More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0833 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  62.06 
 
 		 566 aa  645    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  65.04 
 
 		 550 aa  650    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  100 
 
 		 544 aa  1097    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  74.1 
 
 		 533 aa  784    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  68.63 
 
 		 522 aa  685    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  61.96 
 
 		 538 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  62.69 
 
 		 507 aa  637    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  61.03 
 
 		 567 aa  634  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  62.29 
 
 		 545 aa  630  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  57.58 
 
 		 544 aa  623  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  56.19 
 
 		 593 aa  618  1e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  62.97 
 
 		 538 aa  616  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  59.38 
 
 		 543 aa  615  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  61.84 
 
 		 555 aa  613  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  60.89 
 
 		 543 aa  611  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  60.87 
 
 		 531 aa  609  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  56.75 
 
 		 605 aa  606  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  56.49 
 
 		 571 aa  587  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  56.85 
 
 		 524 aa  584  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  57.83 
 
 		 549 aa  582  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  54.21 
 
 		 560 aa  580  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  58.16 
 
 		 540 aa  578  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  56.19 
 
 		 553 aa  580  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  56.6 
 
 		 534 aa  579  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  57.36 
 
 		 587 aa  577  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  57.14 
 
 		 558 aa  576  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  60.94 
 
 		 511 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  57.39 
 
 		 533 aa  572  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  59.89 
 
 		 532 aa  569  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  55.56 
 
 		 563 aa  565  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  58.02 
 
 		 539 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  58.02 
 
 		 539 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  58.02 
 
 		 539 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  55.3 
 
 		 565 aa  555  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  55.43 
 
 		 576 aa  555  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  56.55 
 
 		 554 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  53.38 
 
 		 568 aa  554  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  55.9 
 
 		 560 aa  551  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  57.71 
 
 		 546 aa  551  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  54.63 
 
 		 554 aa  545  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  52.18 
 
 		 570 aa  547  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  55.07 
 
 		 561 aa  545  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  51.69 
 
 		 609 aa  546  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  51.53 
 
 		 607 aa  544  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  54.8 
 
 		 512 aa  542  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  54.77 
 
 		 599 aa  536  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  54.69 
 
 		 542 aa  536  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  56.86 
 
 		 546 aa  537  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  52.81 
 
 		 640 aa  538  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  55 
 
 		 548 aa  537  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  52.15 
 
 		 572 aa  532  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  54.83 
 
 		 594 aa  529  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  54.32 
 
 		 634 aa  529  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  52.98 
 
 		 539 aa  528  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  52.5 
 
 		 570 aa  530  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  54.02 
 
 		 567 aa  519  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  53.45 
 
 		 573 aa  513  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  55.17 
 
 		 555 aa  509  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  48.49 
 
 		 563 aa  499  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  52.12 
 
 		 544 aa  500  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  50.09 
 
 		 580 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  49.64 
 
 		 561 aa  478  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  54.74 
 
 		 548 aa  468  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  52.29 
 
 		 560 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  45.11 
 
 		 604 aa  467  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  47.68 
 
 		 556 aa  464  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  49.91 
 
 		 543 aa  437  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  44.53 
 
 		 532 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  43.41 
 
 		 525 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  42.11 
 
 		 540 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.95 
 
 		 515 aa  362  9e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  43.8 
 
 		 529 aa  361  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  45.35 
 
 		 543 aa  357  2.9999999999999997e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  44.36 
 
 		 537 aa  356  5e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  41.99 
 
 		 555 aa  356  6.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  40.91 
 
 		 533 aa  343  4e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  40.56 
 
 		 548 aa  343  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  38.32 
 
 		 535 aa  342  9e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  42.67 
 
 		 541 aa  342  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  41.99 
 
 		 548 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  40.58 
 
 		 544 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  41.92 
 
 		 550 aa  336  5e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  40.85 
 
 		 553 aa  336  5e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  41.82 
 
 		 536 aa  336  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  42.97 
 
 		 540 aa  336  7e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  42.26 
 
 		 537 aa  335  7.999999999999999e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  41.56 
 
 		 539 aa  335  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  41.48 
 
 		 586 aa  335  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  42.18 
 
 		 541 aa  334  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  43.92 
 
 		 542 aa  332  9e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  40.59 
 
 		 538 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  44.17 
 
 		 557 aa  332  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  42.1 
 
 		 518 aa  331  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  41.53 
 
 		 547 aa  330  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  37.39 
 
 		 543 aa  330  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  44.67 
 
 		 535 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  38.58 
 
 		 568 aa  329  6e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  41.55 
 
 		 553 aa  329  7e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  40.33 
 
 		 545 aa  329  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  38.29 
 
 		 530 aa  327  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>