More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0984 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  56.09 
 
 		 541 aa  645    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  100 
 
 		 538 aa  1120    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  64.5 
 
 		 540 aa  739    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  63.5 
 
 		 537 aa  719    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  63.31 
 
 		 540 aa  717    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2028  alpha amylase, catalytic region  63.64 
 
 		 557 aa  734    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2133  alpha amylase, catalytic region  64.87 
 
 		 540 aa  746    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  65.06 
 
 		 540 aa  749    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1788  alpha amylase, catalytic region  65.43 
 
 		 544 aa  743    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2299  alpha amylase catalytic region  66.17 
 
 		 540 aa  761    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.823743 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2086  alpha amylase catalytic region  65.99 
 
 		 540 aa  758    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2311  alpha amylase, catalytic region  64.68 
 
 		 540 aa  753    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.679266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  62.15 
 
 		 544 aa  713    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  65.99 
 
 		 540 aa  761    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4573  hypothetical protein  65.99 
 
 		 540 aa  758    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  66.23 
 
 		 586 aa  775    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2287  alpha amylase catalytic region  65.99 
 
 		 540 aa  758    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  67.04 
 
 		 541 aa  762    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  55.95 
 
 		 537 aa  634  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3326  alpha amylase catalytic region  53.32 
 
 		 547 aa  617  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  55.17 
 
 		 555 aa  613  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  53.6 
 
 		 550 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  53.6 
 
 		 550 aa  611  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  54.76 
 
 		 557 aa  608  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2620  alpha amylase catalytic region  53.18 
 
 		 560 aa  607  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  51.38 
 
 		 556 aa  605  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4341  alpha amylase catalytic region  54.55 
 
 		 539 aa  603  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3128  alpha amylase, catalytic region  59.68 
 
 		 542 aa  599  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209805  normal  0.0115348 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  52.87 
 
 		 550 aa  588  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  55.47 
 
 		 547 aa  590  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  55.95 
 
 		 550 aa  587  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  56.25 
 
 		 548 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  55.51 
 
 		 552 aa  579  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  53.28 
 
 		 548 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0295  alpha amylase catalytic region  52.5 
 
 		 551 aa  569  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  53.92 
 
 		 553 aa  556  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  53.94 
 
 		 530 aa  551  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  49.1 
 
 		 536 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  50.7 
 
 		 540 aa  530  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  48.72 
 
 		 536 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  48.53 
 
 		 536 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  49.8 
 
 		 543 aa  520  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3112  alpha amylase protein  47.32 
 
 		 535 aa  511  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.364914  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1891  alpha amylase, catalytic region  46.83 
 
 		 544 aa  499  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687574  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0184  alpha amylase, catalytic region  46.69 
 
 		 547 aa  495  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2954  alpha amylase catalytic region  48.58 
 
 		 549 aa  488  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067439 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  40.82 
 
 		 549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  41.21 
 
 		 543 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  42.1 
 
 		 525 aa  398  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  39.92 
 
 		 540 aa  398  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  41.83 
 
 		 538 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  40.57 
 
 		 553 aa  393  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  40.92 
 
 		 538 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  41.3 
 
 		 540 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  41.9 
 
 		 529 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  39.52 
 
 		 568 aa  386  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  41.06 
 
 		 535 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  40.79 
 
 		 533 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  41.2 
 
 		 530 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  40.93 
 
 		 541 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  38.03 
 
 		 545 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  40.62 
 
 		 532 aa  375  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  41.99 
 
 		 542 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  38.62 
 
 		 564 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  40.41 
 
 		 537 aa  373  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  39.35 
 
 		 541 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  38.06 
 
 		 539 aa  361  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2294  Alpha amylase, catalytic region  41.2 
 
 		 542 aa  361  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  39.55 
 
 		 535 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  39.14 
 
 		 540 aa  359  6e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  39.68 
 
 		 524 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  36.7 
 
 		 536 aa  356  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  37.17 
 
 		 574 aa  353  4e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  39.96 
 
 		 515 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  41.83 
 
 		 448 aa  352  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  39.25 
 
 		 546 aa  351  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  37.52 
 
 		 575 aa  350  4e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  37.4 
 
 		 547 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1251  Alpha amylase, catalytic region  37.45 
 
 		 561 aa  345  8.999999999999999e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  39.8 
 
 		 528 aa  342  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3898  alpha amylase catalytic region  39.48 
 
 		 526 aa  340  5e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.237178 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  35.94 
 
 		 562 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  36.4 
 
 		 557 aa  330  3e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  35.45 
 
 		 518 aa  330  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  37.26 
 
 		 556 aa  328  1.0000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  38.99 
 
 		 522 aa  323  5e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  36.28 
 
 		 554 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  36.96 
 
 		 577 aa  320  5e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  34.43 
 
 		 559 aa  318  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  35.66 
 
 		 554 aa  319  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  37.08 
 
 		 556 aa  317  2e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  38.37 
 
 		 587 aa  317  5e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  38.22 
 
 		 578 aa  316  5e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  36.6 
 
 		 556 aa  317  5e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  36.45 
 
 		 556 aa  315  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  35.88 
 
 		 606 aa  315  9.999999999999999e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  35.35 
 
 		 558 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  35.65 
 
 		 563 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  34.49 
 
 		 563 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  36.35 
 
 		 582 aa  314  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>