More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1883 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  68.16 
 
 		 555 aa  672    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  64.46 
 
 		 543 aa  638    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  77.44 
 
 		 538 aa  811    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 538 aa  1080    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  67.67 
 
 		 522 aa  679    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  73.48 
 
 		 550 aa  742    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  68.06 
 
 		 545 aa  706    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  63.35 
 
 		 543 aa  635    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  60.98 
 
 		 533 aa  618  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  62.97 
 
 		 544 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  60.23 
 
 		 540 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  60.26 
 
 		 567 aa  598  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  58.93 
 
 		 507 aa  580  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  55.47 
 
 		 560 aa  573  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  57.02 
 
 		 571 aa  567  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  55.39 
 
 		 544 aa  565  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  53.7 
 
 		 605 aa  560  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  57.78 
 
 		 524 aa  557  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  55.85 
 
 		 531 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  53.12 
 
 		 593 aa  554  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  55.96 
 
 		 566 aa  553  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  54.17 
 
 		 558 aa  547  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  59.13 
 
 		 511 aa  548  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  54.03 
 
 		 563 aa  547  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  55.78 
 
 		 576 aa  543  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  57.03 
 
 		 570 aa  543  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  57.84 
 
 		 532 aa  540  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  54.9 
 
 		 512 aa  535  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  54.14 
 
 		 533 aa  536  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  54.19 
 
 		 534 aa  538  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  53.66 
 
 		 587 aa  525  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  51.76 
 
 		 607 aa  524  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  61.99 
 
 		 546 aa  522  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  55.5 
 
 		 561 aa  524  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  54.87 
 
 		 565 aa  518  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  53.83 
 
 		 549 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  57.39 
 
 		 554 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  54.2 
 
 		 539 aa  514  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  57.71 
 
 		 599 aa  510  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  52.4 
 
 		 553 aa  509  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  52.09 
 
 		 609 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  53.08 
 
 		 554 aa  504  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  52.28 
 
 		 539 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  52.28 
 
 		 539 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  52.66 
 
 		 539 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  52.91 
 
 		 546 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  54.04 
 
 		 634 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  48.24 
 
 		 640 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  52.08 
 
 		 594 aa  488  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  50.55 
 
 		 548 aa  485  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  57.42 
 
 		 555 aa  485  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  51.64 
 
 		 560 aa  484  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  52.01 
 
 		 542 aa  480  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  50.88 
 
 		 567 aa  477  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  47.42 
 
 		 568 aa  475  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  51.63 
 
 		 543 aa  464  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  51.23 
 
 		 573 aa  463  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  49.32 
 
 		 580 aa  465  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  47.79 
 
 		 572 aa  458  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  48.91 
 
 		 544 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  44.86 
 
 		 563 aa  450  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  50.18 
 
 		 560 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  46.67 
 
 		 556 aa  442  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  44.62 
 
 		 604 aa  442  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  46.18 
 
 		 570 aa  442  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  46.75 
 
 		 561 aa  428  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  52.51 
 
 		 548 aa  412  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  44.61 
 
 		 532 aa  398  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  42.94 
 
 		 525 aa  376  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  43.12 
 
 		 533 aa  365  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  44.53 
 
 		 529 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  43.66 
 
 		 540 aa  362  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  42.86 
 
 		 536 aa  361  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  49.58 
 
 		 515 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  42.32 
 
 		 553 aa  356  5e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  41.32 
 
 		 535 aa  355  7.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  46.98 
 
 		 541 aa  353  5e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  46.22 
 
 		 541 aa  349  7e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  43.27 
 
 		 538 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  43.97 
 
 		 735 aa  348  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  44.55 
 
 		 530 aa  347  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  44.69 
 
 		 538 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  42.47 
 
 		 539 aa  346  5e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  42.69 
 
 		 543 aa  345  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  43.41 
 
 		 518 aa  345  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  42.71 
 
 		 549 aa  344  2e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  44.49 
 
 		 528 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  40.04 
 
 		 543 aa  341  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  42.34 
 
 		 545 aa  340  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  41.22 
 
 		 555 aa  337  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  43.37 
 
 		 537 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1328  alpha amylase catalytic region  44.92 
 
 		 546 aa  334  2e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  44.05 
 
 		 535 aa  333  5e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  45.75 
 
 		 448 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  43.57 
 
 		 542 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  43.18 
 
 		 540 aa  327  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  43.4 
 
 		 537 aa  326  6e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  42.05 
 
 		 547 aa  325  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  44.29 
 
 		 546 aa  323  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  42.91 
 
 		 540 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>