More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3695 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 524 aa  1056    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  55.19 
 
 		 533 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  56.85 
 
 		 544 aa  559  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  57.17 
 
 		 522 aa  558  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  57.2 
 
 		 550 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  57.78 
 
 		 538 aa  534  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  54.91 
 
 		 538 aa  534  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  54.36 
 
 		 545 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  53.6 
 
 		 543 aa  525  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  53.05 
 
 		 543 aa  528  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  52.96 
 
 		 567 aa  522  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  52.45 
 
 		 531 aa  522  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  52.28 
 
 		 507 aa  515  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  51 
 
 		 566 aa  512  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  53.52 
 
 		 555 aa  512  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  50.45 
 
 		 558 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  50.56 
 
 		 560 aa  510  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  51.19 
 
 		 539 aa  508  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  51.3 
 
 		 534 aa  505  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  52.67 
 
 		 511 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  49.91 
 
 		 544 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  49.72 
 
 		 540 aa  501  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  49.82 
 
 		 554 aa  495  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  50.44 
 
 		 571 aa  495  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  51.45 
 
 		 570 aa  494  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  51.01 
 
 		 576 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  51.27 
 
 		 561 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  47.84 
 
 		 605 aa  491  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  51.59 
 
 		 549 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  52.18 
 
 		 532 aa  489  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  49.62 
 
 		 587 aa  484  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  46.9 
 
 		 593 aa  483  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  48.78 
 
 		 512 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  48.35 
 
 		 553 aa  479  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  50.09 
 
 		 563 aa  479  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  50.83 
 
 		 542 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  49.25 
 
 		 533 aa  474  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  48.64 
 
 		 554 aa  472  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  50.64 
 
 		 546 aa  471  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  47.93 
 
 		 609 aa  468  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  50.36 
 
 		 607 aa  464  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  44.17 
 
 		 568 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  51.21 
 
 		 565 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  50.09 
 
 		 546 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  49.74 
 
 		 599 aa  450  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  53.07 
 
 		 634 aa  448  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  47.46 
 
 		 640 aa  450  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  49.16 
 
 		 539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  49.16 
 
 		 539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  49.16 
 
 		 539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  49.07 
 
 		 548 aa  444  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  45.39 
 
 		 570 aa  442  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  45.85 
 
 		 560 aa  439  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  52.81 
 
 		 555 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  52.42 
 
 		 594 aa  435  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  45.73 
 
 		 567 aa  436  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  43.97 
 
 		 572 aa  435  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  47.96 
 
 		 580 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  44.57 
 
 		 556 aa  426  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  43.41 
 
 		 604 aa  419  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  48.26 
 
 		 573 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  46.97 
 
 		 543 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  45.96 
 
 		 544 aa  412  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  39.08 
 
 		 563 aa  404  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  46.35 
 
 		 560 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  44.29 
 
 		 561 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  49.44 
 
 		 548 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  43.34 
 
 		 529 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  42.64 
 
 		 532 aa  337  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  41.79 
 
 		 525 aa  336  7e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  40.34 
 
 		 540 aa  329  6e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  40.35 
 
 		 549 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  41.89 
 
 		 535 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  39.59 
 
 		 545 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  41.81 
 
 		 541 aa  325  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  40.26 
 
 		 536 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  38.33 
 
 		 553 aa  325  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  42.58 
 
 		 518 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  40.73 
 
 		 533 aa  318  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  41.51 
 
 		 528 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  40.98 
 
 		 542 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  40.79 
 
 		 541 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  41.98 
 
 		 543 aa  313  2.9999999999999996e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  44.42 
 
 		 448 aa  312  9e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  39.36 
 
 		 539 aa  312  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  39.01 
 
 		 543 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  43.08 
 
 		 535 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.9 
 
 		 515 aa  306  7e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  39.02 
 
 		 538 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  42.44 
 
 		 735 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0184  alpha amylase, catalytic region  39.26 
 
 		 547 aa  301  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  41.58 
 
 		 540 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  39.88 
 
 		 547 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  45.71 
 
 		 546 aa  297  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  41.15 
 
 		 530 aa  296  7e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  39.16 
 
 		 555 aa  295  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  39.49 
 
 		 540 aa  294  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  40.36 
 
 		 537 aa  294  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  34.17 
 
 		 560 aa  293  4e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1328  alpha amylase catalytic region  43 
 
 		 546 aa  292  1e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>