More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1150 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 634 aa  1254    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  67.67 
 
 		 594 aa  723    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  54.07 
 
 		 531 aa  541  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  54.32 
 
 		 544 aa  531  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  54.1 
 
 		 550 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  52.28 
 
 		 533 aa  513  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  52.84 
 
 		 522 aa  514  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  50.54 
 
 		 534 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  54.04 
 
 		 538 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  51.87 
 
 		 543 aa  508  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  51.39 
 
 		 566 aa  503  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  53.83 
 
 		 511 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  50.92 
 
 		 538 aa  500  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  51.99 
 
 		 567 aa  501  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  50.54 
 
 		 533 aa  498  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  52.92 
 
 		 532 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  51.22 
 
 		 543 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  51.99 
 
 		 540 aa  494  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  50.28 
 
 		 507 aa  490  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  49.65 
 
 		 570 aa  487  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  52.87 
 
 		 555 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  48.55 
 
 		 587 aa  481  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  49.64 
 
 		 545 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  50.26 
 
 		 571 aa  475  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  48.07 
 
 		 544 aa  475  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  46.97 
 
 		 605 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  53.07 
 
 		 524 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  47.65 
 
 		 553 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  45.91 
 
 		 593 aa  469  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  51.87 
 
 		 560 aa  467  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  50 
 
 		 546 aa  462  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  46.31 
 
 		 558 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  48.66 
 
 		 539 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  48.66 
 
 		 539 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  49.27 
 
 		 543 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  45.77 
 
 		 563 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  48.66 
 
 		 539 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  51.91 
 
 		 544 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  45.52 
 
 		 576 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  48.94 
 
 		 548 aa  443  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  46.82 
 
 		 565 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  49.39 
 
 		 554 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  53.88 
 
 		 546 aa  437  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  52.65 
 
 		 599 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  47.4 
 
 		 561 aa  438  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  46.95 
 
 		 539 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  49.05 
 
 		 607 aa  432  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  47.21 
 
 		 554 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  46.49 
 
 		 560 aa  431  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  46.67 
 
 		 549 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  47.89 
 
 		 542 aa  431  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  47.79 
 
 		 609 aa  429  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  46.09 
 
 		 512 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  43.78 
 
 		 568 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  50.82 
 
 		 573 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  44.73 
 
 		 580 aa  415  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  45.36 
 
 		 561 aa  412  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  50.65 
 
 		 555 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  46.21 
 
 		 640 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  43.74 
 
 		 570 aa  405  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  40.51 
 
 		 563 aa  400  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  46.37 
 
 		 560 aa  398  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  44.92 
 
 		 567 aa  399  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  42.41 
 
 		 556 aa  393  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  43.32 
 
 		 572 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  40.91 
 
 		 604 aa  389  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  46.42 
 
 		 548 aa  381  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  43.64 
 
 		 532 aa  345  2e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  40.6 
 
 		 525 aa  343  5e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  45.09 
 
 		 536 aa  342  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  44.98 
 
 		 540 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  43.03 
 
 		 533 aa  339  8e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  42.31 
 
 		 535 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  42.95 
 
 		 553 aa  336  7.999999999999999e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  46.1 
 
 		 529 aa  333  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  44.49 
 
 		 538 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  47.88 
 
 		 528 aa  330  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  44.42 
 
 		 541 aa  330  6e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  43.03 
 
 		 537 aa  325  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  43.11 
 
 		 541 aa  323  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  45.25 
 
 		 537 aa  323  7e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  47 
 
 		 515 aa  323  8e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  44.04 
 
 		 542 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  46.22 
 
 		 542 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  45.21 
 
 		 530 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  42.24 
 
 		 539 aa  320  5e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  46.41 
 
 		 448 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  45.62 
 
 		 518 aa  317  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  44.67 
 
 		 540 aa  317  6e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  40.89 
 
 		 545 aa  316  8e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  43.52 
 
 		 557 aa  316  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  45.68 
 
 		 540 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  45.4 
 
 		 735 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  47.5 
 
 		 546 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  40.13 
 
 		 543 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  41.91 
 
 		 549 aa  314  3.9999999999999997e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  38.57 
 
 		 568 aa  313  6.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  39.76 
 
 		 555 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  39.14 
 
 		 537 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  41.58 
 
 		 543 aa  310  4e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>