More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24650 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  58.04 
 
 		 563 aa  647    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  66.96 
 
 		 570 aa  728    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  66.21 
 
 		 572 aa  722    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  69.01 
 
 		 568 aa  776    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  62.61 
 
 		 560 aa  647    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  100 
 
 		 567 aa  1138    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  61.9 
 
 		 560 aa  606  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  51.07 
 
 		 604 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  51.9 
 
 		 539 aa  546  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  54.83 
 
 		 507 aa  548  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  51.9 
 
 		 566 aa  528  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  51.97 
 
 		 567 aa  520  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  52.3 
 
 		 533 aa  521  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  52.5 
 
 		 540 aa  514  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  51.91 
 
 		 571 aa  514  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  54.02 
 
 		 544 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  50.17 
 
 		 570 aa  508  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  48.72 
 
 		 605 aa  502  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  49.07 
 
 		 563 aa  503  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  48.24 
 
 		 593 aa  499  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  49.74 
 
 		 576 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  50.52 
 
 		 543 aa  499  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  50.61 
 
 		 543 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  53.42 
 
 		 546 aa  497  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  49.64 
 
 		 556 aa  497  1e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  48.78 
 
 		 538 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  52.58 
 
 		 565 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  48.36 
 
 		 609 aa  488  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  52.09 
 
 		 522 aa  489  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  50 
 
 		 599 aa  488  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  50.56 
 
 		 545 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  50.88 
 
 		 538 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  51.33 
 
 		 550 aa  477  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  51.09 
 
 		 512 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  50.71 
 
 		 554 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  50.45 
 
 		 511 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  50 
 
 		 555 aa  467  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  49.91 
 
 		 531 aa  468  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  47.93 
 
 		 553 aa  464  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  47.12 
 
 		 640 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  46.85 
 
 		 534 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  48.87 
 
 		 561 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  45.73 
 
 		 524 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  47.43 
 
 		 560 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  45.57 
 
 		 607 aa  452  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  47.68 
 
 		 544 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  48.43 
 
 		 558 aa  445  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  49.2 
 
 		 573 aa  445  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  48.74 
 
 		 532 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  47.45 
 
 		 554 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  47.58 
 
 		 549 aa  438  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  49.1 
 
 		 555 aa  434  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  46.29 
 
 		 587 aa  431  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  46.42 
 
 		 533 aa  428  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  47.76 
 
 		 542 aa  424  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  45.88 
 
 		 546 aa  410  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  46.41 
 
 		 539 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  46.41 
 
 		 539 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  46.41 
 
 		 539 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  45.39 
 
 		 580 aa  398  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  44.74 
 
 		 561 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  44.92 
 
 		 634 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  49.29 
 
 		 548 aa  391  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  44.59 
 
 		 548 aa  385  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  47.54 
 
 		 594 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  41.36 
 
 		 544 aa  376  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  42.63 
 
 		 543 aa  362  9e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  40.19 
 
 		 532 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  38.85 
 
 		 540 aa  311  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  36.98 
 
 		 538 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  37.78 
 
 		 525 aa  304  3.0000000000000004e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  37.95 
 
 		 547 aa  301  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  37.32 
 
 		 529 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  37.91 
 
 		 536 aa  297  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  37.76 
 
 		 548 aa  294  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  35.6 
 
 		 553 aa  293  5e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  37.63 
 
 		 548 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  36.62 
 
 		 545 aa  289  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  37.36 
 
 		 555 aa  288  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  36.35 
 
 		 586 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  38.35 
 
 		 535 aa  282  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  36.67 
 
 		 533 aa  281  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  33.63 
 
 		 543 aa  280  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  35.7 
 
 		 553 aa  279  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  38.37 
 
 		 557 aa  278  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  38.35 
 
 		 540 aa  276  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  38.06 
 
 		 528 aa  276  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  36.78 
 
 		 538 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  36.46 
 
 		 543 aa  275  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  39.83 
 
 		 448 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.31 
 
 		 515 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  34.21 
 
 		 538 aa  273  9e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  33.74 
 
 		 552 aa  273  9e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  36.93 
 
 		 542 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  38.26 
 
 		 536 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  38.29 
 
 		 541 aa  270  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  33.95 
 
 		 549 aa  270  5.9999999999999995e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2620  alpha amylase catalytic region  38.39 
 
 		 560 aa  270  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  38.38 
 
 		 542 aa  270  7e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  35.86 
 
 		 550 aa  270  8e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>