More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2111 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  67.99 
 
 		 550 aa  696    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  67.59 
 
 		 538 aa  692    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  62.31 
 
 		 545 aa  646    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  63.09 
 
 		 522 aa  642    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  67.96 
 
 		 538 aa  731    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 555 aa  1107    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  61.28 
 
 		 544 aa  621  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  62.31 
 
 		 543 aa  618  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  61.75 
 
 		 543 aa  616  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  58.61 
 
 		 533 aa  616  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  57.71 
 
 		 507 aa  587  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  55.18 
 
 		 566 aa  585  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  57.4 
 
 		 540 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  56.25 
 
 		 567 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  52.84 
 
 		 560 aa  564  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  55.78 
 
 		 531 aa  561  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  53.13 
 
 		 558 aa  549  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  52.28 
 
 		 605 aa  549  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  55.37 
 
 		 524 aa  546  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  51.52 
 
 		 593 aa  545  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  54.45 
 
 		 571 aa  542  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  53.03 
 
 		 563 aa  541  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  53.25 
 
 		 553 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  51.92 
 
 		 544 aa  536  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  54.61 
 
 		 549 aa  536  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  57.12 
 
 		 511 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  55.84 
 
 		 532 aa  529  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  52.2 
 
 		 576 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  51.93 
 
 		 533 aa  521  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  51.92 
 
 		 570 aa  523  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  54.94 
 
 		 554 aa  524  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  54.79 
 
 		 546 aa  518  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  50.08 
 
 		 607 aa  518  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  51.26 
 
 		 554 aa  519  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  54.51 
 
 		 561 aa  521  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  51.57 
 
 		 565 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  51.65 
 
 		 609 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  51.78 
 
 		 587 aa  517  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  51.93 
 
 		 534 aa  512  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  54.41 
 
 		 539 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  54.41 
 
 		 539 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  54.22 
 
 		 539 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  52.01 
 
 		 512 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  53.93 
 
 		 599 aa  506  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  50.75 
 
 		 640 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  52.19 
 
 		 548 aa  502  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  48.4 
 
 		 568 aa  504  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  50.36 
 
 		 539 aa  496  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  51.63 
 
 		 542 aa  495  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  48.55 
 
 		 572 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  49.29 
 
 		 570 aa  490  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  49.73 
 
 		 560 aa  487  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  51.52 
 
 		 546 aa  484  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  52.69 
 
 		 634 aa  483  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  49.3 
 
 		 580 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  50.53 
 
 		 567 aa  481  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  51.53 
 
 		 573 aa  479  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  51.03 
 
 		 594 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  55.03 
 
 		 555 aa  464  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  48.22 
 
 		 561 aa  450  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  43.84 
 
 		 563 aa  442  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  46.65 
 
 		 556 aa  441  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  48.46 
 
 		 544 aa  436  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  43.8 
 
 		 604 aa  433  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  49.91 
 
 		 543 aa  434  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  48.64 
 
 		 560 aa  430  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  50.82 
 
 		 548 aa  428  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  42.35 
 
 		 532 aa  371  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  40.27 
 
 		 525 aa  354  2.9999999999999997e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  42.04 
 
 		 535 aa  349  9e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.68 
 
 		 515 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  42.48 
 
 		 539 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  39.89 
 
 		 540 aa  343  4e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  41.14 
 
 		 547 aa  343  5.999999999999999e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  39.53 
 
 		 553 aa  342  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  40.77 
 
 		 555 aa  340  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  41.36 
 
 		 543 aa  339  7e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  41.21 
 
 		 549 aa  339  7e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  42.35 
 
 		 536 aa  336  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  40.65 
 
 		 537 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  37.99 
 
 		 543 aa  333  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  41.92 
 
 		 735 aa  331  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  41.83 
 
 		 538 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  41.04 
 
 		 529 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  42.59 
 
 		 557 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  38.98 
 
 		 530 aa  329  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  39.03 
 
 		 550 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  38.45 
 
 		 548 aa  326  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3326  alpha amylase catalytic region  40.08 
 
 		 547 aa  325  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  38.55 
 
 		 541 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  42.37 
 
 		 533 aa  325  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  39.92 
 
 		 556 aa  325  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  42.7 
 
 		 541 aa  324  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  38.21 
 
 		 544 aa  323  4e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  44.04 
 
 		 448 aa  323  6e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  38.72 
 
 		 550 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  40.37 
 
 		 553 aa  320  5e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  41.61 
 
 		 541 aa  319  9e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  39.46 
 
 		 568 aa  317  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  40.46 
 
 		 537 aa  318  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>