More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0745 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  64.46 
 
 		 538 aa  639    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 543 aa  1092    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  87.29 
 
 		 543 aa  949    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  62.08 
 
 		 538 aa  634  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  63.33 
 
 		 550 aa  625  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  59.62 
 
 		 507 aa  615  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  59.89 
 
 		 545 aa  616  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  59.81 
 
 		 533 aa  613  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  61.99 
 
 		 522 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  61.75 
 
 		 555 aa  601  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  60.71 
 
 		 544 aa  600  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  56.96 
 
 		 540 aa  580  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  56.01 
 
 		 567 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  55.43 
 
 		 566 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  55.63 
 
 		 571 aa  567  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  58.77 
 
 		 546 aa  564  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  54 
 
 		 563 aa  555  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  50.75 
 
 		 605 aa  553  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  53.6 
 
 		 524 aa  550  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  52.35 
 
 		 560 aa  548  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  54.92 
 
 		 534 aa  545  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  57.12 
 
 		 511 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  53.45 
 
 		 531 aa  538  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  51.69 
 
 		 576 aa  537  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  49.74 
 
 		 593 aa  537  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  53.85 
 
 		 570 aa  534  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  53.87 
 
 		 549 aa  529  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  50.54 
 
 		 544 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  53.73 
 
 		 565 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  55.06 
 
 		 532 aa  521  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  53.41 
 
 		 561 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  52.13 
 
 		 554 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  52.38 
 
 		 512 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  51.75 
 
 		 553 aa  508  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  51.24 
 
 		 558 aa  508  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  53.5 
 
 		 607 aa  504  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  50.52 
 
 		 567 aa  502  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  50.47 
 
 		 533 aa  499  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  51.42 
 
 		 599 aa  501  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  51.19 
 
 		 609 aa  496  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  46.97 
 
 		 568 aa  498  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  50.81 
 
 		 539 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  57.27 
 
 		 555 aa  490  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  49.07 
 
 		 587 aa  482  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  51.22 
 
 		 634 aa  484  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  50.36 
 
 		 554 aa  479  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  48.84 
 
 		 640 aa  480  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  46.06 
 
 		 563 aa  476  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  51.42 
 
 		 543 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  51.33 
 
 		 594 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  47.53 
 
 		 548 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  48.54 
 
 		 546 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  47.43 
 
 		 572 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  46.11 
 
 		 570 aa  467  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  48.96 
 
 		 560 aa  468  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  50.83 
 
 		 539 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  50.83 
 
 		 539 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  43.7 
 
 		 604 aa  461  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  50.83 
 
 		 539 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  51.4 
 
 		 573 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  48.73 
 
 		 542 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  47.36 
 
 		 544 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  47.05 
 
 		 580 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  48.75 
 
 		 560 aa  442  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  46.43 
 
 		 561 aa  438  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  45.36 
 
 		 556 aa  426  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  50.18 
 
 		 548 aa  419  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  40.42 
 
 		 525 aa  363  3e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  40.75 
 
 		 532 aa  355  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  40.83 
 
 		 555 aa  351  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  39.7 
 
 		 553 aa  348  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  42.83 
 
 		 547 aa  348  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  42.11 
 
 		 541 aa  342  9e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  41.19 
 
 		 540 aa  342  9e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  41.58 
 
 		 543 aa  342  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  38.68 
 
 		 544 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  41.29 
 
 		 548 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  41.19 
 
 		 529 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  41.32 
 
 		 541 aa  336  7e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  39.96 
 
 		 535 aa  336  7e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  40.6 
 
 		 533 aa  335  1e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  39.6 
 
 		 548 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  38.66 
 
 		 543 aa  332  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  38.16 
 
 		 550 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  37.77 
 
 		 550 aa  330  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  43.69 
 
 		 537 aa  329  8e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.05 
 
 		 515 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  41.89 
 
 		 518 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  40.5 
 
 		 537 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  40.56 
 
 		 539 aa  327  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  40.15 
 
 		 540 aa  326  7e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  40.19 
 
 		 536 aa  326  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  41.43 
 
 		 553 aa  325  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  41 
 
 		 549 aa  325  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  39.81 
 
 		 536 aa  324  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  38.84 
 
 		 550 aa  322  9.999999999999999e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  38.79 
 
 		 550 aa  321  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  43.35 
 
 		 530 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  40.67 
 
 		 557 aa  317  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  42.03 
 
 		 528 aa  317  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>