More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3849 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 554 aa  1111    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  83.09 
 
 		 561 aa  875    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  54.5 
 
 		 560 aa  570  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  53.06 
 
 		 566 aa  566  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  55.42 
 
 		 567 aa  568  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  55.39 
 
 		 538 aa  561  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  56.14 
 
 		 522 aa  557  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  56.36 
 
 		 544 aa  553  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  54.48 
 
 		 558 aa  554  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  53.19 
 
 		 571 aa  545  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  50.77 
 
 		 605 aa  543  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  56.12 
 
 		 512 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  55.35 
 
 		 550 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  52.5 
 
 		 533 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  54.4 
 
 		 553 aa  532  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  51.72 
 
 		 544 aa  534  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  52.99 
 
 		 540 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  52.75 
 
 		 545 aa  535  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  52.12 
 
 		 507 aa  529  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  52.57 
 
 		 543 aa  530  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  54.71 
 
 		 549 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  55.23 
 
 		 546 aa  530  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  54.94 
 
 		 555 aa  525  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  57.39 
 
 		 538 aa  526  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  52.13 
 
 		 543 aa  525  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  57.8 
 
 		 548 aa  525  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  50.09 
 
 		 570 aa  522  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  51.01 
 
 		 576 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  48.36 
 
 		 593 aa  523  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  51.93 
 
 		 531 aa  521  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  52.21 
 
 		 565 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  53.65 
 
 		 554 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  48.89 
 
 		 609 aa  510  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  49.37 
 
 		 563 aa  509  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  52.55 
 
 		 511 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  51.73 
 
 		 539 aa  500  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  48.66 
 
 		 568 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  48.64 
 
 		 524 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  49.73 
 
 		 533 aa  494  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  51.45 
 
 		 560 aa  492  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  49.19 
 
 		 534 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  51.18 
 
 		 542 aa  483  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  51.06 
 
 		 599 aa  483  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  48.71 
 
 		 640 aa  485  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  50.9 
 
 		 572 aa  484  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  52.1 
 
 		 548 aa  481  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  50.54 
 
 		 567 aa  481  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  48.99 
 
 		 587 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  52.57 
 
 		 532 aa  480  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  47.89 
 
 		 607 aa  478  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  50.63 
 
 		 560 aa  472  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  51.39 
 
 		 580 aa  472  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  48.57 
 
 		 570 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  46.51 
 
 		 563 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  49.82 
 
 		 546 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  49.06 
 
 		 573 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  48.18 
 
 		 555 aa  458  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  45.08 
 
 		 604 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  49.46 
 
 		 539 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  49.64 
 
 		 539 aa  452  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  49.64 
 
 		 539 aa  452  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  46.8 
 
 		 561 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  47.55 
 
 		 594 aa  443  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  44.5 
 
 		 544 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  49.69 
 
 		 556 aa  427  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  48.08 
 
 		 634 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  45.97 
 
 		 543 aa  418  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  41.01 
 
 		 553 aa  335  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  39.85 
 
 		 529 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  41.27 
 
 		 540 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.01 
 
 		 515 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  36.73 
 
 		 536 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  38.2 
 
 		 532 aa  309  9e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  39.13 
 
 		 543 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  37.38 
 
 		 535 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  38.87 
 
 		 533 aa  303  7.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  40.89 
 
 		 448 aa  302  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  39.33 
 
 		 735 aa  299  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  39.71 
 
 		 539 aa  298  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  38.01 
 
 		 525 aa  298  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  38.03 
 
 		 538 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  36.53 
 
 		 543 aa  296  7e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  38.08 
 
 		 545 aa  295  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  40.08 
 
 		 541 aa  293  5e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  39.47 
 
 		 549 aa  291  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  38.05 
 
 		 537 aa  290  4e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  38.83 
 
 		 518 aa  289  8e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  40.86 
 
 		 546 aa  289  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  37.52 
 
 		 555 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  39.28 
 
 		 541 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  40.38 
 
 		 538 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  38.87 
 
 		 528 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  37.73 
 
 		 568 aa  286  5.999999999999999e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1328  alpha amylase catalytic region  39.89 
 
 		 546 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  39.49 
 
 		 540 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  37.32 
 
 		 530 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  37.33 
 
 		 537 aa  283  5.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  35.82 
 
 		 540 aa  283  6.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  35.44 
 
 		 548 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  39.32 
 
 		 524 aa  281  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0394755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>