More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08990 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  56.73 
 
 		 605 aa  642    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  64.92 
 
 		 571 aa  679    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  62.81 
 
 		 567 aa  674    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  62.03 
 
 		 566 aa  670    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  57 
 
 		 593 aa  642    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  100 
 
 		 570 aa  1150    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  63.05 
 
 		 599 aa  615  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  62.31 
 
 		 546 aa  605  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  56.65 
 
 		 563 aa  599  1e-170  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  57.88 
 
 		 534 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  53.99 
 
 		 607 aa  571  1e-161  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  55.34 
 
 		 576 aa  571  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  56.47 
 
 		 565 aa  565  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  53.94 
 
 		 609 aa  565  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  54.89 
 
 		 540 aa  553  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  54.04 
 
 		 507 aa  545  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  52.2 
 
 		 640 aa  547  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  55.22 
 
 		 538 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  53.68 
 
 		 533 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  54.36 
 
 		 522 aa  538  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  54.4 
 
 		 573 aa  528  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  52.86 
 
 		 543 aa  527  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  54.14 
 
 		 550 aa  525  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  57.03 
 
 		 538 aa  521  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  51.92 
 
 		 544 aa  520  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  53.32 
 
 		 545 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  51.85 
 
 		 560 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  53.85 
 
 		 543 aa  510  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  51.64 
 
 		 539 aa  510  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  50.62 
 
 		 568 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  51.34 
 
 		 555 aa  504  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  46.98 
 
 		 563 aa  495  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  51.43 
 
 		 560 aa  493  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  51.45 
 
 		 524 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  49.36 
 
 		 531 aa  493  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  51.06 
 
 		 561 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  50.09 
 
 		 554 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  52.51 
 
 		 555 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  50.17 
 
 		 567 aa  486  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  50.19 
 
 		 544 aa  482  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  53.89 
 
 		 511 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  48.31 
 
 		 572 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  48.13 
 
 		 570 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  49.27 
 
 		 558 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  51.32 
 
 		 560 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  49.27 
 
 		 532 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  50.28 
 
 		 512 aa  465  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  51.17 
 
 		 554 aa  462  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  49.91 
 
 		 549 aa  464  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  48.7 
 
 		 553 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  47.2 
 
 		 556 aa  458  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  49.3 
 
 		 634 aa  458  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  44.46 
 
 		 604 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  50.19 
 
 		 542 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  51.51 
 
 		 548 aa  455  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  48.6 
 
 		 539 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  46.97 
 
 		 587 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  46.55 
 
 		 546 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  48.42 
 
 		 539 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  48.42 
 
 		 539 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  45.52 
 
 		 533 aa  440  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  52.93 
 
 		 594 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  45.09 
 
 		 544 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  47.34 
 
 		 580 aa  422  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  44.99 
 
 		 561 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  49.54 
 
 		 548 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  44.55 
 
 		 543 aa  388  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  42.45 
 
 		 532 aa  365  1e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  41.68 
 
 		 525 aa  358  1.9999999999999998e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  40.32 
 
 		 540 aa  352  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  42.8 
 
 		 553 aa  349  1e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  44.27 
 
 		 529 aa  348  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  46.46 
 
 		 448 aa  346  6e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  40.62 
 
 		 533 aa  338  9.999999999999999e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  41.68 
 
 		 538 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.75 
 
 		 515 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  42.7 
 
 		 528 aa  335  9e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  42.44 
 
 		 540 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  41.73 
 
 		 536 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  41.01 
 
 		 536 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  40.75 
 
 		 535 aa  331  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  40.72 
 
 		 536 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  44.54 
 
 		 540 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  40.98 
 
 		 550 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  41.42 
 
 		 550 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  42.02 
 
 		 530 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  39.72 
 
 		 549 aa  325  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  44.21 
 
 		 537 aa  323  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  46.61 
 
 		 546 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  39.28 
 
 		 547 aa  322  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  43.55 
 
 		 538 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  39.59 
 
 		 539 aa  320  3e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  40.77 
 
 		 542 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  40.66 
 
 		 536 aa  319  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  40.75 
 
 		 735 aa  317  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  42.05 
 
 		 535 aa  316  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  42.61 
 
 		 541 aa  316  6e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  40.08 
 
 		 555 aa  315  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  40.23 
 
 		 545 aa  315  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  42.09 
 
 		 541 aa  314  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>