More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3708 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 549 aa  1110    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  61.34 
 
 		 560 aa  672    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  58.85 
 
 		 544 aa  627  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  56.15 
 
 		 553 aa  595  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  58.08 
 
 		 544 aa  589  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  55.96 
 
 		 538 aa  590  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  55.12 
 
 		 558 aa  586  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  57.77 
 
 		 554 aa  580  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  57.43 
 
 		 512 aa  580  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  56.69 
 
 		 542 aa  578  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  56.49 
 
 		 522 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  53.31 
 
 		 533 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  54.04 
 
 		 531 aa  552  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  52.89 
 
 		 567 aa  550  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  51.39 
 
 		 566 aa  545  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  54.05 
 
 		 543 aa  546  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  55.7 
 
 		 550 aa  541  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  53.7 
 
 		 543 aa  544  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  54.07 
 
 		 538 aa  542  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  53.69 
 
 		 545 aa  542  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  53.14 
 
 		 507 aa  545  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  54.71 
 
 		 554 aa  541  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  53.4 
 
 		 580 aa  540  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  54.56 
 
 		 555 aa  540  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  53.86 
 
 		 561 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  49.48 
 
 		 605 aa  533  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  53.45 
 
 		 540 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  54.14 
 
 		 548 aa  533  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  53.12 
 
 		 587 aa  530  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  51.76 
 
 		 524 aa  525  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  54.38 
 
 		 511 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  51.45 
 
 		 539 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  47.91 
 
 		 593 aa  518  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  51.74 
 
 		 563 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  50.37 
 
 		 533 aa  512  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  50.35 
 
 		 571 aa  514  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  53.56 
 
 		 532 aa  512  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  50.72 
 
 		 534 aa  511  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  51.09 
 
 		 576 aa  508  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  49.91 
 
 		 570 aa  506  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  48.13 
 
 		 607 aa  504  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  47.26 
 
 		 609 aa  499  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  50.37 
 
 		 546 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  46.46 
 
 		 640 aa  491  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  51.37 
 
 		 539 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  50.18 
 
 		 546 aa  486  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  51.37 
 
 		 539 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  51.37 
 
 		 539 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  51.2 
 
 		 565 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  46.25 
 
 		 568 aa  483  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  48.29 
 
 		 573 aa  481  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  48.29 
 
 		 561 aa  478  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  47.26 
 
 		 572 aa  472  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  49.27 
 
 		 599 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  48.3 
 
 		 560 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  46.32 
 
 		 570 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  47.58 
 
 		 567 aa  455  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  54.89 
 
 		 594 aa  455  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  48.01 
 
 		 555 aa  451  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  48.9 
 
 		 560 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  44.58 
 
 		 544 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  43.79 
 
 		 563 aa  437  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  51.58 
 
 		 548 aa  435  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  42.5 
 
 		 604 aa  437  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  47.02 
 
 		 634 aa  435  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  45.42 
 
 		 556 aa  428  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  47.52 
 
 		 543 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  40.81 
 
 		 525 aa  362  1e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  40.46 
 
 		 532 aa  358  9.999999999999999e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  39.38 
 
 		 536 aa  342  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  38.32 
 
 		 543 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  39.71 
 
 		 539 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  38.95 
 
 		 553 aa  332  9e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  38.21 
 
 		 535 aa  332  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  40.52 
 
 		 529 aa  331  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.28 
 
 		 515 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  40.52 
 
 		 541 aa  330  4e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  38.99 
 
 		 533 aa  329  1.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  42.17 
 
 		 541 aa  327  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  38.6 
 
 		 540 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  38.07 
 
 		 538 aa  326  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  41.15 
 
 		 518 aa  325  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  37.74 
 
 		 545 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  41.19 
 
 		 542 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  40.15 
 
 		 530 aa  318  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  41.42 
 
 		 535 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  41.28 
 
 		 528 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  36.03 
 
 		 530 aa  310  5.9999999999999995e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  37.19 
 
 		 547 aa  309  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  37.77 
 
 		 540 aa  309  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  42.17 
 
 		 448 aa  307  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  39.23 
 
 		 540 aa  306  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  39.9 
 
 		 546 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  35.15 
 
 		 548 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  36.31 
 
 		 555 aa  304  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  35.83 
 
 		 552 aa  303  5.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  36.19 
 
 		 550 aa  302  8.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  38.52 
 
 		 543 aa  302  9e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  37.33 
 
 		 537 aa  301  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  37.45 
 
 		 549 aa  301  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>