More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3483 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3483  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 542 aa  1068    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906486  normal  0.657022 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  68.12 
 
 		 547 aa  705    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  52.65 
 
 		 538 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  52.59 
 
 		 529 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  51.6 
 
 		 545 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  51.79 
 
 		 536 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  51.49 
 
 		 541 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  48.71 
 
 		 540 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  50.84 
 
 		 541 aa  509  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  50.19 
 
 		 538 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  47.05 
 
 		 553 aa  504  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  50.28 
 
 		 540 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  50.86 
 
 		 528 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  50.47 
 
 		 532 aa  496  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  47.06 
 
 		 535 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  46.2 
 
 		 543 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  51.41 
 
 		 542 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  50 
 
 		 539 aa  481  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  47.36 
 
 		 525 aa  477  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  47.89 
 
 		 540 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  51.72 
 
 		 530 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  49.26 
 
 		 546 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  49.9 
 
 		 542 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  51.06 
 
 		 535 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  48.04 
 
 		 533 aa  457  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  51.34 
 
 		 448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  46.36 
 
 		 524 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  45.23 
 
 		 537 aa  433  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  44.51 
 
 		 549 aa  426  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  42.98 
 
 		 574 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  43.33 
 
 		 575 aa  391  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  44.77 
 
 		 518 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1251  Alpha amylase, catalytic region  37.28 
 
 		 561 aa  372  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  38.45 
 
 		 540 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  37.74 
 
 		 540 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  36.79 
 
 		 586 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  38.33 
 
 		 550 aa  365  1e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  40.46 
 
 		 536 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2133  alpha amylase, catalytic region  38.45 
 
 		 540 aa  365  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4573  hypothetical protein  37.35 
 
 		 540 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2287  alpha amylase catalytic region  37.35 
 
 		 540 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2299  alpha amylase catalytic region  37.35 
 
 		 540 aa  364  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.823743 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  36.99 
 
 		 541 aa  363  4e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2086  alpha amylase catalytic region  37.16 
 
 		 540 aa  362  8e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  40.08 
 
 		 536 aa  362  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  39.52 
 
 		 568 aa  361  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  40.41 
 
 		 537 aa  360  3e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  39.21 
 
 		 537 aa  360  5e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  36.99 
 
 		 540 aa  359  9e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2311  alpha amylase, catalytic region  37.6 
 
 		 540 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.679266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1788  alpha amylase, catalytic region  36.27 
 
 		 544 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  37.84 
 
 		 556 aa  353  4e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4341  alpha amylase catalytic region  37.67 
 
 		 539 aa  353  5e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  40 
 
 		 536 aa  352  7e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  38.33 
 
 		 564 aa  351  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  37.76 
 
 		 548 aa  349  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  37.6 
 
 		 553 aa  349  9e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  37.15 
 
 		 552 aa  348  1e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  37.25 
 
 		 555 aa  348  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  36.99 
 
 		 548 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  34.84 
 
 		 554 aa  347  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  35.86 
 
 		 544 aa  347  5e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  39.76 
 
 		 547 aa  346  6e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  36.36 
 
 		 540 aa  344  2.9999999999999997e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.18 
 
 		 515 aa  342  9e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  37.17 
 
 		 556 aa  342  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  35.6 
 
 		 554 aa  339  7e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  34.89 
 
 		 541 aa  339  7e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  34.7 
 
 		 549 aa  339  8e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  34.7 
 
 		 549 aa  339  8e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2028  alpha amylase, catalytic region  35.39 
 
 		 557 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  40.7 
 
 		 540 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  37.04 
 
 		 550 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  35.81 
 
 		 530 aa  337  3.9999999999999995e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  34.22 
 
 		 563 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2954  alpha amylase catalytic region  38.52 
 
 		 549 aa  335  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  37.22 
 
 		 550 aa  335  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  35.57 
 
 		 538 aa  333  3e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  37.48 
 
 		 550 aa  333  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  34.33 
 
 		 568 aa  333  5e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  33.39 
 
 		 554 aa  332  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  35.45 
 
 		 563 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  32.57 
 
 		 560 aa  331  2e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  33.21 
 
 		 554 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3326  alpha amylase catalytic region  36.6 
 
 		 547 aa  331  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  36.58 
 
 		 555 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  32.92 
 
 		 562 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  35.09 
 
 		 600 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  33.57 
 
 		 557 aa  327  3e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  35.7 
 
 		 582 aa  327  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  32.27 
 
 		 558 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1328  alpha amylase catalytic region  41.8 
 
 		 546 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  33.04 
 
 		 563 aa  326  6e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  37.5 
 
 		 543 aa  326  8.000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0184  alpha amylase, catalytic region  40.94 
 
 		 547 aa  325  9e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  40.96 
 
 		 557 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  34.3 
 
 		 551 aa  324  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  34.37 
 
 		 554 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  34.37 
 
 		 554 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  34.37 
 
 		 554 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>