More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2798 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
548 aa  1091    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  55.27 
 
 
533 aa  553  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  53.07 
 
 
544 aa  549  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  53.82 
 
 
560 aa  551  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  56.67 
 
 
544 aa  532  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  54.98 
 
 
567 aa  531  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  52.84 
 
 
566 aa  525  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  53.78 
 
 
549 aa  521  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  52.88 
 
 
558 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  52.2 
 
 
553 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  54.3 
 
 
550 aa  513  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  53.49 
 
 
522 aa  514  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  52.08 
 
 
540 aa  510  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  49.91 
 
 
593 aa  509  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  51.04 
 
 
605 aa  507  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  52.69 
 
 
531 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  53.86 
 
 
554 aa  501  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  51.84 
 
 
545 aa  500  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  51.67 
 
 
507 aa  501  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  53.65 
 
 
555 aa  495  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  52.65 
 
 
538 aa  498  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  52.81 
 
 
511 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  49.64 
 
 
533 aa  493  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  51.43 
 
 
571 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  48.35 
 
 
576 aa  490  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  52.37 
 
 
538 aa  489  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  51.51 
 
 
570 aa  486  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  48.57 
 
 
534 aa  484  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  51.64 
 
 
546 aa  480  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  51.68 
 
 
512 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  49.81 
 
 
587 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  49.47 
 
 
543 aa  478  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  52.43 
 
 
561 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  51.29 
 
 
539 aa  475  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  52.1 
 
 
554 aa  477  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  53.16 
 
 
532 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  49.07 
 
 
524 aa  472  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  50.36 
 
 
563 aa  473  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  50.64 
 
 
546 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  52.48 
 
 
542 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  47.47 
 
 
607 aa  471  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  50.75 
 
 
573 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  49.19 
 
 
543 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  50.28 
 
 
539 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  50.28 
 
 
539 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  48.86 
 
 
580 aa  463  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  50.09 
 
 
539 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  53.04 
 
 
599 aa  461  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  46.95 
 
 
568 aa  458  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  46.68 
 
 
561 aa  450  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  46.25 
 
 
609 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  50.6 
 
 
594 aa  443  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  44.52 
 
 
570 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  47.11 
 
 
565 aa  441  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  45.45 
 
 
572 aa  435  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  50.18 
 
 
634 aa  432  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  52.37 
 
 
548 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  46.01 
 
 
640 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  52.14 
 
 
555 aa  430  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  47.99 
 
 
560 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  49.26 
 
 
560 aa  413  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  44.36 
 
 
556 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  40.53 
 
 
563 aa  397  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  43.75 
 
 
544 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  44.59 
 
 
567 aa  395  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  46.48 
 
 
543 aa  388  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  39.32 
 
 
604 aa  369  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  38.27 
 
 
532 aa  335  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  39.71 
 
 
536 aa  334  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  38.17 
 
 
525 aa  331  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  40.73 
 
 
545 aa  330  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  36.52 
 
 
535 aa  329  8e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  38.97 
 
 
555 aa  328  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  41.5 
 
 
518 aa  327  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  38.71 
 
 
548 aa  327  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  41.13 
 
 
529 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  38.29 
 
 
548 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  40.98 
 
 
543 aa  318  1e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  37.9 
 
 
550 aa  317  5e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.79 
 
 
515 aa  316  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  37.79 
 
 
540 aa  313  5.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  35.47 
 
 
543 aa  313  6.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  37.8 
 
 
549 aa  311  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  38.49 
 
 
538 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  37.75 
 
 
547 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  39.5 
 
 
735 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  38.99 
 
 
553 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  39.51 
 
 
541 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  39.96 
 
 
540 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2954  alpha amylase catalytic region  36.7 
 
 
549 aa  305  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067439 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  39.19 
 
 
537 aa  303  7.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  36.28 
 
 
530 aa  303  7.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  39.66 
 
 
541 aa  303  8.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  39.3 
 
 
538 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  38.75 
 
 
539 aa  300  4e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  36.84 
 
 
552 aa  299  7e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  41.68 
 
 
448 aa  299  7e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  40.24 
 
 
537 aa  299  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  38.73 
 
 
540 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  34.15 
 
 
568 aa  297  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0194055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>