More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_02470 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  60.55 
 
 
566 aa  642    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  55.7 
 
 
605 aa  651    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  56 
 
 
593 aa  639    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  100 
 
 
576 aa  1175    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  62.34 
 
 
567 aa  671    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  72.24 
 
 
565 aa  800    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  58.66 
 
 
571 aa  634  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  54.79 
 
 
609 aa  607  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  58.49 
 
 
599 aa  603  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  59.04 
 
 
546 aa  588  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  55.34 
 
 
570 aa  589  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  57.04 
 
 
640 aa  590  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  55.18 
 
 
607 aa  587  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  55.99 
 
 
538 aa  570  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  54.66 
 
 
507 aa  562  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  55.52 
 
 
550 aa  559  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  53.99 
 
 
540 aa  558  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  51.66 
 
 
563 aa  546  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  55.43 
 
 
544 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  55.23 
 
 
538 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  53.51 
 
 
522 aa  533  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  51.28 
 
 
533 aa  535  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  52.55 
 
 
544 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  51.69 
 
 
543 aa  531  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  54.21 
 
 
545 aa  528  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  50.8 
 
 
568 aa  526  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  51.96 
 
 
543 aa  526  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  52.81 
 
 
573 aa  524  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  51.52 
 
 
534 aa  525  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  52.01 
 
 
539 aa  519  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  50.72 
 
 
560 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  51.44 
 
 
561 aa  518  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  51.01 
 
 
554 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  50.91 
 
 
524 aa  514  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  50 
 
 
553 aa  510  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  52.17 
 
 
555 aa  508  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  51.1 
 
 
531 aa  510  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  51.51 
 
 
555 aa  503  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  49.74 
 
 
567 aa  500  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  46.17 
 
 
563 aa  496  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  49.38 
 
 
570 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  50.56 
 
 
511 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  48.5 
 
 
558 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  51.09 
 
 
549 aa  487  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  50.27 
 
 
554 aa  486  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  48.62 
 
 
587 aa  485  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  51.1 
 
 
560 aa  482  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  49.13 
 
 
572 aa  478  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  48.33 
 
 
512 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  48.94 
 
 
561 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  48.05 
 
 
560 aa  472  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  48.35 
 
 
548 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  45.86 
 
 
604 aa  466  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  47.24 
 
 
546 aa  465  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  47.5 
 
 
539 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  49.36 
 
 
532 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  47.33 
 
 
539 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  47.33 
 
 
539 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  48.55 
 
 
542 aa  457  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  45.4 
 
 
533 aa  457  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  48.63 
 
 
580 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  48.16 
 
 
556 aa  441  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  45.52 
 
 
634 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  49.63 
 
 
548 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  43.72 
 
 
544 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  47.65 
 
 
594 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  45.42 
 
 
543 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  39.26 
 
 
540 aa  343  4e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.24 
 
 
515 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  40.32 
 
 
535 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  39.06 
 
 
553 aa  330  4e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  41.99 
 
 
532 aa  326  8.000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  38.33 
 
 
543 aa  325  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  40.93 
 
 
530 aa  323  5e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  40.63 
 
 
542 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  39.71 
 
 
735 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  38.76 
 
 
538 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  38.96 
 
 
518 aa  317  4e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  39.66 
 
 
529 aa  316  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  38.49 
 
 
568 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  43.52 
 
 
541 aa  315  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  37.88 
 
 
564 aa  314  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  38.03 
 
 
525 aa  313  5.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  39.85 
 
 
539 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  36.89 
 
 
550 aa  313  7.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  38.1 
 
 
547 aa  310  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  40.56 
 
 
537 aa  309  9e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  36.48 
 
 
548 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  39.47 
 
 
540 aa  309  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  38.36 
 
 
537 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  38.1 
 
 
550 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  42.92 
 
 
540 aa  306  7e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  42.21 
 
 
541 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  36.25 
 
 
548 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  36.65 
 
 
543 aa  303  8.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  41.24 
 
 
448 aa  302  9e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  36.95 
 
 
540 aa  302  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  37.87 
 
 
536 aa  302  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  38.26 
 
 
533 aa  301  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  36.57 
 
 
540 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>