More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1794 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 543 aa  1086    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  51.53 
 
 		 545 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  50.93 
 
 		 543 aa  485  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  51.6 
 
 		 543 aa  481  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  49.43 
 
 		 533 aa  480  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  51.63 
 
 		 538 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  51.77 
 
 		 538 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  53.69 
 
 		 532 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  51.34 
 
 		 522 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  48.79 
 
 		 534 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  50.18 
 
 		 550 aa  463  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  47.88 
 
 		 507 aa  463  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  48.09 
 
 		 540 aa  460  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  47.76 
 
 		 533 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  51.24 
 
 		 511 aa  458  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  49.46 
 
 		 634 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  45.96 
 
 		 560 aa  448  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  50.09 
 
 		 544 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  47.41 
 
 		 553 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  48.1 
 
 		 594 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  47.89 
 
 		 571 aa  436  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  47.58 
 
 		 567 aa  433  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  46.37 
 
 		 512 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  46.8 
 
 		 524 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  46.14 
 
 		 587 aa  431  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  46.93 
 
 		 566 aa  431  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  47.5 
 
 		 546 aa  427  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  46.86 
 
 		 531 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  50.18 
 
 		 555 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  44.87 
 
 		 561 aa  425  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  46.01 
 
 		 544 aa  425  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  46.9 
 
 		 609 aa  425  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  45.55 
 
 		 542 aa  419  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  45.19 
 
 		 554 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  47.09 
 
 		 539 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  44.14 
 
 		 570 aa  414  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  45.5 
 
 		 576 aa  413  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  42.31 
 
 		 605 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  41.9 
 
 		 593 aa  411  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  45.39 
 
 		 544 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  46.13 
 
 		 565 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  42.11 
 
 		 607 aa  404  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  47.18 
 
 		 549 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  47.22 
 
 		 539 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  46.97 
 
 		 546 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  47.22 
 
 		 539 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  47.23 
 
 		 539 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  45.6 
 
 		 599 aa  401  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  47.27 
 
 		 554 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  44.93 
 
 		 563 aa  396  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  44.85 
 
 		 548 aa  395  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  43.09 
 
 		 558 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  41.28 
 
 		 563 aa  391  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  41.92 
 
 		 640 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  42.23 
 
 		 568 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  45.1 
 
 		 561 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  43.35 
 
 		 555 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  44.57 
 
 		 573 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  43.85 
 
 		 560 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  42.66 
 
 		 567 aa  371  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  43.58 
 
 		 580 aa  372  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  40.33 
 
 		 553 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  41.83 
 
 		 572 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  40.46 
 
 		 540 aa  360  5e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  38.7 
 
 		 604 aa  359  6e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  41.31 
 
 		 570 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  41.18 
 
 		 536 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  42.03 
 
 		 556 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  43.14 
 
 		 560 aa  352  1e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  42.3 
 
 		 533 aa  352  1e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  41.06 
 
 		 538 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  40.41 
 
 		 525 aa  347  3e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  40.3 
 
 		 532 aa  347  4e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  40.98 
 
 		 529 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  41.3 
 
 		 541 aa  344  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  40.69 
 
 		 539 aa  343  5e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  43.61 
 
 		 528 aa  342  9e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  39.78 
 
 		 543 aa  340  4e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  45.85 
 
 		 548 aa  338  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  39.72 
 
 		 535 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  40.87 
 
 		 541 aa  337  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  41.37 
 
 		 540 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  45.52 
 
 		 448 aa  336  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  40.45 
 
 		 537 aa  337  5e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  39.52 
 
 		 537 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  40.78 
 
 		 553 aa  334  3e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  42.38 
 
 		 540 aa  332  8e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  41.42 
 
 		 542 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  42.18 
 
 		 518 aa  330  6e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  41.53 
 
 		 546 aa  327  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  40.75 
 
 		 537 aa  327  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2954  alpha amylase catalytic region  38.07 
 
 		 549 aa  327  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  40.11 
 
 		 538 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  43.98 
 
 		 735 aa  326  6e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  38.3 
 
 		 550 aa  326  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  41.86 
 
 		 524 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  40.68 
 
 		 555 aa  325  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  40.08 
 
 		 545 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  40.15 
 
 		 547 aa  325  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  42.19 
 
 		 535 aa  323  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>