More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2981 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 540 aa  1090    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  58.78 
 
 		 538 aa  622  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  60.23 
 
 		 538 aa  599  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  55.45 
 
 		 560 aa  592  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  57.6 
 
 		 533 aa  586  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  57.56 
 
 		 543 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  57.67 
 
 		 550 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  57.74 
 
 		 507 aa  581  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  56.99 
 
 		 567 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  56.96 
 
 		 543 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  55.05 
 
 		 566 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  55.85 
 
 		 571 aa  568  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  56.71 
 
 		 522 aa  566  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  54.91 
 
 		 570 aa  562  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  55.89 
 
 		 545 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  58.54 
 
 		 544 aa  560  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  57.81 
 
 		 555 aa  557  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  54.24 
 
 		 565 aa  553  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  53.99 
 
 		 576 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  52.74 
 
 		 544 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  56.33 
 
 		 546 aa  542  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  51.9 
 
 		 605 aa  543  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  55.11 
 
 		 534 aa  541  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  57.36 
 
 		 511 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  54.82 
 
 		 561 aa  535  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  55.34 
 
 		 532 aa  531  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  54.24 
 
 		 558 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  52.78 
 
 		 531 aa  535  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  51.35 
 
 		 593 aa  530  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  54.26 
 
 		 512 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  51.96 
 
 		 563 aa  526  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  53.96 
 
 		 573 aa  524  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  52.35 
 
 		 587 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  53.02 
 
 		 539 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  49.12 
 
 		 568 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  53.54 
 
 		 554 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  51.9 
 
 		 553 aa  513  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  49.72 
 
 		 524 aa  509  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  52.91 
 
 		 549 aa  510  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  51.8 
 
 		 560 aa  511  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  52.5 
 
 		 567 aa  506  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  50.85 
 
 		 533 aa  502  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  51.44 
 
 		 554 aa  501  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  51.24 
 
 		 599 aa  499  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  47.79 
 
 		 607 aa  496  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  50.42 
 
 		 580 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  48.42 
 
 		 609 aa  491  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  50.57 
 
 		 548 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  46 
 
 		 563 aa  492  9.999999999999999e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  48.21 
 
 		 572 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  47.7 
 
 		 640 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  53.19 
 
 		 560 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  49.11 
 
 		 570 aa  488  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  58.01 
 
 		 594 aa  482  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  50.92 
 
 		 546 aa  481  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  52.09 
 
 		 634 aa  476  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  50.18 
 
 		 542 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  54.21 
 
 		 555 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  49.91 
 
 		 539 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  49.91 
 
 		 539 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  49.91 
 
 		 539 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  46.9 
 
 		 556 aa  451  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  48.3 
 
 		 543 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  43.09 
 
 		 604 aa  444  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  51.72 
 
 		 548 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  45.84 
 
 		 544 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  44.06 
 
 		 561 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  44.22 
 
 		 532 aa  392  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  43.74 
 
 		 525 aa  383  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  42.19 
 
 		 540 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  44.05 
 
 		 536 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.4 
 
 		 515 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  43.41 
 
 		 533 aa  361  2e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  41.39 
 
 		 549 aa  354  2.9999999999999997e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  43.24 
 
 		 518 aa  348  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  40.24 
 
 		 535 aa  347  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  42.58 
 
 		 545 aa  346  7e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  41.46 
 
 		 538 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  42.74 
 
 		 735 aa  336  5e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  42.27 
 
 		 541 aa  333  4e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  41.44 
 
 		 539 aa  331  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  44.23 
 
 		 537 aa  332  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  43.93 
 
 		 535 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  42.58 
 
 		 540 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  43.25 
 
 		 530 aa  329  7e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  41.83 
 
 		 529 aa  329  8e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  39.85 
 
 		 547 aa  329  9e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  37.32 
 
 		 564 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  37.96 
 
 		 543 aa  327  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1328  alpha amylase catalytic region  44.92 
 
 		 546 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  42.09 
 
 		 553 aa  326  6e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  45.3 
 
 		 448 aa  326  7e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  41.89 
 
 		 541 aa  326  8.000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  38.03 
 
 		 568 aa  324  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  39.63 
 
 		 555 aa  323  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  39.54 
 
 		 550 aa  323  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  40.28 
 
 		 537 aa  322  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  39.18 
 
 		 550 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  43.16 
 
 		 528 aa  320  5e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  44.83 
 
 		 540 aa  320  6e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>