 
 
 
560 aa  544  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  55.66 
 
 
538 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  53.33 
 
 
568 aa  542  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  54.53 
 
 
522 aa  531  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  52.53 
 
 
534 aa  529  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  55.6 
 
 
538 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  54.1 
 
 
543 aa  522  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  52.55 
 
 
539 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  53.03 
 
 
561 aa  520  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  51.66 
 
 
544 aa  518  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  52.21 
 
 
554 aa  518  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  49.55 
 
 
563 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  54.05 
 
 
511 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  53.55 
 
 
543 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  53.35 
 
 
573 aa  510  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  51.79 
 
 
570 aa  504  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  53.19 
 
 
555 aa  505  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  52.58 
 
 
567 aa  501  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  52.77 
 
 
572 aa  498  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  51.21 
 
 
524 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  52.01 
 
 
560 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  50.46 
 
 
531 aa  495  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  49.64 
 
 
553 aa  491  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  52.5 
 
 
555 aa  489  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  49.28 
 
 
558 aa  486  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  51.2 
 
 
549 aa  470  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  48.62 
 
 
587 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  45.99 
 
 
604 aa  467  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  50.46 
 
 
542 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  48.88 
 
 
512 aa  463  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  51.38 
 
 
560 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  47.76 
 
 
561 aa  458  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  50.09 
 
 
554 aa  456  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  47.5 
 
 
546 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  50 
 
 
532 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  48.09 
 
 
539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  47.53 
 
 
539 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  47.53 
 
 
539 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  48.2 
 
 
556 aa  445  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  45.86 
 
 
533 aa  440  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  47.2 
 
 
548 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  46.31 
 
 
580 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  51.1 
 
 
548 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  47 
 
 
634 aa  428  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  47.22 
 
 
594 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  45.34 
 
 
544 aa  415  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  46.31 
 
 
543 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  41.11 
 
 
553 aa  350  5e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.87 
 
 
515 aa  349  9e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  40.26 
 
 
540 aa  343  4e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  42.04 
 
 
532 aa  342  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  41.54 
 
 
525 aa  342  1e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  40 
 
 
538 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  41.31 
 
 
533 aa  333  6e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  39.64 
 
 
535 aa  331  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  41.41 
 
 
537 aa  330  3e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  39.24 
 
 
547 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  38.78 
 
 
548 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  37.91 
 
 
541 aa  324  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  39.89 
 
 
543 aa  323  4e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  40.22 
 
 
542 aa  323  6e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  40.75 
 
 
529 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  40.12 
 
 
550 aa  320  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  40.67 
 
 
539 aa  318  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  39.39 
 
 
537 aa  318  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  39.63 
 
 
518 aa  317  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  38.99 
 
 
555 aa  317  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  38.18 
 
 
543 aa  315  9e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  43.23 
 
 
541 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  37.6 
 
 
538 aa  315  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  38.67 
 
 
548 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  36.27 
 
 
568 aa  313  7.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  43.01 
 
 
541 aa  310  4e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  37.91 
 
 
540 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  39.53 
 
 
524 aa  310  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  38.96 
 
 
530 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  40.9 
 
 
540 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2086  alpha amylase catalytic region  37.72 
 
 
540 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  39.81 
 
 
540 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2287  alpha amylase catalytic region  37.72 
 
 
540 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>