More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4692 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  65 
 
 
553 aa  716    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
580 aa  1156    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  69.2 
 
 
554 aa  713    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  56.28 
 
 
560 aa  634  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  61.65 
 
 
542 aa  622  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  56.77 
 
 
544 aa  615  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  56.79 
 
 
512 aa  564  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  53.49 
 
 
549 aa  555  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  50.35 
 
 
558 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  51.61 
 
 
540 aa  531  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  49.24 
 
 
567 aa  525  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  50.09 
 
 
533 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  51.57 
 
 
539 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  51.38 
 
 
538 aa  518  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  50 
 
 
544 aa  514  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  52.67 
 
 
550 aa  511  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  50.09 
 
 
507 aa  506  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  52.6 
 
 
561 aa  502  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  50.94 
 
 
538 aa  499  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  51.58 
 
 
522 aa  496  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  50.7 
 
 
555 aa  497  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  51.57 
 
 
554 aa  495  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  47.67 
 
 
566 aa  494  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  48.67 
 
 
571 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  51.4 
 
 
546 aa  488  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  48.69 
 
 
545 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  48.63 
 
 
576 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  46.71 
 
 
563 aa  482  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  49.82 
 
 
511 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  48.13 
 
 
524 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  48.86 
 
 
548 aa  479  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  47.34 
 
 
570 aa  476  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  47.09 
 
 
531 aa  474  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  45.08 
 
 
605 aa  473  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  49.48 
 
 
543 aa  474  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  48.78 
 
 
543 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  44.32 
 
 
593 aa  467  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  45.19 
 
 
607 aa  467  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  46.31 
 
 
565 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  47.01 
 
 
587 aa  456  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  46.76 
 
 
533 aa  455  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  47.09 
 
 
609 aa  452  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  47.9 
 
 
532 aa  451  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  46.9 
 
 
599 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  44.08 
 
 
640 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  42.78 
 
 
568 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  45.02 
 
 
534 aa  443  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  46.09 
 
 
560 aa  441  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  43.31 
 
 
572 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  45.85 
 
 
573 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  42.25 
 
 
563 aa  436  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  47.04 
 
 
594 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  45.07 
 
 
634 aa  438  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  45.39 
 
 
567 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  44.14 
 
 
561 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  50.75 
 
 
555 aa  424  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  42.81 
 
 
570 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  44.79 
 
 
539 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  44.79 
 
 
539 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  41.76 
 
 
604 aa  418  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  44.62 
 
 
539 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  44.42 
 
 
546 aa  413  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  45.41 
 
 
560 aa  413  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  43.63 
 
 
544 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  44.83 
 
 
543 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  48.25 
 
 
548 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  43.34 
 
 
556 aa  385  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  43.75 
 
 
532 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  42.6 
 
 
536 aa  339  8e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  40.34 
 
 
540 aa  331  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.54 
 
 
515 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  41.8 
 
 
525 aa  320  5e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  36.82 
 
 
553 aa  320  6e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  40.29 
 
 
541 aa  317  5e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  37.7 
 
 
535 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  39.15 
 
 
735 aa  313  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  37.4 
 
 
555 aa  312  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  39.31 
 
 
529 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  39.75 
 
 
541 aa  310  4e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  42.68 
 
 
518 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  40.12 
 
 
538 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  36.06 
 
 
545 aa  304  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  41 
 
 
533 aa  304  4.0000000000000003e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  37.19 
 
 
549 aa  303  6.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  37.06 
 
 
550 aa  303  7.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  34.34 
 
 
543 aa  302  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  40.04 
 
 
539 aa  298  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  40.78 
 
 
540 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  41.05 
 
 
542 aa  295  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  35.43 
 
 
568 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  41.34 
 
 
448 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  34.89 
 
 
530 aa  295  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  37.71 
 
 
537 aa  295  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  37.87 
 
 
543 aa  294  3e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  38.65 
 
 
547 aa  292  9e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  40.16 
 
 
538 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4341  alpha amylase catalytic region  37.6 
 
 
539 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  36.16 
 
 
536 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  36.32 
 
 
536 aa  290  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  36.49 
 
 
536 aa  289  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>