More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1328 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1328  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 546 aa  1079    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  43.29 
 
 		 525 aa  410  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  43.93 
 
 		 532 aa  411  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  43.97 
 
 		 536 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  45.29 
 
 		 533 aa  389  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  43.31 
 
 		 538 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  42.67 
 
 		 545 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  41.91 
 
 		 541 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  42.08 
 
 		 541 aa  375  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  39.24 
 
 		 553 aa  372  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  44.01 
 
 		 542 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  41.98 
 
 		 529 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  41.41 
 
 		 539 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  44.01 
 
 		 540 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  40.94 
 
 		 540 aa  371  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  42.88 
 
 		 538 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  45.4 
 
 		 542 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  41.27 
 
 		 547 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  43.73 
 
 		 530 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  40.8 
 
 		 535 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  37.92 
 
 		 543 aa  351  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  44.92 
 
 		 538 aa  351  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  43.38 
 
 		 534 aa  351  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  43.12 
 
 		 528 aa  350  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  41.51 
 
 		 540 aa  350  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  40.53 
 
 		 524 aa  349  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  44.92 
 
 		 540 aa  348  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  42.62 
 
 		 538 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  41.08 
 
 		 735 aa  340  4e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  41.83 
 
 		 546 aa  340  5e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  41.68 
 
 		 535 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  41.21 
 
 		 537 aa  337  5e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  38.43 
 
 		 549 aa  337  5e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  44.39 
 
 		 448 aa  333  6e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  37.72 
 
 		 586 aa  332  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  43.49 
 
 		 550 aa  331  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  42.31 
 
 		 522 aa  331  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  41.39 
 
 		 537 aa  329  8e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  41.05 
 
 		 587 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2311  alpha amylase, catalytic region  35.97 
 
 		 540 aa  327  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.679266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  43.47 
 
 		 545 aa  326  8.000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  43 
 
 		 524 aa  326  8.000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  35.97 
 
 		 540 aa  325  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3483  alpha amylase catalytic region  41.04 
 
 		 542 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906486  normal  0.657022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  44.58 
 
 		 543 aa  324  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  36.35 
 
 		 540 aa  325  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  40.37 
 
 		 537 aa  323  4e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2133  alpha amylase, catalytic region  36.16 
 
 		 540 aa  323  5e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  37.48 
 
 		 540 aa  323  6e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  38.1 
 
 		 541 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  37.71 
 
 		 544 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  41.45 
 
 		 533 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  41.48 
 
 		 558 aa  320  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  43.58 
 
 		 543 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  39.45 
 
 		 553 aa  320  5e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  39.57 
 
 		 574 aa  319  7.999999999999999e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4573  hypothetical protein  36.15 
 
 		 540 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2287  alpha amylase catalytic region  36.15 
 
 		 540 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2299  alpha amylase catalytic region  36.15 
 
 		 540 aa  319  9e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.823743 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  42.61 
 
 		 544 aa  319  9e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  40.15 
 
 		 544 aa  319  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  43.68 
 
 		 634 aa  318  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  36.15 
 
 		 540 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  41.13 
 
 		 557 aa  319  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  41.39 
 
 		 560 aa  318  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  38.84 
 
 		 555 aa  317  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  42 
 
 		 567 aa  317  4e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  39.21 
 
 		 550 aa  317  4e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  37.83 
 
 		 568 aa  317  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  40.78 
 
 		 511 aa  316  6e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2086  alpha amylase catalytic region  35.76 
 
 		 540 aa  316  7e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  42.39 
 
 		 531 aa  315  9e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  38.03 
 
 		 575 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  41.41 
 
 		 543 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  42.94 
 
 		 555 aa  314  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  39.57 
 
 		 570 aa  313  4.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  35.4 
 
 		 530 aa  313  5.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  40.56 
 
 		 566 aa  312  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2954  alpha amylase catalytic region  39.05 
 
 		 549 aa  312  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067439 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  39.41 
 
 		 536 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  37.21 
 
 		 556 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  39.22 
 
 		 536 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  39.02 
 
 		 536 aa  310  5e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4341  alpha amylase catalytic region  36.88 
 
 		 539 aa  310  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  40.58 
 
 		 549 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0295  alpha amylase catalytic region  39.11 
 
 		 551 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  41.11 
 
 		 518 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  40.73 
 
 		 539 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  39.56 
 
 		 576 aa  308  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  39.22 
 
 		 565 aa  307  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1788  alpha amylase, catalytic region  35.19 
 
 		 544 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  36.76 
 
 		 541 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3326  alpha amylase catalytic region  37.43 
 
 		 547 aa  306  6e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  42.13 
 
 		 532 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  38.6 
 
 		 547 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  42.42 
 
 		 507 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  36.2 
 
 		 538 aa  304  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  37.18 
 
 		 564 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  36.96 
 
 		 552 aa  303  6.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2028  alpha amylase, catalytic region  35.07 
 
 		 557 aa  302  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>