More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6968 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 561 aa  1135    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  49.82 
 
 		 567 aa  504  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  47.12 
 
 		 605 aa  487  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  47.65 
 
 		 507 aa  486  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  48.43 
 
 		 553 aa  482  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  47.15 
 
 		 566 aa  480  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  47.29 
 
 		 560 aa  475  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  48.94 
 
 		 576 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  48.46 
 
 		 549 aa  472  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  49.64 
 
 		 544 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  47.96 
 
 		 609 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  46.63 
 
 		 544 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  49.02 
 
 		 511 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  48.01 
 
 		 571 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  47.95 
 
 		 607 aa  463  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  47.76 
 
 		 565 aa  458  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  46.47 
 
 		 563 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  47.57 
 
 		 542 aa  452  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  47.5 
 
 		 546 aa  450  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  45.06 
 
 		 533 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  45.97 
 
 		 587 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  46.11 
 
 		 543 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  46.09 
 
 		 543 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  45.74 
 
 		 539 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  45.21 
 
 		 570 aa  444  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  46.11 
 
 		 522 aa  442  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  46.8 
 
 		 554 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  48.04 
 
 		 555 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  45.42 
 
 		 593 aa  441  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  44.52 
 
 		 568 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  47.67 
 
 		 561 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  51.09 
 
 		 599 aa  438  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  47.13 
 
 		 554 aa  437  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  44.83 
 
 		 558 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  45.26 
 
 		 534 aa  436  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  45.71 
 
 		 531 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  46.68 
 
 		 548 aa  434  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  47.69 
 
 		 546 aa  435  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  42.96 
 
 		 533 aa  435  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  44.33 
 
 		 640 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  45.77 
 
 		 573 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  46.75 
 
 		 538 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  45.31 
 
 		 538 aa  432  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  46.57 
 
 		 545 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  46.54 
 
 		 555 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  49.02 
 
 		 550 aa  428  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  43.88 
 
 		 540 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  45.83 
 
 		 512 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  45.25 
 
 		 572 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  41.93 
 
 		 563 aa  419  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  45.77 
 
 		 539 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  45.77 
 
 		 539 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  44.29 
 
 		 524 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  45.77 
 
 		 539 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  43.84 
 
 		 570 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  43.36 
 
 		 556 aa  417  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  45.36 
 
 		 560 aa  408  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  45.36 
 
 		 634 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  44.14 
 
 		 580 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  44.74 
 
 		 567 aa  402  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  47.95 
 
 		 560 aa  402  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  41.27 
 
 		 604 aa  399  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  45.52 
 
 		 532 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  45.06 
 
 		 594 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  44.08 
 
 		 544 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  44.72 
 
 		 543 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  47.83 
 
 		 548 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  37.79 
 
 		 532 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  39.39 
 
 		 540 aa  312  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  39.18 
 
 		 535 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  37.84 
 
 		 553 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  39.46 
 
 		 529 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  38.7 
 
 		 735 aa  303  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  39.05 
 
 		 541 aa  299  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  36.28 
 
 		 525 aa  296  5e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  39.5 
 
 		 541 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  41.51 
 
 		 540 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  37.2 
 
 		 543 aa  291  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  37.28 
 
 		 536 aa  290  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  40.12 
 
 		 448 aa  289  7e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  35.79 
 
 		 564 aa  289  9e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  38.09 
 
 		 533 aa  289  9e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  41.68 
 
 		 542 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  41.34 
 
 		 528 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  37.01 
 
 		 545 aa  287  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  34.23 
 
 		 568 aa  288  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  39.08 
 
 		 524 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  39.71 
 
 		 538 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  42.48 
 
 		 546 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  37.98 
 
 		 537 aa  284  4.0000000000000003e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  38.08 
 
 		 556 aa  283  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  38.13 
 
 		 538 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.73 
 
 		 515 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  34.63 
 
 		 562 aa  281  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  40.96 
 
 		 540 aa  280  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  36.38 
 
 		 555 aa  279  8e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  36.99 
 
 		 543 aa  279  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  38.41 
 
 		 539 aa  277  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  33.94 
 
 		 563 aa  276  9e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  35.08 
 
 		 555 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>