More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3038 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  62.65 
 
 		 560 aa  669    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  84.91 
 
 		 570 aa  975    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  59.61 
 
 		 563 aa  683    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 568 aa  1155    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  69.01 
 
 		 567 aa  753    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  75.57 
 
 		 572 aa  862    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  58.63 
 
 		 560 aa  595  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  53.64 
 
 		 539 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  52.28 
 
 		 604 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  52.53 
 
 		 566 aa  560  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  52.26 
 
 		 567 aa  542  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  52.32 
 
 		 533 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  52.55 
 
 		 507 aa  540  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  52.27 
 
 		 571 aa  526  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  49.91 
 
 		 563 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  50.26 
 
 		 609 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  47.58 
 
 		 593 aa  518  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  53.33 
 
 		 565 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  53.38 
 
 		 544 aa  514  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  48.42 
 
 		 605 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  50.62 
 
 		 570 aa  509  1e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  50.8 
 
 		 576 aa  508  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  49.12 
 
 		 540 aa  500  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  47.83 
 
 		 553 aa  495  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  48.66 
 
 		 556 aa  495  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  48.25 
 
 		 607 aa  490  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  50.79 
 
 		 599 aa  489  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  45.98 
 
 		 560 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  51.21 
 
 		 573 aa  486  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  49.73 
 
 		 546 aa  479  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  50.63 
 
 		 522 aa  481  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  48.81 
 
 		 640 aa  481  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  48.68 
 
 		 558 aa  478  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  47.74 
 
 		 534 aa  474  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  46.77 
 
 		 544 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  49.19 
 
 		 542 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  46.97 
 
 		 543 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  48.19 
 
 		 531 aa  468  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  48.04 
 
 		 555 aa  465  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  49.55 
 
 		 550 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  47.86 
 
 		 538 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  47.71 
 
 		 554 aa  463  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  44.17 
 
 		 524 aa  464  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  49.01 
 
 		 554 aa  465  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  46.94 
 
 		 543 aa  464  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  48.1 
 
 		 512 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  50.09 
 
 		 511 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  48.74 
 
 		 561 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  47.42 
 
 		 538 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  46.68 
 
 		 545 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  46.31 
 
 		 587 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  45.92 
 
 		 546 aa  444  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  46.25 
 
 		 549 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  45.13 
 
 		 533 aa  444  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  46.63 
 
 		 539 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  46.63 
 
 		 539 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  46.63 
 
 		 539 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  47.9 
 
 		 555 aa  434  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  46.95 
 
 		 548 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  46.58 
 
 		 532 aa  425  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  44.52 
 
 		 561 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  50.45 
 
 		 548 aa  411  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  42.78 
 
 		 580 aa  398  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  43.78 
 
 		 634 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  42.86 
 
 		 594 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  40.03 
 
 		 544 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  42.01 
 
 		 543 aa  356  5e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  37.46 
 
 		 538 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  38.73 
 
 		 532 aa  322  8e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  39.36 
 
 		 536 aa  322  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  39.84 
 
 		 540 aa  320  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  38.65 
 
 		 553 aa  312  9e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  37.06 
 
 		 548 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  37.64 
 
 		 547 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  37.02 
 
 		 525 aa  309  6.999999999999999e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  36.65 
 
 		 545 aa  304  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  37.3 
 
 		 529 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  36.5 
 
 		 548 aa  302  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  37.65 
 
 		 543 aa  301  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  37.55 
 
 		 538 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  40.62 
 
 		 448 aa  292  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  38.53 
 
 		 540 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  37.03 
 
 		 555 aa  290  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  40.04 
 
 		 542 aa  288  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  36.72 
 
 		 542 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  36.34 
 
 		 535 aa  286  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  35.91 
 
 		 564 aa  286  8e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  36.82 
 
 		 537 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  35.77 
 
 		 550 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  36.06 
 
 		 553 aa  284  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  35.45 
 
 		 550 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  36.5 
 
 		 533 aa  283  7.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  35.96 
 
 		 550 aa  282  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  38.67 
 
 		 528 aa  282  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  39.88 
 
 		 536 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  35.45 
 
 		 552 aa  280  4e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  35.6 
 
 		 550 aa  280  4e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  35.15 
 
 		 568 aa  280  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  38.23 
 
 		 541 aa  280  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0184  alpha amylase, catalytic region  35.13 
 
 		 547 aa  279  9e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>