More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5859 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 558 aa  1112    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  56.47 
 
 		 544 aa  586  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  55.32 
 
 		 560 aa  577  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  56.51 
 
 		 533 aa  570  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  57.99 
 
 		 554 aa  565  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  55.32 
 
 		 549 aa  555  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  54.42 
 
 		 567 aa  546  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  56.25 
 
 		 544 aa  544  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  56.86 
 
 		 561 aa  543  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  54.66 
 
 		 538 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  53.75 
 
 		 553 aa  536  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  55.34 
 
 		 550 aa  531  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  54.17 
 
 		 538 aa  529  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  52.95 
 
 		 555 aa  522  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  54.48 
 
 		 554 aa  523  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  54.17 
 
 		 522 aa  523  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  53.11 
 
 		 542 aa  519  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  54.51 
 
 		 512 aa  518  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  54.24 
 
 		 540 aa  520  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  53.62 
 
 		 511 aa  518  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  50.45 
 
 		 524 aa  511  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  51.43 
 
 		 563 aa  510  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  51.35 
 
 		 545 aa  501  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  48.45 
 
 		 593 aa  503  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  52.17 
 
 		 571 aa  502  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  48.21 
 
 		 566 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  52.88 
 
 		 548 aa  496  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  51.68 
 
 		 543 aa  496  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  49.14 
 
 		 605 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  51.52 
 
 		 531 aa  494  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  51.24 
 
 		 543 aa  490  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  49.82 
 
 		 507 aa  488  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  50.35 
 
 		 580 aa  477  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  48.59 
 
 		 607 aa  478  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  48.68 
 
 		 568 aa  478  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  46.91 
 
 		 609 aa  476  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  49.27 
 
 		 570 aa  474  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  48.5 
 
 		 576 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  48.5 
 
 		 534 aa  473  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  49.01 
 
 		 533 aa  471  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  51.08 
 
 		 532 aa  467  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  49.28 
 
 		 565 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  48.53 
 
 		 572 aa  463  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  48.11 
 
 		 587 aa  463  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  50.09 
 
 		 599 aa  459  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  48.16 
 
 		 570 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  48.69 
 
 		 539 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  51.79 
 
 		 546 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  53.31 
 
 		 548 aa  449  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  46.21 
 
 		 640 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  47.98 
 
 		 573 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  49.37 
 
 		 546 aa  444  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  47.87 
 
 		 560 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  48.84 
 
 		 555 aa  431  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  48.94 
 
 		 539 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  47.39 
 
 		 594 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  48.94 
 
 		 539 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  48.94 
 
 		 539 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  48.43 
 
 		 567 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  43.38 
 
 		 563 aa  416  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  44.83 
 
 		 561 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  46.31 
 
 		 634 aa  414  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  48.4 
 
 		 560 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  45.9 
 
 		 556 aa  392  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  41.27 
 
 		 604 aa  388  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  42.96 
 
 		 544 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  42.78 
 
 		 543 aa  372  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  42.64 
 
 		 532 aa  335  1e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  40.18 
 
 		 525 aa  325  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.64 
 
 		 515 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  39.49 
 
 		 540 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  39.22 
 
 		 536 aa  310  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  39.11 
 
 		 543 aa  309  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  40.04 
 
 		 735 aa  306  7e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  38.79 
 
 		 538 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  38.46 
 
 		 549 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  41.58 
 
 		 541 aa  303  5.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  41.37 
 
 		 541 aa  303  5.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  38.66 
 
 		 533 aa  293  8e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  40.36 
 
 		 539 aa  292  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1328  alpha amylase catalytic region  41.48 
 
 		 546 aa  292  1e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  35.91 
 
 		 555 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  35.9 
 
 		 535 aa  291  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  37.57 
 
 		 537 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  37.99 
 
 		 553 aa  289  9e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  37.04 
 
 		 543 aa  288  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  36.57 
 
 		 544 aa  288  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  37.02 
 
 		 550 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  42.09 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  39.31 
 
 		 557 aa  285  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  39.26 
 
 		 537 aa  284  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  40.04 
 
 		 529 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  37.97 
 
 		 545 aa  283  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  37.31 
 
 		 568 aa  283  5.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  37.02 
 
 		 550 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  38.38 
 
 		 547 aa  283  9e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  36.11 
 
 		 586 aa  281  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  40.54 
 
 		 538 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  37.5 
 
 		 550 aa  281  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  36.52 
 
 		 548 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>